马瑞
- 作品数:5 被引量:8H指数:2
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- 发文基金:国家重点基础研究发展计划中国科学院知识创新工程重要方向项目更多>>
- 相关领域:生物学更多>>
- 齿肋赤藓中半定量RT-PCR方法的探讨
- 2010年
- 目的:建立一种半定量RT-PCR方法,用于齿肋赤藓(Syntrichia caninervis)基因表达研究。方法:比较常用的几种内参照基因actin、tubulin及18S rRNA在齿肋赤藓中的表达情况,以确定表达稳定的内参基因;分析PCR扩增动力学,确定内参和靶基因的PCR体系。结果:琼脂糖凝胶电泳检测分析表明:18S rRNA作为齿肋赤藓的内参基因更稳定;同管扩增试验表明:18SrRNA的引物滞后6个循环加入PCR扩增体系中,至第26个循环,二者同时处于指数扩增期,且靶基因RT-A的扩增效率不受影响。结论:18S rRNA与RT-A可以同管扩增,18S rRNA可以作为半定量RT-PCR的内参照,为齿肋赤藓基因表达研究奠定基础。
- 杨红兰张道远马瑞刘燕
- 关键词:半定量RT-PCR内参基因
- 齿肋赤藓乙醛脱氢酶基因ALDH21的克隆与表达分析被引量:6
- 2010年
- 本文采用RT-PCR方法,从齿肋赤藓(Syntrichia caninervis)总RNA中获得ALDH21基因cDNA序列,连接到pMD19-T载体上并转化E.coli DH5α,阳性克隆经PCR鉴定后测序,将测序结果与GenBank中山墙藓(Tortula ruralis)和小立碗藓(Physcomitrella patens)相关基因序列进行同源性比对。结果表明,实验成功克隆了S.caninervis的ALDH21基因的cDNA序列(GenBank登录号:GQ245973),为一个完整的ORF,其长度为1452bp。该序列与T.ruralis和P.patens的cDNA序列同源性分别为98%和78%,推导的氨基酸同源性分别为97%和87%。生物信息学分析表明该蛋白质分子量为52.98kD,等电点pI为5.96,编码483个氨基酸,具备ALDH21蛋白家族特征;半定量RT-PCR结果表明:ALDH21在干旱胁迫状态时的表达量显著高于水合状态,说明ALDH21基因可能参与干旱胁迫应答。本文为进一步研究齿肋赤藓ALDH21基因的抗旱机理提供理论依据。
- 杨红兰张道远刘燕马瑞张元明
- 关键词:CDNA克隆RT-PCR
- 荒漠生物结皮中齿肋赤藓总RNA最佳提取方法的确立被引量:2
- 2010年
- 目的:根据不同提取方法对提取荒漠齿肋赤藓总RNA质量的影响,寻找一种快速高效提取齿肋赤藓总RNA的方法。方法:采用改良RNAiso Reagent试剂法、RNAprep pure植物总RNA提取试剂盒法(TIANGEN)、皂土法分别提取采自新疆古尔班通古特沙漠生物结皮中齿肋赤藓的总RNA,用紫外分光光度计测定其浓度、纯度和产量,并通过RT-PCR进一步检测其质量。结果:三种方法均能提取出RNA,但质量差异较大。其中改良的RNAiso Reagent试剂法提取的RNA产量可达1298~1318μg/g,完整性好且纯度高,OD260/OD280值为1.86~1.92,且经济、操作简便,能有效抑制多酚物质氧化和次生代谢物质的影响,,适合用于进一步的RT-PCR反应。结论:改良的RNAisoReagent法经济且操作简便,提取的荒漠齿肋赤藓RNA完整性和纯度较高,可用于RT-PCR反应。
- 马瑞杨红兰张元明张道远徐刚标
- 关键词:总RNA古尔班通古特沙漠
- 荒漠齿肋亦藓抗旱基因ScALDH21、Sc288对干旱胁迫的响应
- 环境胁迫是影响植物生长发育的主要因素,干旱是主要的环境胁迫因子之一。耐旱藓类多为耐旱植物的一种,其外部结构、生理生化特征均具有对干旱胁迫的响应性,在干旱荒漠地区中荒漠生态系统恢复与重建、防风固沙、水土保持和养分循环等方面...
- 马瑞
- 关键词:同源克隆干旱胁迫抗旱基因生理生化特征
- 文献传递
- 荒漠齿肋赤藓抗旱基因ScALDH21、Sc288对干旱胁迫的响应
- 环境胁迫是影响植物生长发育的主要因素,干早是主要的环境胁迫因子之一。耐旱藓类多为耐旱植物的一种,其外部结构、生理生化特征均具有对干旱胁迫的响应性,在干旱荒漠地区中荒漠生态系统恢复与重建、防风固沙、水土保持和养分循环等方面...
- 马瑞
- 关键词:半定量RT-PCR同源克隆QRT-PCRRACE干旱胁迫
- 文献传递