陈汉奎
- 作品数：8 被引量：29H指数：3
- 供职机构：中山大学肿瘤防治中心更多>>
- 发文基金：国家重点基础研究发展计划国家自然科学基金中华医学基金会基金更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- 一个鼻咽癌家系中存在COX7B2基因的低频变异被引量：1
- 2004年
- 在中国南方鼻咽癌(nasopharyngealcarcinoma,NPC)高发地区,遗传易感性在鼻咽癌发病中起重要作用,在4p11-4p14区域存在一个鼻咽癌易感位点.采用PCR-直接测序法对位于该区域内的细胞色素C氧化酶亚单位Ⅶb2(COX7B2)基因进行单核苷酸多态性(singlenucleotidepolymorphism,SNP)筛查,对发现的变异在家系患者、散发病例和正常人群中进行分型分析,探讨COX7B2基因变异是否与鼻咽癌有关.在COX7B2基因中共发现5个新的SNP位点,分别位于上游启动子区(-158101G>T和-157322G>A)、第2内含子区域(-109602A>G)、第3外显子区(78T>A)和3 -非翻译区(354T>A).位于第3外显子编码区的78T>A变异导致CAT26CAA(His26Gln)改变,在31号鼻咽癌家系中与患者易感单体连锁,但不存在于其他家系患者和散发病人中.在广东地区和华东地区对照个体中78T>A变异的频率分别为0.45%(2/448)和0.26%(1/384),在白人、黑人样本中没有发现该变异.蛋白质序列比对显示COX7B2亚基26His位点在人、大猩猩、黑猩猩、长臂猿、大鼠和小鼠中十分保守.上述结果提示COX7B2基因26His是一个保守的位点,低频的His26Gln变异可能与31号家系的鼻咽癌高发有关.
- 梁慧陈汉奎沈亚云冯启胜金玮黄薇曾益新
- 关键词：鼻咽肿瘤单核苷酸多态性保守性
- 单体型分析将家族性鼻咽癌易感基因定位于4p11～p14区域被引量：13
- 2003年
- 前期研究把家族性鼻咽癌(NPC)候选易感位点定位在长度约14.21cM的4p15.1～q12区域上,但由于微卫星标记D4S2996和D4S428没有提供足够信息,这个区域的远端边界没有得到最大程度的确定.在两个主要的NPC家系中采用一组微卫星标记和单核苷酸多态性标记进行单体型分析,将NPC易感区域的远端边界确定于D4S1577和D4S3347之间,并将该区域缩小到长度为8.29cM的4p11～p14区域.
- 陈汉奎冯炳健梁慧张如华曾益新
- 关键词：单体型分析肿瘤易感基因基因定位
- 鼻咽癌中KLF6基因突变的检测被引量：5
- 2002年
- 背景与目的:鼻咽癌(nasopharyngealcarcinoma,NPC)高发于中国南方和东南亚地区,其发病是一个多因素、多步骤的过程,与遗传因素、EB病毒感染和环境因子有关,但分子机理仍不清楚。KLF6基因编码一种广泛表达的核转录因子,在某些前列腺癌肿瘤中发现有高频的等位基因的丢失和基因突变。本研究通过对KLF6基因在NPC肿瘤中的突变检测,探讨KLF6基因与NPC发病的关系。方法:采用PCR-直接测序分析方法,在19例散发性NPC组织细胞和3个NPC细胞系(CNE1,CNE2,SUNE1)中对KLF6编码区和拼接位点进行检测。结果:在3例散发性NPC肿瘤组织DNA中检测到KLF6基因的3个不同位置的错义改变,分别为GAG→GTG(Glu75Val)、AGC→AGG(Ser136Arg)和AGA→AAA(Arg243Lys),在50个随机正常个体(100条染色体)和3个NPC细胞系中没有发现这3个位点的碱基变异。结论:这3个变异可能是KLF6基因的新的突变位点,在某些NPC发病中可能有作用。
- 陈汉奎刘晓琼林洁陈天渝冯启胜曾益新
- 关键词：基因突变鼻咽肿瘤NPC
- 原发性肝细胞癌RIT1基因的突变和扩增被引量：1
- 2004年
- 目的 探讨 RIT1基因突变和扩增在肝细胞癌 (hepatocellular carcinoma,HCC)的发生情况及其与发病的关系。 方法 采用 PCR直接测序法检测 5 0例原发性 HCC患者的肝癌组织和非癌肝组织RIT1基因在所包含的 6个外显子的全序列寻找突变位点 ;并用荧光定量 PCR法检测 RIT1基因的扩增情况。 结果 在 5 0例肝癌组织中 1例出现第 5外显子编码区 2 4 1位核苷酸 G/ C变异 ,其对应密码子改变为GAG81CAG,编码氨基酸改变为 Glu81Gln,该氨基酸变异位于 GTP结合的保守功能域内 ,该病例的非癌肝组织以及其余 4 9例的肝癌组织和非癌肝组织均未发生此种改变 ;在 5 0例肝癌组织和非癌肝组织中均出现 5′- UTR(起始密码子前 2 1位核苷酸 ) G/ C变异 ;在获得有效扩增数据的 4 3例肝细胞癌患者中 ,11例有 2～2 97倍的 RIT1基因扩增 ,扩增率为 2 5 .6 %。 结论 基因扩增是 RIT1基因在肝细胞癌的激活方式之一 ,可能与肝细胞癌的发病有关 ,而点突变方式可能意义不大。
- 李锦添刘伟邝志和张如华陈汉奎冯启胜
- 关键词：原发性肝细胞癌突变扩增
- RIT1基因在肝细胞癌中的扩增及其临床意义被引量：2
- 2003年
- 背景与目的:已有的研究显示肝细胞癌的染色体1q有高频扩增,1q21-22是最小的高频扩增区带之一,可能存在肝细胞癌相关的候选癌基因。RIT1基因位于1q21.3区带,是Ras的亚家族成员,RIT1蛋白在分子结构和功能方面与Ras蛋白非常相似,推测RIT1基因可能是肝细胞癌的候选癌基因之一。因此,本研究通过检测肝细胞癌RIT1基因的扩增情况,并与临床指标相联系,探讨该基因对肝细胞癌发生和发展的可能作用。方法:建立荧光定量PCR的方法,在PEABI7000型荧光定量PCR仪上检测43例肝细胞癌患者手术切除的癌组织及远癌肝组织RIT1基因的拷贝数,并用癌组织与癌旁肝组织基因拷贝数的比值作为RIT1基因的扩增倍数。结果:在43例肝细胞癌患者中,11例有RIT1基因的扩增,扩增率为25.6%;将基因扩增组与非扩增组比较,基因扩增组的生存期(平均15个月)明显短于非扩增组(平均34个月),P=0.0009,且在病理分级和肝硬化程度方面也具有明显的差异,P<0.01。结论:基因扩增可能是癌基因RIT1在肝细胞癌的激活方式之一,该基因的扩增可能对肝细胞癌的发生发展起一定的作用。
- 李锦添刘伟邝志和陈汉奎李大疆冯启胜刘启才胡斌
- 关键词：肝细胞癌扩增荧光定量PCR
- 携带SARS-CoV刺突蛋白N端片段重组腺病毒的构建被引量：2
- 2005年
- 【目的】构建携带 SARS 冠状病毒刺突蛋白 N 端基因片段的重组腺病毒。【方法】从 SARS 病毒 cDNA 扩增刺突蛋白 N 端基因片段(-45～1469nt,截短的 S1区,S_N),插入腺病毒穿梭质粒 pShuttle,通过体外连接法构建重组腺病毒Ad-S_N。用 Ad-S_N 感染 Vero-E6细胞,通过 RT-PCR 和 Western blot 法检测 S_N 的表达。【结果】克隆的 S_N 基因序列与文献报道基本一致;Ad-S_N 基因组结构与预期一致。在 Ad-S_N 感染的 Vero-E6细胞中存在 S_N 基因的转录和分泌型 S_N 蛋白的表达。【结论】体外连接法是一种简便易行的重组腺病毒载体构建方法;重组腺病毒 Ad-S_N 能正确表达分泌型 S_N 蛋白,可用于诱导抗 SARS 免疫的动物实验研究。
- 刘然义黄必军黄嘉凌吴立志张如华陈汉奎曾益新黄文林
- 关键词：SARS病毒刺突蛋白
- 用PCR-SSP技术对HLA-DRB基因分型的研究
- 该研究的内容是:1、建立用PCR-SSP技术来准确、快速、简便地进行HLA-DR基因分型的实验方法.希望以之代替血清学方法用于肾/骨髓移植的临床配型工作中;2、用PCR-SSP方法对102例中国广东地区汉族人无亲缘关系健...
- 陈汉奎
- 关键词：HLA-DRPCR-SSP基因分型风湿性心脏病
- SEMA3B、SEMA3F基因在鼻咽癌细胞中突变和表达的研究被引量：6
- 2003年
- 背景与目的:鼻咽癌(nasopharyngealcarcinoma,NPC)致病的分子机理至今仍不清楚,但高频的杂合性缺失和功能学证据均表明染色体3p21.3区段中存在着与鼻咽癌相关的抑癌基因。SEMA3B和SEMA3F基因是定位于3p21.3的两个semaphorin家族成员,最近被鉴定为抑癌基因。本研究通过对SEMA3B和SEMA3F基因在鼻咽癌中的突变和表达检测,探讨SEMA3B和SEMA3F基因与鼻咽癌发病的关系。方法:采用PCR-直接测序方法,在21例散发性NPC组织和2例NPC细胞株(CNE2,SUNE1)中对SEMA3B和SEMA3F基因的编码区、拼接位点和部分调控区进行突变检测;利用半定量RT-PCR方法,检测SEMA3B和SEMA3F基因在鼻咽癌中的表达。结果:在鼻咽癌中未发现SEMA3B或SEMA3F基因具有体细胞突变,但在SEMA3B基因中发现两个导致氨基酸改变的单核苷酸多态性Thr415Ile和Ile242Met。在Thr415Ile多态位点中,可导致SEMA3B基因功能缺陷的Ile等位基因频率在鼻咽癌患者中占有较高比例(64%,27/42)。SEMA3BmRNA在6例鼻咽非癌组织中正常表达,但在76%(16/21)的鼻咽癌组织中表达下调或缺失;SEMA3FmRNA的表达水平在鼻咽癌和非癌组织中无明显差异。结论:SEMA3BmRNA在鼻咽癌中发生高频表达缺失说明该基因失活与鼻咽癌密切相关,SEMA3B基因可能是定位于染色体3p21.
- 刘晓琼孙敏陈汉奎李京湘潘志刚龙綮新王珣章曾益新
- 关键词：基因突变杂合性缺失鼻咽癌
