杨玉婷
- 作品数：5 被引量：43H指数：3
- 供职机构：福建农林大学更多>>
- 发文基金：国家现代农业产业技术体系建设项目福建省自然科学基金福建省教育厅A类人文社科/科技研究项目更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 甘蔗金属硫蛋白基因(ScMT2-1-4)的克隆及表达分析被引量：21
- 2015年
- 从甘蔗热带种Badila(Saccharum officinarum L.)中克隆获得1个2型金属硫蛋白基因的c DNA序列,命名为Sc MT2-1-4(Gen Bank登录号:KJ504375)。生物信息学分析显示,Sc MT2-1-4基因c DNA长459 bp,开放读码框为243 bp,编码80个氨基酸,富含14个半胱氨酸残基。推导的Sc MT2-1-4蛋白为亲水性蛋白,分子量为7.82 k D,等电点为5.59,该蛋白的二级结构由无规则卷曲和延伸链构成。实时荧光定量PCR检测结果显示,Sc MT2-1-4基因是重金属胁迫的快速响应基因,其对Cu2+、Zn2+和Cd2+胁迫的应答模式提示了:甘蔗不同组织中Sc MT2-1-4对Cu2+胁迫应答的分功不同;Sc MT2-1-4对甘蔗抵御Zn2+胁迫起积极的作用;但该基因不直接参与甘蔗对Cd2+的螯合和解毒的过程。研究结果有助于进一步深入探究MT2基因在甘蔗应答重金属胁迫过程中的作用,为阐明甘蔗富集和耐受重金属的分子机制研究奠定基础。
- 陈云王竹青傅志伟杨玉婷郭晋隆苏亚春许莉萍
- 关键词：甘蔗金属硫蛋白重金属实时荧光定量PCR
- 正响应盐胁迫的甘蔗6-磷酸葡萄糖脱氢酶基因的克隆被引量：2
- 2014年
- 从甘蔗中克隆获得1个6PGDH基因的cDNA序列,记为Sc6PGDH(登录号:KF921299).该基因序列含有1个1467 bp的完整开放阅读框,推导编码488个氨基酸残基.生物信息学分析可知,Sc6PGDH基因编码的蛋白分子质量为53.6561 ku,为酸性稳定的亲水蛋白,含有信号肽,可能定位于内质网膜上,具有该类蛋白典型的保守结构域6PGD,且与分离自谷子、玉米和水稻的6-磷酸葡萄糖脱氢酶的氨基酸序列同源性分别高达96.11%、95.70%和93.24%,表明该基因在进化过程中比较保守.原核生物生长试验结果显示,甘蔗Sc6PGDH基因的表达蛋白可以显著增强大肠杆菌Rosetta菌株的耐盐性,推测该基因可能参与了生物体对盐胁迫的应答过程.
- 杨玉婷李国印苏亚春郭晋隆许莉萍
- 关键词：甘蔗生物信息学分析盐胁迫
- 甘蔗响应低温胁迫的转录组分析与冷响应基因挖掘
- 甘蔗(Saccharum spp.)是最重要的糖料作物,占世界食糖总产的80%,占我国的90%以上。甘蔗起源于热带,经长期驯化主要在亚热带地区种植,新植和宿根发株均在冬末春初,期间以低温或低温与阴雨相伴天气为主,此时甘蔗...
- 杨玉婷
- 关键词：甘蔗低温胁迫转录组基因挖掘
- 文献传递
- 甘蔗几丁质酶基因ScChiⅦ1的克隆与表达分析被引量：7
- 2014年
- 以甘蔗(Saccharum spp.hybrid)抗黑穗病基因型崖城05-179为材料,采用同源克隆法获得了1个几丁质酶基因全长cDNA序列(GenBank登录号为KF279661),命名为ScChiⅦ1,序列长907 bp,编码299个氨基酸,属于糖苷水解酶第19家族,预测为胞外分泌蛋白且兼具溶菌酶活性。聚类分析显示,该基因与其他植物ClassⅦ几丁质酶基因聚为一类。基因组序列(GenBank登录号为KF279662)分析显示,该基因含有2个长度分别为615 bp和86 bp的内含子。实时荧光定量分析结果表明,甘蔗黑穗病菌胁迫下,ScChiⅦ1在抗病(崖城05-179)和感病基因型(柳城03-182)中差异表达,推测ScChiⅦ1可能参与黑穗病菌胁迫的防御反应。组织特异性表达分析结果显示,ScChiⅦ1在甘蔗叶、芽、皮、肉、根中均有表达,但在芽中表达量最高,推测与该病原从蔗芽侵入有关。研究结果为进一步研究甘蔗几丁质酶基因功能及甘蔗与黑穗病菌互作机制提供了有益的信息。
- 王珊珊苏亚春杨玉婷郭晋隆许莉萍
- 关键词：甘蔗几丁质酶克隆生物信息学分析黑穗病菌
