顾胤聪
- 作品数：4 被引量：22H指数：1
- 供职机构：南京林业大学更多>>
- 发文基金：江西省科技支撑计划项目江西省自然科学基金国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- 油茶454序列中的微卫星观察与分析
- 采用MISA软件挖掘普通油茶、浙江红山茶和短柱茶三油茶物种的454测序得到的基因组及转录组序列中的微卫星信息.结果显示,微卫星出现频率大小依次为短柱茶EST(0.056)＞浙江红山茶EST(0.055)＞普通油茶EST(...
- 温强顾胤聪王建文徐林初黄敏仁徐立安
- 关键词：油茶微卫星
- 一种银杏品种分子检测引物组合物及其品种检测方法
- 本发明公开了一种银杏品种分子检测引物组合物及其品种检测方法，专用于果用银杏品种的快速分子检测与鉴定，属于植物新品种分子鉴定领域。设计了8对SSR引物，并利用它们成功构建了48个果用银杏品种指纹图谱，可快速、准确地区分各银...
- 徐立安周琦王星星胥猛陶园园顾胤聪
- 一种银杏品种分子检测引物组合物及其品种检测方法
- 本发明公开了一种银杏品种分子检测引物组合物及其品种检测方法，专用于果用银杏品种的快速分子检测与鉴定，属于植物新品种分子鉴定领域。设计了8对SSR引物，并利用它们成功构建了48个果用银杏品种指纹图谱，可快速、准确地区分各银...
- 徐立安周琦王星星胥猛陶园园顾胤聪
- 文献传递
- 基于454测序的油茶DNA序列微卫星观察与分析被引量：22
- 2013年
- 采用MISA软件挖掘比较各1/4个454高通量测序反应获得的普通油茶、浙江红山茶和短柱茶EST序列及普通油茶基因组序列中的微卫星信息。结果显示:3个种的EST序列微卫星出现频率大小相近,普通油茶EST序列的微卫星出现频率高于其基因组序列的;在所有被检索序列的二至六碱基微卫星中,均以二碱基微卫星最多(>55%),并以(AG)n类型为主,但三碱基微卫星在所有EST序列中以(AAG)n类型最多,而在普通油茶基因组序列中则以(AAT)n最多;除六碱基微卫星外,二至五碱基微卫星均表现为不同微卫星重复单元的丰度随着微卫星碱基长度增加而减少。在转录组序列中,除六碱基微卫星之外,不同微卫星单元重复数的变异与重复单元长度呈负相关,推测二碱基微卫星理论多态性最高,而五碱基微卫星理论多态性最低;对在无冗余独立基因各区域中的微卫星进行统计,显示分布比例依次为3'UTR>CDS>5'UTR,在相同区域内比较,UTR区域中二碱基微卫星占总数量比例最大,CDS区域内三碱基微卫星的比例最高,此外5'UTR区域的三碱基微卫星的分布比例均高于3'UTR,初步推断5'UTR区域的微卫星相对3'UTR要保守些。
- 温强徐林初江香梅李江顾胤聪徐立安黄敏仁
- 关键词：山茶属微卫星
