孔秀英
- 作品数：92 被引量：417H指数：11
- 供职机构：中国农业科学院作物科学研究所更多>>
- 发文基金：国家重点基础研究发展计划国家自然科学基金引进国际先进农业科技计划更多>>
- 相关领域：农业科学生物学医药卫生更多>>
- 几种cDNA差减文库构建方法的比较被引量：36
- 2000年
- cDNA差减文库的构建是研究基因差异表达、缩小目的基因筛选范围的理想方法。近年来报道了多种构建方法 ,并形成了两个发展趋势 ,但目前还无一种方法被普遍认可。现就几种常见方法的原理、思路及优缺点进行了比较 ,以供借鉴。
- 骆蒙孔秀英贾继增
- 关键词：差减文库差减杂交CDNA
- 利用改进的Cap-trapper法构建拟斯卑尔脱山羊草(Ae.speltoides Tausch)全长cDNA文库被引量：13
- 2005年
- Captrapper法是目前全长cDNA文库构建的重要方法之一。在引进、消化、吸收的基础上,通过设计引物,同位素检测,对末端转移反应条件控制等方面做了一些切实可行的改进,形成了一套简单易行的技术体系。利用改进的Captrapper方法,成功构建了小麦B基因组的可能供体种拟斯卑尔脱山羊草(Ae.speltoides)的全长cDNA文库。经综合评价,文库的全长比例达到89.6%,重组率为99%,库容量超过3.0×106cfu。
- 毛新国孔秀英赵光耀贾继增
- 关键词：全长CDNA文库
- TaRomo1蛋白在调控小麦雄性育性中的应用
- 本发明公开了TaRomo1蛋白在调控小麦雄性育性中的应用。TaRomo1蛋白的氨基酸序列如SEQ ID NO：2和/或SEQ ID NO：4所示。沉默TaRomo1蛋白能够导致小麦雄性半不育，具体表现为穗部的颖壳张开、花...
- 刘杰夏川董慧雪刘盼张立超贾继增刘旭孔秀英孙加强
- 小麦bHLH家族转录因子的鉴定及其在盐胁迫条件下的表达分析
- 2024年
- 碱性螺旋―环―螺旋(basic helix-loop-helix,bHLH)转录因子作为植物中第二大类转录因子家族,在植物生长发育、信号传导、生物合成以及响应非生物胁迫等方面发挥重要功能。为了探讨小麦bHLH转录因子在盐胁迫应答中的功能,以冬性小麦科农199为试验材料,通过转录组测序和生物信息学分析的方法对小麦bHLH转录因子在盐胁迫下的表达特性进行系统分析。结果表明,小麦中共有489个bHLH转录因子,分布在21条染色体上;构建系统进化树将bHLH家族进一步划分为9个亚族,其中VI亚族成员最多,IV亚族成员最少;盐胁迫下小麦根转录组测序结果表明,在盐胁迫处理后1和6h差异表达基因(DEG)共有44个,其中上调表达的基因有17个,下调表达的有27个;GO分析表明,DEG富集在水、盐胁迫、生长素调节等方面;KEGG注释分析表明,DEGs主要富集在淀粉和蔗糖代谢途径以及氨基糖和核苷酸糖代谢等信号通路;对部分DEG进行qRT-PCR验证,结果表明DEG的表达模式与转录组测序结果一致,证明了RNA-Seq结果的准确性。
- 吕宝莲杨宇昕崔立操史峰马亮孔秀英张立超倪志勇
- 关键词：小麦盐胁迫生物信息学分析
- 粗山羊草(Ae.tauschii)幼苗和根全长cDNA文库构建及其EST注释与比较分析被引量：6
- 2007年
- 【目的】构建小麦D基因组供体粗山羊草根和叶的全长cDNA文库,探讨利用生物信息学方法分析发掘组织特异性表达基因的可行性。【方法】本研究利用Cap-trapper方法构建全长cDNA文库,利用高通量测序技术获得大批高质量EST序列,在基于Linux系统的本地化生物信息学分析平台上对上述EST进行了电子注释分析。【结果】成功构建了粗山羊草根和叶的全长cDNA文库,测序获得根EST序列6973条和叶EST6616条。利用本地化数据分析平台对其进行功能注释。利用GO-Diff软件,发现了两个文库间表达基因的功能差异,找到组织间表达差异显著的基因和组织内特异性表达的基因。【结论】利用构建的全长cDNA测序获得大量EST序列,通过生物信息学方法挖掘差异表达或特异性表达基因的方法是可行的。
- 赵光耀孔秀英贾继增
- 关键词：粗山羊草表达序列标签全长CDNA文库功能注释
- TabHLH44蛋白及其编码基因与应用
- 本发明公开了TabHLH44蛋白及其编码基因与应用。本发明提供了蛋白，命名为TabHLH44，是如下1)或2)：1)序列表中序列2所示的蛋白质；2)将序列表中序列2所示的氨基酸序列经过一个或几个氨基酸残基的取代和/或缺失...
- 孔秀英翟亦倩张立超夏川符思路赵光耀贾继增
- 文献传递
- 硬粒小麦Glu-B3基因家族新成员的克隆及其分子标记的开发被引量：4
- 2008年
- 获得小麦低分子量谷蛋白基因家族新成员,为深入研究该基因家族的组成及其在染色体上的分布与进化奠定基础。本研究根据已发表的小麦低分子量麦谷蛋白基因序列设计了1对简并引物,以从硬粒小麦品种Langdon BAC文库中筛选的携带小麦低分子量谷蛋白基因的BAC为模板,利用同源序列克隆技术克隆了1个MET类型的小麦低分子量谷蛋白基因LMWLDN-M,该基因编码350个氨基酸。利用LMWLDN-M与本实验室克隆的Langdon品种其他类型的小麦低分子量谷蛋白基因之间的SNP,设计了该类型基因特异的引物。以Langdon代换系和中国春小麦缺体-四体为模板进行PCR扩增,将该基因定位到小麦B基因组上。序列分析表明,LMWLDN-M为Glu-B3基因家族的一个新成员。
- 赵永涛孔秀英詹克慧
- 关键词：硬粒小麦基因家族
- 细菌人工染色体(BAC)文库及其在小麦中的应用被引量：2
- 2006年
- 细菌人工染色体(BAC)具有容量大、遗传稳定、易于操作等优点,在基因组研究和基因功能分析等方面得到了广泛应用。对BAC文库克隆载体的类型、小麦BAC文库的构建及其应用进行了综述,并对其前景进行了展望。细菌人工染色体载体是由大肠杆菌的F-因子发展而来,第一代BAC克隆载体pBAC108l能容纳300kb的片段,但它只具有转化选择标记,没有重组选择标记。第二代载体是将LacZ基因插入到多克隆位点中形成具有重组选择标记类型的载体如pBeloBAC11,在该载体的基础上经过改造和改进又发展了一些特殊用途的载体,如富集基因类型和遗传转化类型的载体。近年来利用这些载体构建了小麦二倍体、四倍体、六倍体基因组BAC文库以及小麦特定染色体BAC文库,并以单克隆或混合池的形式保存。这些小麦BAC文库对于小麦基因克隆、基因组及基因区物理图谱的构建以及比较基因组学等方面的研究具有重要的意义。
- 刘越孔秀英吴佳洁肖建会刘旭
- 关键词：小麦细菌人工染色体文库基因组学
- 一粒小麦抗白粉病和条锈病基因的分析被引量：6
- 2005年
- 一粒小麦是普通小麦抗性改良的宝贵资源。本研究对24份一粒小麦分别进行了白粉病和条锈病混合菌种苗期接种鉴定,进一步分别用一套白粉病菌菌株(15个)对2份乌拉尔图小麦和条锈病菌小种(21个)对1份栽培一粒小麦进行接种鉴定,其中乌拉尔图小麦UR206能抵抗所有供试白粉菌菌株,UR204除对白粉菌菌株E11感病外,对其余菌株表现抗性;栽培一粒小麦MO205对不同条锈菌小种表现出不同的抗性反应,研究表明乌拉尔图小麦UR206、UR204和栽培一粒小麦MO205分别含有与已知抗白粉病和抗条锈病基因不同的新基因。对乌拉尔图小麦UR204、UR206和栽培一粒小麦MO205分别进行抗白粉和条锈病基因的遗传分析,结果表明乌拉尔图小麦UR204和UR206分别含有一对显性抗白粉病基因,栽培一粒小麦MO205含有两对独立遗传的显性抗条锈病基因。
- 邱永春周荣华孔秀英徐世昌张书绅孙晓丽贾继增
- 关键词：基因分析
- 植物耐逆相关蛋白TaMYB30及其编码基因和应用
- 本发明公开了植物耐逆相关蛋白TaMYB30及其编码基因和应用本发明提供的蛋白质，是如下（a）或（b）：（a）由序列表中序列1所示的氨基酸序列组成的蛋白质；（b）将序列1的氨基酸序列经过一个或几个氨基酸残基的取代和/或缺失...
- 孔秀英张立超赵光耀贾继增刘旭
- 文献传递
