钟立鹏
- 作品数:8 被引量:9H指数:3
- 供职机构:南昌大学基础医学院更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金国家大学生创新性实验计划江西省科技支撑计划项目更多>>
- 相关领域:医药卫生生物学更多>>
- 蛇毒C型凝集素家族结构及抗原表位预测被引量:4
- 2010年
- 目的:预测和设计蛇毒C型凝集素家族蛋白(CLPs)共同B细胞抗原表位肽。方法:利用expasy蛋白质数据库在线软件Align对CLPs进行序列比对。运用DNAstar和Antheprot软件对蛇毒CLP家族的二级结构和表面特性,如亲水性、表面可及性、免疫原性、柔韧性等,综合各结果预测其抗原表位。采用Swiss-model和SEPPA在线工具进行三维结构和空间表位预测。结果:蛇毒CLP家族存在多个潜在的抗原表位位点,其中46~58区和98~110区肽段为可能的B细胞表位区。结论:综合考虑以上2个肽段家族同源性和表面特征,确定N端附近的46KTWADAEKFCTEQ58为蛇毒CLP可能的共同抗原区。
- 涂硕陈柯钟立鹏黄春洪
- 关键词:蛇毒B细胞抗原表位
- 基于Autodock和蛇PLIγ设计短肽sPLA_2抑制剂
- 2013年
- 天然的分泌型磷脂酶A2(Secretory phospholipase A2,sPLA2)抑制蛋白主要是蛇磷脂酶A2抑制蛋白γ(Snake phospholipase A2inhibitor proteinγ,PLIγ)。通过分析华游蛇PLIγ序列的结构特点及活性区,设计短肽PLA2抑制剂。运用Autodock分子对接软件,分析短肽与sPLA2的相互作用,通过pH动态监测法验证其抑制活性。设计得到的CPGV肽可以与sPLA2的疏水性活性中心结合,该四肽对蛇毒sPLA2的活性抑制率为69.12%。通过生物信息学和分子对接模拟筛选,成功地设计了PLIγ的活性肽。
- 钟立鹏姚敏乐贞黄春洪
- 关键词:分泌型磷脂酶A2分子对接
- 华游蛇PLIγ模拟肽的设计与活性验证
- 2014年
- 目的设计华游蛇血清PLIγ模拟肽并研究其对PLA2抑制作用。方法用RT-PCR方法克隆华游蛇PLIγ基因并测序进行序列比对。基于华游蛇PLIγ序列设计一个长度为19个氨基酸的多肽。利用Auto dock分子对接分析该19肽与sPLA2相互作用,运用琼脂糖平板法验证其对sPLA2的抑制效果,并通过小鼠实验进一步检测其抗sPLA2出血毒性。利用LPS诱导小鼠Raw264.7细胞炎性反应,检测细胞花生四烯酸含量以评价19肽对细胞sPLA2酶活性抑制作用。结果设计得到的华游蛇PLIγ模拟肽序列为PGLPLSYPNGGGGSVAFRS。该19肽较好地抑制蛇毒PLA2酶活性和出血毒性,并可以显著减少LPS诱导Raw264.7炎性细胞中花生四烯酸含量,IC50为86.3μmol/L。结论本文设计的华游蛇PLIγ模拟肽,具备了天然PLIγ的活性,具有抗细胞炎性反应和蛇毒出血毒作用。
- 钟立鹏郭薇姚敏沈婷杨武黄春洪
- 关键词:SPLA2分子对接炎性反应
- 江西常见蛇血清中抗蛇毒sPLA_2蛋白的筛选与纯化被引量:3
- 2011年
- 为研究特异性解蛇毒和抗炎症蛋白质药物,对6种江西常见蛇种血清sPLA2抑制蛋白进行筛选和分离纯化。利用实验室前期纯化的五步蛇毒sPLA2作为靶酶,以琼脂糖平板法和pH动态监测法联合筛选江西常见蛇种血清sPLA2抑制剂。基于初筛结果和资源量,确定以华游蛇血清为原料,分离纯化sPLA2抑制剂。分离过程包括Source 30Q、超滤、Uno Q柱精纯化等3个步骤,目的组分经SDS-PAGE分离,显示含有2个亚基,相对分子质量为25.4 ku和21.2 ku。结合文献初步推测该蛋白可能为-γPLI。
- 陈柯钟立鹏陈乐宗李晓徐曦黄春洪
- 关键词:分泌型磷脂酶A2磷脂酶A2抑制剂
- 蛇血清分泌型磷脂酶A_2抑制剂防治人炎症的生物信息学分析被引量:6
- 2011年
- 目的比较人和蛇毒分泌型磷脂酶A2(sPLA2)结构相似性,分析蛇血清磷脂酶A2抑制剂(PLI)对sPLA2特异性抑制的结构与功能关系,评价蛇血清PLI对人炎症的抑制作用。方法用Clustal W2对人和五步蛇sPLA2氨基酸序列进行多重序列比对。用Swiss-model对各种sPLA2的空间结构进行同源建模预测,并用Chimera软件对人和蛇毒sPLA2空间结构进行三维比对。结果人和五步蛇sPLA2一级序列同源性有40%左右,空间结构几乎相似。各种PLI具有相同的空间结构特征和保守的sPLA2结合区。结论理论上推断蛇血PLI可有效抑制人sPLA2活性,减少sPLA2介导的炎症发生。
- 陈柯邓欣如徐曦李晓钟立鹏黄春洪
- 关键词:磷脂酶A2磷脂酶A2抑制剂生物信息学
- 一种大体积高效动态透析方法及其装置
- 本发明公开了一种大体积高效动态透析方法及其装置,其特征是采用一个蠕动泵使透析样品向一个方向流动,透析样品在流动过程中经过样品瓶,采用另一个蠕动泵使透析缓冲液在透析袋外以与透析样品流动方向相反的方向流动;在透析样品的输送管...
- 黄春洪廖章萍袁鹏钟立鹏
- 文献传递
- 蛇血清磷脂酶A2抑制剂的分离纯化及模拟肽的设计
- 在人体内,磷脂酶A2(Phospholipase A2,PLA2)是花生四烯酸炎症通路的限速酶,为早期炎症的重要标志物。PLA2的过度表达可以引起重症胰腺炎、急性缺血性脑损伤、冠心病等多种疾病,然而临床上PLA2抑制剂类...
- 钟立鹏
- 关键词:磷脂酶A2蛋白结构分子对接基因表达
- 文献传递
- 蛇血清磷脂酶A<sub>2</sub>抑制剂的分离纯化及模拟肽的设计
- 在人体内,磷脂酶A2(PhospholipaseA2,PLA2)是花生四烯酸炎症通路的限速酶,为早期炎症的重要标志物。PLA2的过度表达可以引起重症胰腺炎、急性缺血性脑损伤、冠心病等多种疾病,然而临床上PLA2抑制剂类的...
- 钟立鹏
- 关键词:分泌型磷脂酶A2磷脂酶A2抑制剂RAW264.7细胞模拟肽