李凌君 作品数:9 被引量:32 H指数:3 供职机构: 广西科技大学 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 国家高技术研究发展计划 广西省自然科学基金 更多>> 相关领域: 医药卫生 农业科学 理学 更多>>
猪戊型肝炎病毒株swGX32全基因组序列分析 被引量:3 2008年 目的分析从广西地区分离的1株猪戊型肝炎病毒swGX32全基因组序列并比较其与其他分离株的差异。方法设计PCR引物,用巢式反转录聚合酶链反应法(RT—nPCR)分段扩增戊型肝炎病毒(HEV)株swGX32全基因序列,用cDNA末端快速扩增法(RACE)扩增其末端序列,对扩增产物进行克隆和测序,并对拼接后的基因组进行序列和进化分析。结果除3’polyA尾巴外,swGX32全长7240nt,ORF1与ORF2重叠4nt,ORF3包含在ORF2序列中。swGX32全基因序列与HEV1—4型核苷酸序列的同源性分别为:73%-74%、73%、74%-75%,83%-94%,其中与中国人源HEV株JKO—ChiSai98C同源性最高,达94%。全基因序列进化分析显示,swGX32位于HEV基因4型分枝上,ORF2部分核苷酸序列进化分析显示,swGX32与JKO—ChiSai98C同在HEV4a亚型分枝上。结论猪HEV swGX32在全基因组结构及分子进化上均与人HEV JKO—ChiSai98C有密切关系,为揭示戊型肝炎是一种人兽共患病提供了分子生物学依据。 吉彦莉 李凌君 韦献飞 王玲 常义斌 唐荣兰 朱永红 庄辉关键词:戊型肝炎病毒 基因型 人畜共患病 新疆猪戊型肝炎病毒株CHN-XJ-SW33全基因组序列分析 被引量:1 2010年 目的测定从新疆南部地区分离的猪戊型肝炎病毒(HEV)株全基因组序列,并在此基础上分析猪HEV与人源HEV的关系。方法设计HEV基因4型通用PCR引物,用逆转录巢式聚合酶链反应法(RT-nPCR)分段扩增猪HEV株CHN-XJ-SW33的全基因组序列;用cDNA末端快速扩增法(RACE)扩增其末端序列;对扩增的目的片段进行克隆测序,并对拼接后的基因组进行序列比对和进化分析。结果除3′poly(A)尾外,CHN-XJ-SW33基因组全长为7 238 nt,由3个开放读码框(ORF1-3)组成,分别编码1 706、674和114个氨基酸。CHN-XJ-SW33全基因组序列与HEV基因1-3型病毒株同源性仅为72.1%~74.9%,而与HEV基因4型病毒株同源性高达82.8%~95.5%,其中与日本人源中国输入型HEV株JKO-ChiSai98C同源性最高,为95.5%。基因进化分析显示,CHN-XJ-SW33属于HEV4a基因亚型。结论猪HEV与人HEV在全基因组核苷酸序列上高度同源,提示基因4型HEV可能由猪传染给人。 付红伟 杜刚 朱永红 李凌君 王玲 耿家宝 薛城 王晓娟 庄辉关键词:戊型肝炎病毒 全基因组序列 新型环焦磷酸酯类化合物及其制备方法 本发明公开了新型环焦磷酸酯类化合物及其制备方法,本发明所提供的环焦磷酸酯类化合物具有通式(I)的结构,其中X为OCH<Sub>2</Sub>或者CH<Sub>2</Sub>,Y为H、卤素或CH<Sub>2</Sub>=C... 张礼和 李凌君 张亮仁 杨振军文献传递 戊型肝炎病毒传播途径和致病性的研究进展 被引量:16 2009年 戊型肝炎(戊肝)病毒(HEV)一直被认为主要经粪一口途径传播,无论是迄今在发展中国家暴发的10次戊肝疫情,还是近20年来在美国、日本等发达国家散发的戊肝病例,都是通过水源或食物污染引起。随着近年来对戊肝研究的不断深入,在HEV传播途径和致病性方面都有了新的进展。现综述如下。 李凌君 朱永红 王玲 付红伟 庄辉关键词:戊型肝炎病毒 碱基修饰的环腺苷二磷酸核糖和烟酰胺腺苷二核苷酸类似物的设计合成及活性研究 李凌君关键词:核苷酸 酶抑制剂 药物筛选 中国广西猪HEV swGX40全基因组序列的扩增及 李凌君关键词:戊型肝炎病毒 基因亚型 动物宿主 进化分析 北京市郊区八种动物戊型肝炎病毒抗体流行率调查及病毒基因型研究 被引量:7 2010年 目的调查北京地区与人密切接触的猪、牛、羊、马、驴、犬、鸡、鸭8种动物血清中戊型肝炎病毒(HEV)抗体流行率及该地区猪HEV基因型和亚型。方法收集8种动物的血清标本及幼猪粪便标本,用双抗原夹心ELISA法检测血清中抗-HEV;用巢式反转录聚合酶链反应法(RT-nPCR)检测HEVRNA;对部分PCR产物进行克隆和测序,并对测序结果进行基因分型。结果在8种动物中抗-HEV阳性率分别为猪80.43%(481/598),其中成猪(〉6月龄)为87.86%(369/420),幼猪(2~3月龄)为62,92%(112/178);牛15.02%(52/346);马14.29%(40/280);驴0(0/26);羊9.88%(33/334);犬0(0/21);鸭3.03%(7/231);鸡2.53%(8/316)。RT-nPCR检测3月龄以下猪粪便标本HEVRNA阳性率为66.67%(74/111)。HEVRNA阳性的标本测序后可归为6株(分别命名为bjsw1、bjsw2、bjsw3、bjsw4、bjsw5和bjsw6),6株HEV开放读码框2(0RF2)部分核苷酸序列的相似性为94.5%~99.6%,与1、2、3、4型HEV的相似性分别为75.6%~78.6%、75.6%~76-2%、77.1%~80.7%和83.7%~94.5%。6株HEV与人HEV4d亚型的同源性最高,为90.0%~94.5%。结论北京市郊区猪、牛、马、羊、鸭、鸡中均存在HEV感染,其中猪抗-HEV流行率最高,驴、犬抗-HEV的流行率最低;6株猪HEV属于基因4型、4d亚型。 耿家宝 付红伟 王玲 王晓娟 关建民 常义宾 李凌君 朱永红 庄辉 刘全红 彭兴春关键词:戊型肝炎病毒 抗-HEV 人兽共患病 广西桂中地区动物戊型肝炎病毒分离与致病性研究 唐荣兰 韦献飞 朱永红 秦小云 葛宪民 熊云新 吉彦莉 梁靖瑞 谢益安 李凌君 付红伟 1.课题来源与背景:该课题为广西科学基金项目(桂科自:0728242)。戊型肝炎是由戊型肝炎病毒(HEV)引起的一种急性肝炎,主要由消化道传播,有流行和散发两种形式,在发展中国家和发达国家都是一个重要的公共卫生问题。在中...关键词:关键词:戊型肝炎 病毒性肝炎 血清流行病学 分子生物学 广西地区动物HEV基因型及亚型分布 被引量:4 2008年 目的了解广西地区猪、鼠、狗、猕猴和鱼5种动物戌型肝炎病毒(HEV)基因型和亚型分布。方法对广西地区猪、鼠、狗HEV抗体阳性血清170份,鼠肝组织150份,3月龄以下狗粪便标本80份,鱼胆汁标本120份,3月龄以下猪粪便标本129份,龙虎山自然景区猴粪便标本130份,用巢式逆转录聚合酶链反应法(RT-nPCR)检测戊型肝炎病毒核糖核酸(HEV RNA),对RT-nPCR阳性扩增产物进行克隆测序,用Vector NTI Suite 9.0和Treeview软件与目前新分型方法所选参考序列进行核苷酸序列相似性比较和生物进化树分析。结果广西地区170份猪、鼠和狗血清HEV RNA检测均为阴性。在150份鼠肝组织,120份鱼胆汁标本,80份狗和130份猕猴粪便标本中均未检出HEV RNA;3月龄以下猪粪便标本HEV RNA阳性率10.08(13/129)。对13株猪HEV开放读码框架(ORF)1区部分核酸序列进行分析,其与Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ和Ⅳ型HEV的相似性分别为73%~77%,76%~79%,76%~81%,82%~97%;与6个亚型的相似分别为4a:82%~94%;4b:82%~98%;4c:82%~87%;4d:81%~87%;4f:84%~86%;4g:81%~84%,其中2株与Ⅳa亚型相似性是高为82%~94%,11株与Ⅳb亚型相似性最高为82%~98%。结论广西地区猪HEV均为基因型4,2株属于基因型Ⅳa,Ⅱ株为Ⅳb。HEV在猪、鼠、狗血清、鼠肝组织、鱼胆汁、狗和猕猴粪便标本中均未检出。 韦献飞 吉彦莉 唐荣兰 泰小云 梁靖瑞 李凌君 葛宪民 熊云新 谢益安 朱永红关键词:戊型肝炎病毒 基因型 动物宿主