梁振霞
- 作品数：3 被引量：2H指数：1
- 供职机构：云南大学数学与统计学院更多>>
- 发文基金：云南省教育厅科学研究基金更多>>
- 相关领域：生物学更多>>
- 组合调控中过表达模体对距离的统计检验被引量：2
- 2013年
- 揭示真核生物转录调控机制是生物信息学的一项重要研究内容。转录调控的一个重要特征是基因受多个转录因子的组合调控。在用系统生物学和数学建模的方法识别组合调控中的转录因子结合位点时,过表达模体对的距离检验是其关键步骤之一。本文对组合调控模体对距离检验的三种方法进行了综述,同时给出了三种检验的数学模型和具体检验方法。文章为研究基因的组合调控和探测潜在的过表达模体对提供理论支持。
- 陈丹梁振霞李慧敏
- 关键词：数学模型
- 果蝇胚胎不同表达水平基因内含子序列特征的比较分析
- 2013年
- 对果蝇胚胎低表达和高表达水平基因内含子的序列结构进行分析,发现2种表达水平的基因内含子序列特征有明显差异.高表达基因的内含子一般比低表达基因的长,其中高表达基因第1内含子的平均长度是低表达基因的2.62倍,第2内含子的平均长度是低表达基因的1.79倍.两类基因第1内含子中的CpG岛含量最高,并且高表达基因内含子中CpG岛含量要高于低表达基因.此外,与低表达基因相比,TATA box、CAAT box和GC box在高表达基因内含子中出现的频数明显要高些,尤其是在第1内含子中.作者还提取出果蝇胚胎2种表达水平基因第1内含子中高频出现的6-mer简单重复序列,发现一些重复序列与实验得到的转录因子结合位点相符合.这些结果提示内含子特别是第1内含子有可能调控果蝇胚胎基因的转录从而影响基因的表达水平.
- 陈丹李慧敏张静梁振霞
- 关键词：基因表达水平转录调控内含子
- 人组织特异性基因组合转录调控模块的统计分析
- 本文主要就人30个组织特异性基因上游1000bp到第一内含子序列中的组合转录调控模块的识别方法进行探讨，同时对识别得到的组合转录调控模块进行统计分析。 识别两个调控元件组合的模块（即模体对）的方法有两种:分步方法和同步...
- 梁振霞
- 关键词：超几何分布
