费琦
- 作品数：5 被引量：17H指数：3
- 供职机构：上海交通大学更多>>
- 发文基金：国家高技术研究发展计划国家重点基础研究发展计划上海市基础研究重大（重点）项目更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学更多>>
- 肝癌中Sall3基因甲基化的研究被引量：1
- 2010年
- 目的:检测Sall3基因在肝癌细胞系和肝癌组织中的甲基化状况及其表达水平。方法:对7株肝癌细胞系、142对肝癌组织和6例正常肝组织进行Sall3基因启动子区域甲基化检测。甲基化研究使用甲基化特异性聚合酶链反应(methylation specific polymerase chain reaction,MSP),基因表达水平研究采用实时定量反转录PCR(real-time RT-PCR)。结果:MSP结果显示,7株肝癌细胞株中有6株Sall3基因的启动子区域为纯合甲基化,1株为纯合去甲基化;在6例正常肝组织中Sall3均为纯合去甲基化;在142对肝癌组织标本中,癌旁组织Sall3基因启动子区域甲基化率为18.31%,在癌组织中为64.79%。real-time RT-PCR结果显示,肝癌肿瘤细胞系Sall3mRNA的表达水平明显低于去甲基化的正常肝组织。结论:Sall3基因启动子甲基化在正常肝组织、肝癌组织(和肝癌细胞系)中有明显差异。
- 夏卫倪唯益费琦孙晋枫赵仰星张宏宇顾峻何英华余坚
- 关键词：肝癌甲基化特异性聚合酶链反应
- TGF-β1基因rs2241715位点T／T基因型人群患HBV感染相关性疾患的风险更高
- 2008年
- 目的：确立3个在亚洲人群中高频杂合的TGF-β1单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism，SNP）新位点与HBV感染相关性疾病易感性的关系。方法：采用基因型特异性PCR方法，对129例HBV感染相关性疾病患者（慢性乙型肝炎74例、肝硬化41例、肝癌14例）和41例健康人对照的外周血细胞基因组DNA的TGF-β1基因中，3个在亚洲人群中呈高频率杂合的SNP位点（rs2241715、rs2241716、rs4803455）进行基因分型。结果：正常人的rs2241715基因型及等位基因频率与慢性乙型肝炎、肝硬化和肝癌相比差异有统计学意义（P〈0．05）。rs2241715 T／T基因型的个体患慢性乙肝和肝硬化的相对风险度分别为其他型者的2．974倍（95％CI=1．209—7．314，P=0．018）和3．228倍（95％CI=1．201—8．675，P=0．020）。rs2241716和rs4803455位点的谱式则无上述的相关性。结论：TGF-β1基因的rs2241715 SNP位点T／T基因型可能是慢性乙肝病毒感染相关疾患的易感因素。
- 龚邦东余坚黄朝晖杜德林李仲平李宇舟费琦孙晋枫唐志红朱景德
- 关键词：乙型转化生长因子Β单核苷酸
- 肝癌细胞系中肝癌转移相关候选基因启动子区域CpG岛甲基化和表达水平的相关性研究(英文)被引量：7
- 2004年
- 背景与目的:DNA甲基化被认为是反映细胞内DNA转录状态的重要表观遗传学标记。本研究旨在对启动子区域CpG岛的甲基化与基因转录水平的相关性进行评估。方法:采用甲基化特异性PCR的方法确定7个与肝癌转移相关的候选基因的启动子区域在6个肝细胞系(包括5个肝癌源性的)中的甲基化状态,并通过半定量PCR的方法确定6个基因稳定态的mRNA水平。结果:仅有纯合和杂合去甲基化的基因状态得到发现。RT-PCR分析表明除了OXCT基因在其处于杂合去甲基化状态的HepG2和HCCLM3细胞中不表达,在其他的情况下,7个候选基因均有表达。讨论:本研究中的7个肝癌转移相关基因的甲基化状态仅在细胞系中部分的反映了基因的转录状态,提示其它转录调控机制的存在。
- 李建良费琦余坚张红宇王鹏朱景德
- 关键词：肝细胞肝癌甲基化甲基化特异性PCR
- 抑制VEGF表达的锤头状核酶系统被引量：3
- 2005年
- 目的:建立和评估抑制血管内皮生长因子(VEGF)表达的锤头状核酶(hammerhead ribozyrae)技术系统。方法:对VEGF121基因RNA序列进行二级结构分析,选择靶点;设计并构建针对VEGF的分泌肽RNA的可表达锤头状核酶(1-4)载体系统和VEGF-荧光色素酶融合基因报告质粒;通过试管内切割实验等方法评估核酶对于试管内转录得到的VEGF RNA切割特异性和效率; 通过瞬时共转染实验和稳定转染实验评估核酶在细胞内对于VEGF RNA的切割效率。结果:设计和构建了对VEGF RNA二级结构水平上的暴露区(+8,+36和+71位点:核酶1,3和4)和非暴露区(+17位点:核酶2)4个锤头状核酶(1-4)的两套质粒;试管内切割检测表明,针对+8,+36和+71位点的核酶(1,3和4)可以有效地在试管内对VEGF RNA进行特异性切割,使其水平分别降至对照的61.7%,27.6%和44.8%(荧光色素酶活性)或66.3%,27.0%和30.0%(蛋白质水平);将核酶表达质粒与VEGF-LUC模板质粒瞬时共转染入SMMC-7721肝癌细胞,核酶1,3和4 VEGF-LUC水平分别降低到对照的81.4%,56.6%和69.1%;稳定表达针对VEGF 的核酶1,3或4的SMMC-7721细胞株中,内源性VEGF RNA的水平降至对照水平的5%以下。对照未转染的、转染空载体的和转染了核酶2(+17)的SMMC-7721细胞。结论:分别针对VEGF+8,+36和+71位点锤头状核酶可有效地抑制VEGF的RNA水平。
- 李晶费琦杨剑峰高宝梅戴信兰张红宇朱景德
- 关键词：血管内皮生长因子锤头状核酶抗血管生成
- 抗凋亡基因bcl-2启动子CpG岛的高甲基化状态见于28.3%(13/46例)的膀胱癌患者尿沉淀细胞DNA被引量：6
- 2006年
- 目的:检测上海地区膀胱癌患者尿沉淀细胞中3个肿瘤相关基因启动子CpG岛的甲基化谱式异常频率,继而评估其应用前景。方法:采用甲基化特异性PCR方法分析尿沉淀细胞DNA中DAPK1、bcl2和hTERT3个基因的启动子CpG岛甲基化状态,并通过RTPCR方法评估DAPK1基因在膀胱癌细胞系中的表达状态。结果:对膀胱癌细胞系中DAPK1基因的启动子CpG岛甲基化状态及其表达(mRNA水平上)所做的分析,确立了高甲基化状态与表达静息化之间的相关性。对46例临床确诊的膀胱癌患者和84例非膀胱癌对照(包括前46例术后的36例)的尿沉淀细胞中DNA甲基化的分析发现,仅bcl2基因的高甲基化见之于28.3%(13/46例)的膀胱癌患者,而84例的对照中均为去甲基化状态。结论:在美国膀胱癌患者尿沉淀细胞中频发DNA高甲基化的靶点在上海地区膀胱癌患者人群中频率很低,因此寻找在后者中频发DNA高甲基化的新靶点实属必要。
- 顾连平余坚费琦张红宇徐慧莉顾峻朱同玉朱景德
- 关键词：基因,BCL-2CPG岛甲基化特异性聚合酶链反应
