王坤波 作品数:361 被引量:1,823 H指数:22 供职机构: 湖南农业大学 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 国家高技术研究发展计划 国家科技重大专项 更多>> 相关领域: 农业科学 轻工技术与工程 医药卫生 生物学 更多>>
检测与评价农作物SSR分子标记冗余性的方法 本发明涉及生物信息学领域,具体地,涉及检测与评价农作物SSR分子标记冗余性的方法。根据本发明的方法同时可以分析一对引物的正向和反向序列冗余性,另外在电泳水平及测序序列水平进行同时验证。现有方法只能分析一对引物的正向或反向... 王为 王坤波 刘方 王长彪 王春英 张香娣 王玉红文献传递 棉花新材料中G5主要特点 被引量:3 2000年 王坤波 崔荣霞 王春英 黎绍惠 宋国立 张香娣 胡绍安关键词:棉花 生物学特性 南繁棉花的水肥管理和化控 2009年 南繁棉花与主产棉区棉花(棉区棉花)全生育期虽然差异不大.但各个生育阶段的生长发育速度差别较大,后者的前-中-后3个阶段属于“慢-快-慢”模式.南繁棉花恰好相反,是“快-慢-快”模式。所以.同样是大田棉花,但在水肥管理和生育期调控方面,南繁棉花是有其自身要求的。 黎绍惠 王坤波 胡育昌 张西岭 汪若海关键词:水肥管理 棉花 南繁 化控 全生育期 生育阶段 茶树多酚氧化酶研究进展 被引量:16 2012年 多酚氧化酶(Polyphenol Oxidase,PPO)是茶树(camellia sinensis)中普遍存在的一种酶,是红茶制作中品质形成的关键酶类。多酚氧化酶可催化氧化儿茶素类物质形成茶黄素类(TFs)色素,而后者对红茶色、香、味等品质形成具有关键作用。 陈东生 王坤波 黄建安 刘仲华关键词:红茶 茶黄素 多酚氧化酶 HPTLC辅助优化HSCCC溶剂系统分离茶多酚 本实验采用HPTLC以及HPLC分析测定茶多酚在HSCCC两相溶剂中的分配系数,应用16组Oka两相溶剂体系并采用配方试验设计进行改进。结果表明,利用HSCCC分离茶多酚的较优条件是环境温度为20℃,转速为750转/分钟... 宋鲁彬 黄建安 刘仲华 陈金华 王坤波关键词:高速逆流色谱 茶多酚 优化设计 文献传递 棉花BAC文库快速筛选法 被引量:2 2012年 目的:构建棉花细菌人工染色体(Bacterial Artificial Chromosome,BAC)文库的快速筛选法,以期从BAC文库中大量、快速、高效筛选出特定BAC克隆,为从事基因组测序、分离和分析特定基因、构建物理图谱及基因图位克隆等生物学技术研究奠定基础。方法:构建了整板、行、列的三维混合池,以菌液PCR为基础,从BAC文库中筛选出含有特定DNA片段的BAC单克隆。结果:从BAC文库的3 456个克隆中,共筛选出16个阳性单克隆,涉及13条染色体、11个SSR标记。结论:该文构建的棉花BAC文库筛选体系,筛选快速、准确,适合从BAC文库中大量筛选BAC单克隆。结合当前的多种BAC文库筛选方法进行探讨,根据不同的实验目的选择更合适的筛选方法和操作步骤。 程华 彭仁海 张香娣 刘方 王春英 王坤波关键词:棉花 BAC文库 棉花HDAC基因家族鉴定及其在黄萎病菌侵染下的表达分析 被引量:1 2021年 【目的】组蛋白去乙酰化酶(Histone deacetylases,HDAC)在植物发育及抗病应答中发挥重要作用,本研究旨在鉴定棉花HDAC基因家族成员并对其在黄萎病抗性中的作用进行分析。【方法】利用生物信息学方法对棉花基因组中HDAC基因家族成员进行鉴定,并对其理化性质、系统发育关系、基因结构进行系统分析。利用实时荧光定量聚合酶链式反应分析了黄萎病菌诱导下瑟伯氏棉HADC基因的表达模式。【结果】陆地棉、亚洲棉和瑟伯氏棉基因组中分别包括30、15和13个HDAC基因。棉花HDAC分为RPD3/HDA1、HD2和SIR2三个亚族,同一亚族成员间具有相似的基因结构和保守基序。棉花HDACs基因启动子中含有大量的激素应答、胁迫响应以及植物生长发育相关的顺式作用元件。瑟伯氏棉GthHDAC基因响应乙烯、水杨酸和茉莉酸的诱导;在黄萎病菌胁迫下,多数GthHDAC基因上调表达,表明该基因家族可能通过乙烯/茉莉酸和水杨酸等信号通路调控棉花黄萎病抗性。【结论】本研究从全基因组水平上鉴定了亚洲棉、陆地棉和瑟伯氏棉中58个HDAC家族基因,并明确了瑟伯氏棉HDAC家族成员在黄萎病菌胁迫下的表达模式。黄萎病菌处理后,大部分GthHDAC基因在叶片中上调表达,并且受到乙烯、水杨酸和茉莉酸的诱导。 王艳情 郑杰 许艳超 蔡小彦 周忠丽 侯宇清 王坤波 王玉红 陈浩东 刘方 李志坤关键词:棉花 HDAC 抗黄萎病 棉花非冗余性EST-SSR新标记的开发及其评价 被引量:7 2012年 利用ClustalX等软件对公共数据库现有的393753条棉花EST序列分析,得到349815条非冗余EST序列,借助自主开发的SSRmine软件共发掘SSR位点11372个,分布于10507条EST中,EST-SSR的频率是3%,平均相隔21kb出现一个SSR。在2~6bp的重复基元中,三核苷酸和六核苷酸分别占34.1%、40.6%,二、三、四、五和六核苷酸基序分别以AG/CT、AAG/CTT、AAAT/ATTT、AAAAG/CTTTT和AAAAAG/CTTTTT的类型最多。利用去冗余的且在亚洲棉、陆地棉、海岛棉中没有被开发过的410条EST序列设计开发了200对非冗余性SSR引物,利用自主开发的SSRD软件通过SSR引物序列下载、预处理、Blastn、提取相似性分值≥81%的引物编号、提取引物冗余对、冗余引物写成一行6个步骤去除来源于自身部分同源序列以及与CMD释放的不同棉种相似性SSR引物,得到了非相似性引物,定名为CRIXXX(CRI即Cotton Research Institute)。并分别选用棉花12个种的代表性材料对其中100对进行引物功效评价,包括多态信息含量(polymorphism information content,PIC)及引物通用性研究。结果显示,从自主开发的100对SSR引物筛选出56对均能在12份材料间扩增出稳定明显的条带,其中多态性引物35对,多态率占35%。引物的PIC变幅为0.097~0.888,平均为0.482;1对海岛棉EST-SSR引物在12份材料间的通用性为100%,25对亚洲棉引物通用性为81%,74对陆地棉引物通用性为80.1%。 王为 王长彪 刘方 陈浩东 王琳 王春英 张香娣 王玉红 王坤波关键词:棉花 EST-SSR标记 冗余性 多态性 一种简单茶黄素单体的制备方法 本发明涉及一种简单茶黄素单体的制备方法,所述方法包括如下步骤:1)向含有茶黄素提取物的溶液中添加鞣酸酶和果胶酶的混合物,在25℃‑30℃下搅拌20‑60min,得酶解液;2)将酶解液迅速升温到85‑90℃,保持5‑10m... 刘仲华 王坤波 黄建安 林勇 林海燕 李娟文献传递 冷胁迫下二倍体野生种瑟伯氏棉和三裂棉转录组比较分析 Cotton (Gossypium) is one of the important fiber crops of the world.Cold stress affects the normal growth of c... 蔡小彦 许艳超 周忠丽 王星星 王玉红 张振梅 刘方 王坤波关键词:GOSSYPIUM DIPLOID WILD RNA-SEQ CBF