万慧荣
- 作品数：3 被引量：20H指数：1
- 供职机构：南京师范大学生命科学学院江苏省生物多样性与生物技术重点实验室更多>>
- 发文基金：教育部“新世纪优秀人才支持计划”国家自然科学基金国家教育部博士点基金更多>>
- 相关领域：生物学农业科学更多>>
- 江豚Neophocaena phocaenoides单核苷酸多态性位点SNPs筛选的方法学研究
- 本论文共包括四个部分：
1)综述了单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms，SNPs)标记及其在生态、进化和种群生物学中的应用。
2)构建江豚(Neophocae...
- 万慧荣
- 关键词：江豚单核苷酸多态性种群生物学克隆测序
- 文献传递
- DNA池结合DHPLC和直接测序技术在江豚SNPs检测中的应用被引量：20
- 2009年
- 选取江豚基因组中的2个已知单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphisms，SNPs）位点，通过PCR扩增，将PCR产物按基因频率不同制备成0～50％的11个DNA池（DNAp001），用于变性高效液相色谱（denaturing high performance liquid chromatography，DHPLC）和直接测序分析，以探讨DNA池中基因频率的最低要求。结果显示，当稀有等位基因的基因频率不少于5％时可在DHPLC检测过程中明显分辨；而利用DNA池进行直接测序时的基因频率则需达到10％。这提示，为保证DHPLC分析的准确性和可靠性，制备DNA池时等摩尔DNA混合的个体数最好不超过10个。DNA池结合DHPLC技术的高效性与准确性可在大规模的SNPs位点筛选中发挥作用。
- 李树珍万慧荣杨光
- 关键词：江豚SNPSDHPLC
- 基于CATS法的江豚SNPs位点筛选
- 2008年
- 通过比较锚定序列示踪(Comparative Anchor Tagged Sequences,CATS)法,选择人、小鼠及其它哺乳动物中已知的5对CATS引物,通过PCR反应从江豚(Neophocaena phocaenoides)基因组中扩增出相应的DNA片段,结合变性高效液相色谱(Denaturing High Performance Liquid Chromatography,DHPLC)和DNA直接测序等技术,进行江豚单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphisms,SNPs)位点的筛选。通过不同个体同源序列的比对分析,发现其中的4个DNA片段具有多态性,共检测出7个SNPs位点,即大约每370bp出现1个SNPs。本研究为进一步利用CATS法获得江豚及其它野生动物种群的SNPs位点并进行种群遗传学分析奠定了基础。
- 李树珍万慧荣杨光
- 关键词：江豚SNPSCATSDHPLC
