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张国庆

作品数:3 被引量:32H指数:2
供职机构:上海生物信息技术研究中心更多>>
发文基金:中国科学院重点部署项目国家科技支撑计划国家高技术研究发展计划更多>>
相关领域:医药卫生自动化与计算机技术更多>>

文献类型

  • 3篇中文期刊文章

领域

  • 2篇医药卫生
  • 1篇自动化与计算...

主题

  • 2篇大数据
  • 1篇新药
  • 1篇新药筛选
  • 1篇生物医学
  • 1篇生物组
  • 1篇数据挖掘
  • 1篇宏基因组
  • 1篇FUNCTI...
  • 1篇测序
  • 1篇M

机构

  • 3篇上海生物信息...
  • 1篇复旦大学
  • 1篇中国科学院
  • 1篇中国科学院上...

作者

  • 3篇张国庆
  • 2篇李亦学
  • 1篇鞠元虎
  • 1篇修婧
  • 1篇张国庆
  • 1篇南蓬
  • 1篇陈健
  • 1篇王泽峰
  • 1篇赵国屏
  • 1篇郑广勇
  • 1篇张国庆
  • 1篇刘婉

传媒

  • 1篇复旦学报(医...
  • 1篇中国科学院院...
  • 1篇大数据

年份

  • 2篇2018
  • 1篇2012
3 条 记 录,以下是 1-3
排序方式:
生物医学大数据发展的新挑战与趋势被引量:27
2018年
生物医学数据从PB量级的组学时代进入到EB量级的多维度大数据时代,引发了生物医学研究向数据密集型的第四科学范式的深刻变革。如何将临床数据与研究数据进行高维度多层次的汇交共享,实现从"组学"到临床与健康人群数据的生物医学大数据的综合管理利用,从而使大数据迅速转化为新知识,成为生物医学大数据所面临的挑战。发展以递交为基础、以整合为导向的数据存储技术,以主题为基础、以交互为导向的数据共享技术,以及以传统信息技术为基础、以前沿信息技术为导向的数据分析挖掘技术,并同时开展标准质控相关研究,是生物医学大数据存储、共享和转化的新思路,也是构建新一代生物医学大数据研究中心的技术关键和未来趋势。
张国庆张国庆李亦学王泽峰
关键词:生物医学大数据数据挖掘
活性小分子功能筛选平台M & Function的设计与实现
2012年
目的建立一个综合了生物信息学和化学信息学的网络信息平台M&Function,致力于新药筛选和研究。方法通过数据挖掘,整合小分子药物的名称、结构、功能、分类等信息,建立一个小分子药物信息资源库。在此基础上,借助基于最大公共子结构(maximum common substructure,MCS)和Fingerprint的结构比对软件,通过统计分析,建立了功能预测系统,对活性小分子进行生物学功能预测。结果 M&Function平台拥有丰富的数据信息、内嵌的图形显示和数据统计插件人性化的网站设计,具有直观、高效、简便易用、测试数据结果可靠等优点。结论 M&Function平台不仅是一个小分子药物信息资源库,也是一个小分子功能预测平台,可以为高通量先导化合物的筛选提供信息准备和数据支持。网站可以通过http://lifecenter.sgst.cn/mcs/home.do进行访问。
陈健鞠元虎修婧张国庆南蓬
关键词:新药筛选
宏基因组大数据分析的质量控制流程规范被引量:5
2018年
宏基因组数据具有数据量大、复杂度高的特点,从数据类型来看,其涵盖了元数据和测序数据。为了保证宏基因组数据后续功能分析的有效性和正确性,需要对这些元数据和测序数据进行严格的质量控制检测。详细描述了宏基因组数据的质量控制流程,包括元数据和测序数据的信息检查、低质量片段的过滤等过程,从而为宏基因组数据分析提供了预处理的规范,这将为微生物组大数据分析提供坚实的基础。
郑广勇杨桢曹瑞芳刘婉李亦学张国庆
关键词:宏基因组
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