过涛
- 作品数：6 被引量：17H指数：2
- 供职机构：清华大学更多>>
- 发文基金：北京市科技计划项目国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学医药卫生电子电信更多>>
- 蛋白质亚细胞定位数据平台与结构域融合的进化研究
- 随着大规模测序计划的开展将生物信息学研究引入后基因组时代。基因功能分析和预测成为目前生物信息学研究的主要任务。为系统的研究生物大分子序列、结构和功能的关系，需要发展更先进的生物信息学研究技术和方法。
蛋白质的亚...
- 过涛
- 关键词：功能基因组
- HLA基因分型芯片检测系统
- 程京高华方李泽王栋刘彦华李丽江扬洲赵传赞兰更欣刘湘蔡斌过涛
- 该技术建立了以氨基基片为片基、以不对称PCR为样品制备方法、以TAMRA标记的Oligo为检测探针的正向杂交型HLA基因分型检测方法。通过探针设计的改进、杂交条件的优化，选出了覆盖HLA_A/B/DRB1三个基因位点上多...
- 关键词：
- 关键词：人类白细胞抗原基因分型芯片
- SARS-CoV蛋白质组的生物信息学及其进化关系被引量：8
- 2003年
- 一种新的冠状病毒SARS-CoV是引起严重急性呼吸综合征(severe acute respiratory syndrome,SARS)的病原体,对由SARS病毒全基因组序列推导出的所有蛋白质逐一进行分子量、等电点、分子消光系数等物理化学性质计算,以及跨膜区和亚细胞定位预测,辅以保守序列家族数据库搜索,预测SARS-CoV功能未知蛋白质的功能,同时,通过SARS-CoV与其他冠状病毒蛋白质同源序列比较和进化距离计算,分析SARS病毒的分类地位以及与其他冠状病毒的进化关系。结果表明,尽管SARS病毒是不同于其他3组冠状病毒的一种全新冠状病毒,但在进化关系上更靠近牛冠状病毒BoCoV和鼠肝炎病毒MHV。为实验测定SARS病毒蛋白质组以及抗SARS疫苗研制提供了参考和帮助。
- 柳树群过涛季星来孙之荣
- 关键词：生物信息学进化严重急性呼吸综合征冠状病毒
- 蛋白质亚细胞定位及其相关功能研究
- 孙之荣华苏军张松过涛
- 生物体细胞是一个高度有序的结构，胞内根据空间分布和功能不同，可以分成不同细胞器或细胞区域。新生蛋白质要定位特定的细胞部位（亚细胞器）才能发挥其生物学功能，细胞内的区域化分布能够影响到蛋白质折叠、聚合以及转录后修饰的过程，...
- 关键词：
- 关键词：亚细胞定位蛋白质生物信息学
- 基于小波分析的膜蛋白跨膜区段序列分析和预测被引量：10
- 2000年
- 膜蛋白是一类结构独特的蛋白质 ,在各种细胞中普遍存在 ,发挥着重要的生理功能。目前仅有少数膜蛋白的结构被实验测出 ,因此用计算机预测膜蛋白的结构是蛋白质结构预测的主要研究内容之一。膜蛋白一般在膜上形成保守的跨膜螺旋结构 ,序列特征明显 ,比较适合用预测的方法确定跨膜螺旋区段的位置。国际上已有一些研究者用人工神经网络方法、多序列比对方法和统计方法进行了预测尝试 ,取得了一定的成功经验。我们对蛋白质序列数据库中的膜蛋白以及包含跨膜螺旋区段的膜蛋白的序列特征进行了统计分析 ,并基于统计分析的倾向性因子采用小波分析方法预测蛋白质序列上可能的跨膜螺旋区段和跨膜螺旋区段的拓扑布局。在统计分析中 ,我们根据蛋白质与膜的拓扑关系将序列分为跨膜螺旋区、非跨膜螺旋区两个特征结构区段 ,分别统计了氨基酸残基在这些区段中的分布 ,计算了它们在不同结构区段中的倾向性因子。在预测中 ,倾向性因子成为打分的主要依据 ,我们利用小波变换的分析方法对倾向性因子序列进行滤波。利用60个已知跨膜螺旋区段位置的蛋白质作为测试集检验小波分析的预测方法 ,实验结果表明这种预测方法具有较高的准确性。
- 李萍过涛李衍达孙之荣
- 关键词：蛋白质结构预测膜蛋白小波分析
- 生物芯片激光共聚焦扫描仪
- 程京王宪华叶建新张弘过涛宋小波孙烨磊徐辉赵云飞代春喜
- 该产品采用共聚焦光路，激发光和发射光在两个位置聚焦，激发光聚焦在芯片上，而发射光聚焦在针孔上，保证了激发光直接聚焦在芯片样点表面，只有落在物镜焦距内的发射信号才能通过一个针孔进行收集，最大限度的减低背景本底，优化了信噪比...
- 关键词：
- 关键词：扫描仪激光生物芯片
