李国印
- 作品数：8 被引量：63H指数：4
- 供职机构：福建农林大学更多>>
- 发文基金：国家现代农业产业技术体系建设项目国家自然科学基金国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域：生物学农业科学更多>>
- 甘蔗过氧化氢酶基因的电子克隆及生物信息学分析被引量：21
- 2012年
- 应用电子克隆技术,获得甘蔗中一个过氧化氢酶基因的cDNA序列全长,命名为S-CAT。该基因全长2160bp,包含一个1479bp的开放阅读框,编码492个氨基酸。通过PSORT工具,预测甘蔗S-CAT蛋白存在于过氧化物酶体中。同源比对分析显示,S-CAT基因编码的氨基酸序列与水稻、玉米、高粱、朝鲜碱茅、葡萄等植物中过氧化氢酶基因所编码的氨基酸序列高度同源,同源性分别为97%,97%,95%,91%和92%。研究结果为该基因的实验克隆奠定基础。
- 陈珊珊郭晋隆李国印阙友雄许莉萍
- 关键词：甘蔗CAT基因电子克隆生物信息学
- 甘蔗几丁质酶基因的电子克隆与生物信息学分析被引量：19
- 2011年
- 用电子克隆方法获得甘蔗几丁质酶基因SCCHI1,采用生物信息学方法,对该基因编码蛋白从氨基酸组成、理化性质、跨膜结构域、疏水性/亲水性、亚细胞定位、高级结构及功能域等方面进行了预测和分析。结果表明:SCCHI1基因全长1236bp,包含一个完整的990bp的ORF,编码329个氨基酸。SCCHI1基因属于糖苷水解酶19家族,含有N-端信号肽、交连区、催化区,与高粱等其它植物的几丁质酶基因具有高度的相似性。为SCCHI1基因的分子克隆、功能鉴定和应用提供参考。
- 苏亚春李国印阙友雄郭晋隆徐景升许莉萍
- 关键词：甘蔗几丁质酶基因电子克隆生物信息学
- 正响应盐胁迫的甘蔗6-磷酸葡萄糖脱氢酶基因的克隆被引量：2
- 2014年
- 从甘蔗中克隆获得1个6PGDH基因的cDNA序列,记为Sc6PGDH(登录号:KF921299).该基因序列含有1个1467 bp的完整开放阅读框,推导编码488个氨基酸残基.生物信息学分析可知,Sc6PGDH基因编码的蛋白分子质量为53.6561 ku,为酸性稳定的亲水蛋白,含有信号肽,可能定位于内质网膜上,具有该类蛋白典型的保守结构域6PGD,且与分离自谷子、玉米和水稻的6-磷酸葡萄糖脱氢酶的氨基酸序列同源性分别高达96.11%、95.70%和93.24%,表明该基因在进化过程中比较保守.原核生物生长试验结果显示,甘蔗Sc6PGDH基因的表达蛋白可以显著增强大肠杆菌Rosetta菌株的耐盐性,推测该基因可能参与了生物体对盐胁迫的应答过程.
- 杨玉婷李国印苏亚春郭晋隆许莉萍
- 关键词：甘蔗生物信息学分析盐胁迫
- 甘蔗MYB2转录因子的电子克隆和生物信息学分析被引量：20
- 2011年
- 用电子克隆方法获得甘蔗MYB2基因,采用生物信息学方法,对该基因编码蛋白从氨基酸组成、理化性质、跨膜结构域、疏水性/亲水性、亚细胞定位、高级结构及功能域等方面进行了预测和分析。结果表明:甘蔗MYB2基因全长991bp,包含570bp的ORF,编码189个氨基酸。甘蔗MYB2基因包含有MYB功能域,在序列组成、高级结构及活性位点等方面,与玉米等其它植物的MYB2基因具有高度的相似性。研究结果为该基因的实验克隆奠定基础。
- 李国印阙友雄许莉萍郭晋隆闫学兵陈如凯
- 关键词：甘蔗电子克隆生物信息学
- 甘蔗MYB转录因子生物信息学分析、基因克隆与表达
- 转录因子(Transcription factor, TF)也称反式作用因子,是一类能够与基因启动子区域中顺式作用元件、沉默子或增强子发生特异性结合并相互作用,从而激活或者抑制目的基因转录和翻译的DNA结合蛋白。前人研究...
- 李国印
- 关键词：甘蔗MYB转录因子基因结构生物信息学实时定量PCR
- 文献传递
- 植物MYB转录因子的同义密码子使用偏好性分析被引量：2
- 2013年
- 前人研究显示MYB(V-myb avian myeloblastosis viral oncogene homolog)转录因子对应答植物逆境胁迫等有重要作用,甘蔗MYB转录因子的研究报道并不太多。通过对与甘蔗亲缘关系近的禾本科作物玉米、高粱和水稻MYB转录因子基因家族的密码子使用偏好性进行比较分析。结果表明,3个物种的MYB转录因子的蛋白质序列上存在高度的保守性,仅有部分密码子使用不太一样,此外,分析还显示基因碱基组成有可能在一定程度上影响了密码子的偏好使用。
- 黄宁李国印郭晋隆许莉萍阙友雄
- 关键词：MYB转录因子同义密码子
- 基于表达序列标签的简单重复序列标记开发策略被引量：3
- 2011年
- 作为一种新型分子标记,表达序列标签-简单重复序列(EST-SSR)来自表达基因,因此除具备来源于传统基因组的SSR标记的所有优势外,还与基因功能表达具有直接或间接的关系,从而强化了SSR标记在遗传研究中的应用。我们简要介绍了EST-SSR标记的开发策略、方法及其应用进展,总结了其中存在的一些问题,目的是为今后该领域的研究提供一定的参考。
- 闫学兵阙友雄许莉萍李国印
- 关键词：表达序列标签简单重复序列
