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杨玉颖

作品数:19 被引量:99H指数:6
供职机构:上海市疾病预防控制中心更多>>
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相关领域:医药卫生环境科学与工程更多>>

文献类型

  • 19篇中文期刊文章

领域

  • 19篇医药卫生
  • 1篇环境科学与工...

主题

  • 16篇病毒
  • 7篇基因
  • 6篇基因型
  • 5篇疫苗
  • 5篇麻疹
  • 4篇麻疹病
  • 4篇麻疹病毒
  • 4篇抗体
  • 4篇基因特征
  • 4篇脊髓灰质炎
  • 3篇带状疱疹
  • 3篇带状疱疹病毒
  • 3篇水痘
  • 3篇水痘-带状疱...
  • 3篇疱疹
  • 3篇基因特征分析
  • 3篇风疹
  • 3篇肠道
  • 3篇肠道病毒
  • 2篇毒株

机构

  • 19篇上海市疾病预...
  • 7篇中国疾病预防...
  • 4篇上海市嘉定区...
  • 4篇上海市闵行区...
  • 3篇上海交通大学
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  • 2篇上海市虹口区...
  • 1篇大连医科大学
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  • 1篇上海市青浦区...
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作者

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  • 7篇陆菁
  • 7篇孙晓冬
  • 7篇唐伟
  • 5篇许文波
  • 4篇胡家瑜
  • 4篇费洁
  • 4篇王静
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  • 3篇朱贞
  • 3篇张曦
  • 3篇刘敏勇
  • 3篇汤素文
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  • 2篇杨建萍
  • 2篇王嘉瑜
  • 2篇刘景壹

传媒

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  • 3篇病毒学报
  • 3篇微生物与感染
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年份

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  • 2篇2012
19 条 记 录,以下是 1-10
排序方式:
上海市环境污水监测埃可病毒11型基因特征和循环动态被引量:2
2020年
目的探讨基于上海市环境污水监测中埃可病毒11型(echovirus 11,Echo11)的基因特征和循环动态变化。方法本研究对上海市2012—2019年环境污水监测获得的Echo11分离株进行了VP1区核酸扩增和序列测定,结合上海市急性弛缓性麻痹(acute flaccid paralysis,AFP)监测系统和健康儿童肠道病毒监测中Echo11分离株以及Echo11参考株进行序列同源性分析和系统发生学分析。结果上海市3个监测系统来源Echo11分离株共有156株,其中2012—2019年环境污水共分离到136株,其流行高峰主要集中在夏秋季。上海市不同来源Echo11分离株进化速度较快,有40.3%存在第54位氨基酸位点突变。上海市不同来源Echo11共有5个基因亚型传播链,即A1、A2、C1、C3和D5基因亚型。2012年,环境污水、AFP病例和健康儿童之间存在A1基因亚型Echo11共循环现象。2012—2015年的优势传播链为A1基因亚型,从2016年开始,优势传播链逐渐变为D5基因亚型。结论环境污水监测真实反映人类肠道病毒(human enterovirus,HEV)的循环状况,对于HEV相关疾病预测预警具有实际意义。
李云逸陆菁杨玉颖费洁张莉萍李智胡家瑜李崇山
关键词:基因特征
2015-2018年上海市环境污水中非脊髓灰质炎肠道病毒的分布及柯萨奇病毒B5的分子特征被引量:6
2019年
目的分析2015-2018年上海市闵行区和嘉定区环境污水监测中非脊髓灰质炎肠道病毒(NPEV)的分布特征,探讨环境污水、健康儿童和急性弛缓性麻痹(AFP)病例监测中柯萨奇病毒B组5型(Cox B5)分离株之间的关系和变迁规律。方法选择上海市闵行区和嘉定区污水处理厂作为长期固定监测点,每月采集监测点的污水进行浓缩富集,取上清液并接种于人横纹肌肉瘤细胞(RD)和人喉癌上皮细胞(Hep-2)进行病毒分离。通过反转录–聚合酶链式反应(RT-PCR)获得VP1区序列并进行分析。结果 2015-2018年共采集污水样本84份,共分离242株NPEV,包含19个基因型,Cox B5为比例较高的基因型,占18.18%(44/242)。2015-2018年,环境污水、健康儿童和AFP病例监测中的Cox B5分离株形成2个基因型和3个传播链,即C3、C4和D3基因亚型。C3基因亚型在上海市属于优势基因亚型,而D3基因亚型是2016-2018年新出现的传播链。结论 2015-2018年上海市2个区环境污水中常见的优势基因型为ECHO11、Cox B5、Cox B3和ECHO6。Cox B5在环境污水、健康儿童和AFP病例中存在共循环现象。我国尚未建立完善的NPEV相关疾病监测系统,环境污水监测可作为病例监测的重要补充方法。
李云逸陆菁杨玉颖费洁张莉萍李智胡家瑜李崇山
关键词:非脊髓灰质炎肠道病毒环境污水
上海市2011-2017年风疹病毒基因特征分析被引量:3
2018年
目的分析2011—2017年上海市风疹病毒(rubella virus,RV)野毒流行株的分子流行病学特征。方法选择2011—2017年上海市报告疑似麻疹/风疹病例中经实验室诊断排除麻疹,确定为风疹病例所对应的咽拭子标本进行RV分离,用一步法逆转录-聚合酶链式反应(reverse transcription polymerase chain reaction,RT-PCR)扩增病毒E1基因,扩增产物进行核苷酸序列测定,并进行分子流行病学分析。结果684份咽拭子标本共分离到395株RV,获得其中377株RV的739个核苷酸(nucleotide,nt)(nt8731~9469)序列。序列同源性分析表明,377株RV分离株分别属于两个不同的基因型,109株为1E基因型,与来自中国的参考株(RVi/Shandong.CHN/0.02/)亲缘性关系更近,其他分离株均为2B基因型,5株分离株在2B基因型中成一个独立小分支。377株RV分离株大部分的核苷酸突变为无义突变,氨基酸(aminoacid,aa)序列高度保守,除1株外所有1E基因型RV分离株在E1蛋白aa338位点发生相同突变(亮氨酸→苯丙氨酸),而2B基因型分离株以及其他基因型WHO参考株在该位点均未发生改变。结论2011—2017年上海市存在两种不同基因型RV流行,其中2011—2013年1E基因型为优势基因型。继2011年首次监测到2B基因型RV后,便持续存在流行,并自2014年起成为上海市的优势基因型。
杨玉颖杨玉颖王静唐伟朱贞李云逸王嘉瑜李崇山
关键词:风疹病毒
上海市2010—2020年健康人群麻疹和风疹及流行性腮腺炎病毒抗体水平研究被引量:7
2022年
目的了解2010—2020年上海市健康人群麻疹、风疹及流行性腮腺炎(流腮)病毒的血清IgG抗体水平,分析不同年龄组人群的抗体变化趋势。方法于2010年1月至2020年12月,将上海市10828名未患麻疹、风疹和流腮的健康人群纳入研究,分为0~7月龄、8~11月龄、1~2、3~4、5~6、7~9、10~14、15~19、20~29、30~39、40~49、50岁及以上12个年龄组。采集血清样本后,采用ELISA法检测血清中麻疹、风疹及流腮病毒IgG抗体水平,并分析抗体阳性率和抗体水平的差异。结果10828名对象年龄M(Q1,Q3)为8岁(9月龄,20岁);男性占48.34%(5234/10828),女性占50.92%(5514/10828),性别信息不详者占0.74%(80/10828);MMR免疫史不详者占27.03%(2927/10828)。10828名对象麻疹、风疹及流腮病毒IgG抗体总阳性率分别为76.78%、64.46%和64.29%,各年份麻疹、风疹及流腮病毒血清IgG抗体阳性率差异均有统计学意义(χ^(2)_(麻疹)=1049.50,P<0.001;χ^(2)_(风疹)=1103.11,P<0.001;χ^(2)_(流腮)=782.59,P<0.001)。麻疹、风疹及流腮病毒IgG抗体GMC分别为541.45 mIU/ml、31.76 IU/ml和133.73 U/ml,各年份麻疹、风疹及流腮病毒血清IgG抗体GMC差异均具有统计学意义(F麻疹=180.74,P<0.001;F风疹=189.95,P<0.001;F_(流腮)=122.40,P<0.001)。麻疹病毒抗体阳性率总体高于风疹和流腮病毒的阳性率,差异具有统计学意义(χ^(2)=518.09,P<0.001)。结论上海市健康人群麻疹病毒IgG抗体水平较高,风疹和流腮病毒IgG抗体水平略低。
杨玉颖汤素文唐伟范佳磊李智杨佳炜任佳李崇山
关键词:麻疹风疹流行性腮腺炎抗体
杂交探针技术结合熔解曲线快速鉴别水痘-带状疱疹病毒野毒株/疫苗株被引量:1
2013年
目的利用杂交探针结合熔解曲线分析技术,建立一种快速、可靠的适用于鉴别水痘一带状疱疹病毒(Varicella—zosterVirus,VZV)野毒株与疫苗株的方法。方法采集临床诊断为水痘患者的水疱液并进行病毒分离,抽提阳性分离物和部分阳性水疱液的基因组脱氧核糖核酸(DeoxyribonucleicAcid,DNA)。以荧光素Cy5.5标记检测探针5端,相应的锚定探针在3端用FAM羧基荧光索标记,再从研究对象基因组DNA中用聚合酶链反应(PolymeraseChainReac—tion,PCR)特异引物扩增ORF62基因中301碱基对(basepair,bp)片段,将其与特异探针杂交后,引发荧光共振能量转移,通过罗氏LightCycler实时PCR仪描绘扩增的目标DNA片段的熔解曲线,根据熔解温度(MeltingTemperature,Tm)峰值对待测标本进行鉴别。最后,用限制性片段长度多态性(RestrictionFragmentLengthPolymorphism,RFLP)方法验证杂交探针结合熔解曲线鉴别野毒株/疫苗株的准确性。结果VZVOka疫苗株的扩增产物与检测探针的Tm为52.47℃,而水痘原始临床标本/临床分离株与检测探针的Tm在57.33℃~60.50℃。通过检测DNA扩增产物与VzVORF62探针Tm的差异可以明确鉴别VZV野毒株和疫苗株。利用杂交探针技术结合熔解曲线的方法对水痘原始临床标本及分离株进行野毒株/疫苗株的鉴别结果与传统的RFLP方法进行鉴别的结果完全一致。结论杂交探针技术结合熔解曲线操作简便省时,不易交叉污染;获得的病毒野毒株/疫苗株特征性强,适用于VZV野毒株/疫苗株在临床和流行病学调查中的快速鉴别诊断。
王静刘景壹杨玉颖应颖吴强松陆菁李崇山孙晓冬
关键词:水痘-带状疱疹病毒荧光共振能量转移熔解曲线聚合酶链反应-限制性片段长度多态性
上海市部分地区健康人群水痘-带状疱疹病毒抗体水平调查被引量:15
2012年
目的了解上海市部分地区健康人群水痘抗体水平。方法采集1~40岁健康人群血清标本2001份,采用酶联免疫吸附试验定量检测水痘IgG抗体。结果人群血清中水痘抗体阳性率为57.57%,几何平均浓度(Geometricmean concentration,GMC)为171.15 mIU/ml。8个年龄组抗体阳性率及浓度总体上呈随年龄增长而上升的趋势,18岁以下各年龄组的阳性率为41.90%~66.45%、GMC为77.23~269.59 mIU/ml,19~29岁组阳性率为85.12%、GMC为610.06 mIU/ml,30~40岁组阳性率达到96.25%、GMC为953.30 mIU/ml。不同年龄组市区和郊区人群水痘抗体阳性率及浓度差异有统计学意义,郊区1~3岁年龄组阳性率及抗体浓度显著高于市区同年龄儿童。接种过水痘疫苗人群GMC为178.55 mIU/ml,未接种人群GMC为76.74 mIU/ml,二者差异有统计学意义。结论 1~6岁儿童是水痘的易感人群,应该重点关注这一年龄段儿童水痘疫苗接种工作,建议我国能够采取2剂次水痘疫苗的免疫策略。
杨玉颖汤素文刘景壹李智陆红梅陈文花吴强松郭翔李崇山孙晓冬许文波
关键词:水痘抗体水平
2013-2014年上海市污水中人类肠道病毒的基因型分布被引量:4
2017年
目的 分析上海市闵行和嘉定区污水处理厂中人类肠道病毒(HEV)的时间分布特点及其基因分型。方法 于2013—2014年,选取闵行和嘉定区两所污水处理厂入水口作为采样点,每月24—28日采集污水标本1份,每份1 L,共48份。经阴离子膜吸附的方法浓缩,再用牛肉汤洗脱,取上清液并接种RD、HEp-2和L20B细胞进行病毒分离,共分离HEV 249株,其中非脊髓灰质炎病毒(NPEV)185株,脊髓灰质炎病毒(PV)64株(均为疫苗相关株)。通过RT-PCR鉴定基因型,采用Bioedit 7.0.0对VP1核苷酸序列进行序列同源性分析,使用MEGA 5.0软件,通过邻位法构建系统发生树,分析优势株及病毒传播链。结果 185株NPEV中178株鉴定出基因型,包括:柯萨奇B组病毒(CVB)2、3、5基因型,埃可病毒(ECHO)1、3、6、7、11、13、19、20、24、25、30基因型,柯萨奇A组病毒(CVA)4基因型。CVB5和ECHO6是在NPEV分离株中比例较高的两个基因型,分别占33.5%(56株)和24.9%(43株)。闵行区污水水样中HEV分离株主要集中在4—9月份,其中优势株ECHO6主要分布在2013下半年和2014上半年采集水样中,优势株CVB5主要在2013—2014年散在分布。嘉定的ECHO6和CVB5两个优势株的流行趋势与闵行区的基本一致。2013—2014年CVB5形成C6和C8基因亚型2个传播链,而与国外毒株有较大的差异;ECHO6形成C3、C6和D9基因亚型3个传播链,而D9基因亚型在上海属于优势基因亚型,在国内外有一定地域性的传播。结论 2013—2014年上海市污水中的分离到的PV均为疫苗株。HEV优势株为CVB5和ECHO6,其中ECHO6在2013下半年和2014上半年较为流行,CVB5在2014年下半年开始流行。CVB5和ECHO6存在多条传播链的共同流行现象。
李云逸陆菁王秀芝杨玉颖费洁张莉萍李智李崇山左勇
关键词:肠道病毒属柯萨奇病毒感染环境监测
2018年上海市一起D8基因型麻疹病毒引起的输入性麻疹暴发报告被引量:6
2019年
目的追踪2018年上海市一起输入性麻疹暴发的来源,并分析其病毒分子流行病学特征。方法直接从临床咽拭子标本中提取病毒核酸,采用一步法反转录–聚合酶链式反应,扩增麻疹病毒核蛋白基因COOH末端676个核苷酸,然后对扩增产物进行核苷酸序列测定,并分析其同源性,以确定病毒基因型及其可能的来源。结果本次暴发病例来自于同一家庭,且2例成年人病例在发病前21 d内有共同的出境旅游史;导致此次暴发的麻疹病毒为D8基因型。结论结合流行病学调查和实验室检测结果,推断此次疫情为一起D8基因型麻疹病毒引起的输入性麻疹暴发。
李崇山李智王静胡家瑜唐伟杨玉颖李云逸杨彦基崔晓娴叶玉龙张曦袁政安
关键词:麻疹病毒基因型
2015—2016年上海市脊髓灰质炎疫苗免疫策略调整前后婴儿抗体水平变化被引量:1
2020年
【目的】了解2016年上海市实施新的脊髓灰质炎疫苗免疫策略前后婴儿脊髓灰质炎抗体水平的变化情况,为免疫策略的优化提供参考。【方法】应用微量细胞中和实验检测上海市新的脊髓灰质炎疫苗免疫策略实施前后婴儿的抗体水平,并比较抗体水平的变化。【结果】新的脊髓灰质炎疫苗免疫策略实施前后分别检测67名和41名完成基础免疫的健康婴儿血清,其抗体阳性率Ⅰ型、Ⅲ型均达100%。几何平均滴度(GMT)在实施前后分别为Ⅰ型1∶1047.46和1∶254.70,Ⅲ型1∶513.52和1∶185.49。【结论】上海市实施新脊髓灰质炎疫苗免疫策略后婴儿脊灰抗体水平均维持在较高水平。
刘敏勇黄卓英陆箐杨建萍杨玉颖
关键词:脊髓灰质炎免疫疫苗抗体
2001~2011年上海市风疹病毒分子流行病学研究被引量:8
2012年
本研究对2001~2011年本实验室保存的血清标本检测结果为麻疹IgM阴性,风疹IgM阳性病例相对应的咽拭子标本进行风疹病毒(Rubella virus,RV)分离,用RT-PCR方法对细胞培养产物鉴定后扩增病毒E1基因,扩增产物用于核苷酸序列测定,并进行分子流行病学分析。结果表明,60份咽拭子标本共分离到31株RV,获得27株RV的739nt(nt8731~nt9469)核苷酸序列,系统同源性分析表明,27株RV分离株分别属于两个不同的基因型,除分离自2011年的11009株、11052株和11106株为2B基因型外,其他分离株均为1E基因型。27株RV分离株大部分的核苷酸突变为无义突变,氨基酸序列高度保守。24株1E基因型分离株中大部分毒株氨基酸序列完全一致,自2001年以来可能有来自同一传播链的RV在持续传播。本研究首次监测到2B基因型RV2011年开始在上海流行,经GenBank核苷酸序列比对发现,其与越南、日本、阿根廷等国家近几年的RV分离株核苷酸序列同源性达99%。由于以前对风疹的监测较少,尚不能证明其来源。
李崇山杨玉颖王建国朱贞唐伟李智孙晓冬许文波
关键词:风疹病毒
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