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孙帆

作品数:12 被引量:84H指数:3
供职机构:北京林业大学更多>>
发文基金:国家科技重大专项国家自然科学基金国家林业公益性行业科研专项更多>>
相关领域:农业科学生物学医药卫生更多>>

文献类型

  • 8篇期刊文章
  • 3篇专利
  • 1篇会议论文

领域

  • 6篇农业科学
  • 4篇生物学
  • 1篇医药卫生

主题

  • 4篇生物信息
  • 4篇生物信息学
  • 4篇生物信息学分...
  • 3篇蛋白
  • 3篇植物
  • 3篇胁迫
  • 3篇胁迫响应
  • 2篇植物激素
  • 2篇衰老
  • 2篇裂果
  • 2篇耐逆性
  • 2篇抗衰
  • 2篇抗衰老
  • 2篇克隆
  • 2篇编码基因
  • 1篇蛋白基因
  • 1篇调控植物
  • 1篇序列克隆
  • 1篇抑制蛋白
  • 1篇生长素

机构

  • 12篇北京林业大学
  • 2篇吉林大学

作者

  • 12篇张凌云
  • 12篇孙帆
  • 8篇李长江
  • 4篇罗朝兵
  • 3篇崔晓燕
  • 2篇曹一博
  • 2篇刘亚静
  • 1篇张世宏
  • 1篇张通
  • 1篇周燕妮

传媒

  • 2篇林业科学
  • 1篇北京林业大学...
  • 1篇生命科学研究
  • 1篇生物技术通报
  • 1篇果树学报
  • 1篇园艺学报
  • 1篇植物生理学报

年份

  • 1篇2020
  • 1篇2017
  • 1篇2015
  • 5篇2014
  • 2篇2013
  • 2篇2012
12 条 记 录,以下是 1-10
排序方式:
抗裂与易裂枣内源激素含量和细胞壁代谢相关酶活性比较被引量:28
2014年
以枣抗裂果品种‘圆铃枣’和易裂果品种‘俊枣’为材料,测定了果实生长发育曲线、果形指数及种子败育率,并对果皮、果肉、种子中内源激素含量及果皮、果肉中细胞壁代谢相关酶的活性进行了检测。结果表明,‘俊枣’果形指数和种子败育率均显著高于‘圆铃枣’。果实发育后期‘俊枣’果皮中的GA3含量、果肉中的IAA含量明显高于‘圆铃枣’,而‘圆铃枣’果肉及种子中的ABA含量高于‘俊枣’;‘俊枣’果肉及种子中(GA3+IAA+ZT)/ABA的比值在整个果实生长发育期均高于‘圆铃枣’。果实生长发育后期‘俊枣’果皮中的果胶酶及纤维素酶活性高于‘圆铃枣’,且‘俊枣’果肉中的POD及PPO活性也较高。以上结果显示,枣果实生长发育后期易裂品种‘俊枣’果肉中的IAA积累较多,而抗裂品种‘圆铃枣’果肉及种子中ABA含量显著高于易裂品种;易裂品种‘俊枣’果肉及种子中(GA3+IAA+ZT)/ABA的比值较高,果皮中的果胶酶、纤维素酶活性影响裂果的发生,其POD及PPO活性相对较高。
曹一博李长江孙帆张凌云
关键词:裂果内源激素酶活性
拟南芥AtNAC018蛋白及其编码基因在植物耐逆及抗衰老中的应用
本发明公开了拟南芥AtNAC018蛋白及其编码基因在植物耐逆及抗衰老中的应用。本发明提供了AtNACO18蛋白或其编码基因的应用,为如下(a1)和/或(a2):(a1)调控植物耐逆性;(a2)调控植物衰老过程;所述AtN...
张凌云罗朝兵孙帆张鹤华
文献传递
青杄PsbO基因cDNA序列克隆及生物信息学分析被引量:1
2012年
利用RACE技术从已有的青杄均一化cDNA文库中克隆得到青杄(Picea wilsonii)PsbO基因cDNA的全长,并用生物信息学的方法对该cDNA的核苷酸序列、氨基酸序列的相似性,及编码蛋白PwPsbO的理化性质、亲水性/疏水性、二级和三级结构,PwPsbO基因进化树等进行了预测和分析.采用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)技术,测定了青杄不同组织中的PsbO基因的相对表达水平.结果发现:青杄PsbO基因编码346个氨基酸,预测相对分子质量为36.6 kD,理论pI值为5.29,属于可溶性蛋白.二级和三级结构预测表明其含有较多的α螺旋、β折叠和随机卷曲结构.RT-qPCR发现该基因在青杄针叶和茎中表达量最高.这些结果为青杄中PsbO基因的初步功能研究奠定了基础.
刘亚静李长江孙帆张凌云
关键词:RACE生物信息学
青杄FKBP23的克隆与组织特异性分析
FKBP (FK506 binding protein)家族是一类免疫球蛋白,能特异与免疫抑制剂FK506结合。其家族普遍含有脯氨酸顺反异构酶活性(prolyl-isomerase activity),与亲环素(cycl...
李长江孙帆张凌云
关键词:克隆RT-PCR组织特异表达
青杆PwUSP1基因的克隆及表达模式分析被引量:2
2014年
广泛逆境胁迫蛋白(universal stress protein,USP)在非生物胁迫响应中起重要作用,但在植物中其功能还大部分未知。本研究通过BLAST分析青杆EST文库,得到USP基因的EST序列,通过RACE PCR方法获取USP基因的末端序列,经过与EST序列拼接得到USP基因的cDNA全长序列,命名为PwUSP1。分析发现PwUSP1全长cDNA为1 167 bp,编码区为519bp,编码172个氨基酸残基。生物信息学分析显示,PwUSP1编码的蛋白相对分子质量为19.07 kDa,理论等电点为6.38,为非跨膜的亲水性蛋白。PwUSP1具有USP家族典型的UspA结构域和ATP结合位点G-(2X)-G-(9X)-G(S/T)。半定量RT-PCR与RT-qPCR分析表明,PwUSP1在青杆的根、茎、针叶、花粉、种子中均有表达,在根和花粉中表达量较高。同时,PwUSP1受干旱和盐胁迫的诱导表达上调,均在处理6 h后表达量较高,推测该基因可能在青杆逆境胁迫响应中发挥作用。
崔晓燕李长江孙帆张世宏张凌云
关键词:青杆生物信息学分析胁迫响应
青杄PwPSAF基因的克隆与组织表达分析被引量:5
2013年
PSAF是绿色植物光系统Ⅰ反应中心F亚基,在光合作用电子迁移过程中起着重要作用。以青杄cDNA文库为模板,根据PwPSAF的EST序列设计引物,进行5'-RACE和3'-RACE试验,以获得青杄PwPSAF的末端序列,经过与EST序列进行拼接获取青杄PwPSAF的全长cDNA序列。基于其氨基酸序列,利用Expasy tools、DNAMAN、ClustalX和MEGA等工具,进行理化性质、二级结构和三级结构的生物信息学分析。结果表明:PwPSAF是一个由253 aa组成的蛋白质,理论分子量为27.04 kDa,等电点为9.57,预测蛋白有2个跨膜区域,蛋白质的C端具有保守的结构。RT-qPCR试验显示PwPSAF主要在青杄的针叶中表达。在种子萌发过程中吸胀期(0~ 2天)表达量最高,在4天时表达量降低,随着子叶的不断长出,其表达量又逐渐增高。在干旱和盐胁迫下,针叶中的PwPSAF的表达量被大幅下调。研究结果显示PwPSAF在青杄种子萌发及非生物逆境胁迫下的光合过程中起着重要作用。
李长江孙帆张通张凌云
关键词:生物信息学分析胁迫响应
青杄生长素抑制蛋白基因PwARP-1的克隆及表达分析被引量:3
2014年
从青杄的cDNA文库中筛选出一个生长素抑制蛋白基因PwARP-1(Auxin-repressed protein 1),并通过RACE-PCR技术获得PwARP-1 cDNA全长。生物信息学分析显示,PwARP-1基因编码155个氨基酸残基的蛋白,分子量为17.1 kD,理论等电点为10.07,富含无规则卷曲。以多年生青杄和青杄幼苗为研究材料,通过RT-qPCR技术检测PwARP-1的组织特异性表达、激素的响应模式及种子萌发过程中的表达量模式。结果表明,PwARP-1在青杄各个组织中均有表达,在花粉中表达量最高,在种子中的表达量最低。PwARP-1在种子萌发过程中表达量呈先上升,在第10天表达量达到最高后开始下降。进一步试验表明,PwARP-1能响应多种逆境胁迫和激素处理。在赤霉素(GA)和生长素(IAA)处理下PwARP-1的表达量被抑制。在干旱胁迫和油菜素内酯(BR)激素处理下PwARP-1的表达量逐渐升高,而在在盐胁迫、茉莉酸甲酯(MeJA)和脱落酸(ABA)等激素处理下PwARP-1的表达量先下降后上升。这些结果显示PwARP-1可能参与了植物种子萌发、多种逆境胁迫和激素响应过程。
孙帆罗朝兵周燕妮张凌云
关键词:植物激素
青杄干旱诱导基因PwWDS1的cDNA分离与表达分析被引量:2
2014年
植物干旱诱导蛋白是植物体在遭遇干旱胁迫或缺水胁迫时被诱导表达或者表达量被上调的一类蛋白,通过直接作用或者调节其他基因的表达来使植物适应干旱逆境(Desclos et al.,2008;Urao et al.,1994)。这类蛋白在功能上分为2类:其一为功能蛋白,在细胞内直接参与保护作用。
李长江崔晓燕孙帆张凌云
关键词:WDS生物信息学分析胁迫响应
一种基于植物cDNA文库的基因全长cDNA的批量分离方法
本发明公开了一种从生物中批量分离基因全长cDNA的方法。该方法包括如下步骤:1)提取生物总RNA;2)将总RNA反转录得到双链cDNA,将所述双链cDNA与文库载体连接,连接产物转化受体菌,得到全长cDNA文库;3)将c...
张凌云李长江孙帆罗朝兵
文献传递
枣果实组织结构及果皮中矿质元素含量对裂果的影响被引量:54
2013年
【目的】研究枣果实解剖结构及果皮中矿质元素的含量与枣裂果的关系。【方法】供试材料为抗裂品种‘圆铃枣’及易裂品种‘俊枣’,从花后20 d起,每10 d采样1次。对花后80 d的果实进行浸果诱裂实验,统计裂果率。制作石蜡切片观察各时期样品的解剖结构,测定各时期样品果皮中的N、P、K、Ca、Mg及各化学形态的Ca含量。【结果】浸果诱裂实验显示,‘俊枣’裂果率显著高于‘圆铃枣’,且在浸水72 h时达到最高。果实结构观察发现,‘圆铃枣’角质膜厚度在花后80 d及90 d时显著高于‘俊枣’,各时期表皮厚度均显著高于‘俊枣’;‘圆铃枣’表皮细胞在花后70~90 d时显著小于‘俊枣’,两品种果肉细胞无显著差异。两品种各时期果皮中N、P、Mg的含量差异不显著,花后90 d及100 d时‘圆铃枣’果皮中的Ca含量明显高于‘俊枣’,且NaCl-Ca含量差异显著。【结论】枣果实表皮厚度及果皮中Ca含量与裂果密切相关,且NaCl-Ca为果皮中Ca的主要存在形态。相对于果肉细胞大小,果皮细胞排列紧密程度与裂果更相关。
曹一博孙帆刘亚静张凌云
关键词:裂果矿质元素
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