张贺翠
- 作品数:53 被引量:122H指数:6
- 供职机构:西南大学农学与生物科技学院更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金中央高校基本科研业务费专项资金重庆市自然科学基金更多>>
- 相关领域:农业科学生物学文化科学轻工技术与工程更多>>
- 利用酵母双杂交系统检测SCR蛋白不同区段与SRK蛋白胞外域高变区的相互作用
- 薛丽琰罗兵张贺翠杨永军杨红彭一波朱利泉
- 甘蓝PMEI家族基因结构、基因组分布和表达分析
- 2019年
- 为了弄清甘蓝PMEI家族基因成员数、基因结构和分布及其与自交不亲和性的关系,利用转录组测序和相关生物信息学方法对其进行了基因结构分析和全基因组鉴定,对家族基因进行了表达谱分析,并通过实时荧光定量PCR技术验证了基因的表达情况。结果表明,甘蓝中PMEI家族包含101个基因,分为11组,其成员不均匀分布在9条染色体上,主要通过全基因组三倍体复制(whole genome triplication,WGT)和串联复制事件进行倍增,与拟南芥在1556万年前发生分化。数字表达谱分析发现在101个基因中,BoPMEI56、BoPMEI54、BoPMEI32、BoPMEI29、BoPMEI78、BoPMEI30、BoPMEI57、BoPMEI58和BoPMEI84这9个基因在自花和异花授粉后表达趋势有明显差异。荧光定量PCR结果显示,其在自花授粉和异花授粉的表达变化趋势与转录组分析结果基本一致。这些结果表明:BoPMEI家族的101个成员中,可能至少有9个基因以不同方式参与调控甘蓝自花和异花授粉后的反应过程,可能与甘蓝自交不亲和性有关。
- 白晓璟王玉奎左同鸿刘倩莹廉小平张贺翠张以忠蒲敏罗绍兰朱利泉
- 关键词:甘蓝生物信息学
- 氮肥基追比对成熟期烤烟农艺性状及不同部位烟叶光合特性的影响被引量:1
- 2022年
- 通过改善施肥技术,进一步提高黔江地区烟叶品质。在大田试验条件下,以云烟87为材料研究不同基追肥配比(T_(1)=9∶1,T_(2)=8∶2,T_(3)=7∶3和T_(4)=6∶4)对黔江地区烤烟农艺性状和不同部位烟叶光合特性的影响。结果表明,不同处理对成熟期烤烟株高、节距、最大叶宽和最大叶面积影响不大,T_(3)处理烤烟株高、节距、最大叶宽和最大叶面积略优于其他处理;成熟期不同部位烟叶净光合速率有显著差异,表现为上部叶>中部叶>下部叶,气孔导度从上部叶到下部叶呈逐渐下降趋势;不同处理对烤烟经济性状的影响较大,其产值分别为处理T_(2)(54294.23元/hm^(2))>处理T_(3)(50110.61元/hm^(2))>处理T_(1)(42015.12元/hm^(2))>处理T_(4)(37023.14元/hm^(2)),处理T_(2)的产值、产量和上等烟比例最大。综合来看,基追肥处理为7∶3时烤烟的农艺性状最好,基追肥处理为8∶2时烤烟的经济性状最高。根据优质适产原则,黔江地区可推广8∶2的基追肥配比措施。
- 吴慧杰杨超张学杰张贺翠刘义梅袁崇墨朱利泉李勇
- 关键词:氮肥基追比烤烟农艺性状光合特性
- 土壤改良剂对烟草成熟期根茎病害发生和农艺性状的影响被引量:5
- 2020年
- 在常规施肥条件下,分别以牡蛎粉、蚯蚓粪、碳基肥、缓控肥为土壤改良剂,以不施用土壤改良剂为对照,在重庆黔江区开展小区试验,研究土壤改良剂对烤烟品种云烟87成熟期烟草青枯病、黑胫病、空茎病和花叶病4种病害的防控作用及其烟草农艺性状的影响.结果表明:土壤施用碳基肥对青枯病的相对防效最高,为54.92%,施用牡蛎粉对黑胫病和花叶病的相对防效最高,分别为62.01%和51.28%,施用缓控肥对空茎病的相对防效最高,为74.68%.土壤改良剂处理后大多数的农艺性状与对照无显著性差异.
- 单晓鹏张水翔张贺翠陈少鹏张学杰冉景祥
- 关键词:烟草土壤改良农艺性状
- 甘蓝SCR、THL与SRK交替相互作用的酵母双杂交检测被引量:2
- 2012年
- eSRK(S位点受体激酶胞外域)、SCR/SP11(S位点富含半胱氨酸蛋白-S位点蛋白11)和THL1(类硫氧还蛋白)是甘蓝自交不亲和性信号传导过程重要的3个元件。利用PCR技术获得两种甘蓝SCR2(class-Ⅱ)、eSRK2(class-Ⅱ)、THL1、SRKJ(class-Ⅰ,SRK6激酶域)和eSRK28(class-Ⅰ)的编码序列,并分别构建以pGBKT7为载体的SCR2、THL1的重组诱饵质粒和以pGADT7为载体的eSRK2、eSRK28、SRKJ的重组猎物质粒。利用酵母双杂交系统验证eSRK2-SCR2、eSRK28-SCR2、SRKJ-THL1的相互作用。重组质粒在宿主细胞中未产生毒性及自激活作用,表明重组表达载体构建成功;组合Y2HGold〔pGBKT7-SCR2〕×Y187〔pGADT7-eSRK2〕在三缺平板(SD/-Trp-Leu-His/x-α-gal/AbA,TDO/x/A)上生长出蓝色克隆,激活了报告基因AUR1-C、MEL1、HIS3;组合Y2HGold〔pGBKT7-SCR2〕×Y187〔pGADT7-eSRK28〕能够在二缺平板(SD/-Trp-Leu)上生长,但在三缺平板上不生长,表明不同单倍型SRK-SCR可能不发生相互作用;组合Y187〔pGADT7-SRKJ〕×Y2HGold〔pGBKT7-THL1〕能够在四缺平板上生长,激活了4种报告基因(AUR1-C、MEL1、HIS3、ADE2)。相同的单倍型SRK与SCR之间能够相互作用,不同的单倍型之间不会发生相互作用;酵母中报告基因表达的数目和类型的差异反映了class-Ⅱ型内部的SCR-SRK和class-Ⅰ的SCR-SRK互作强度,Ⅰ型高于Ⅱ型;THL与SRK之间存在较高的互作强度。这为Ⅰ型和Ⅱ型不同的自交不亲和性表型所依赖的3个起始信号传导元件之间的识别程度差异提供了直接证据和新内容。
- 杨永军张贺翠杨昆薛丽琰常登龙朱利泉
- 关键词:甘蓝
- eSRK_s酵母双杂交诱饵载体的构建及其自激活作用的检测
- 2011年
- 为研究甘蓝自交不亲和决定因子S位点富含半胱氨酸蛋白/S位点蛋白11(SCR/SP11)与S位点受体激酶(SRK)胞外域高变区(eSRKs)的相互作用,构建了eSRKs基因的酵母双杂交诱饵载体,检测其自激活作用,并验证是否适用于后续的相互作用研究.以甘蓝B3为材料,通过RT-PCR技术获得eSRKs目的基因片段,将其克隆到pGBKT7载体中,构建酵母双杂交诱饵载体pGBKT7-eSRKs;测序正确后,将重组质粒转入Y2HGold,检测其表达产物对酵母细胞有无毒性以及对报告基因有无自激活作用,结果获得了正确的eSRKs基因片段,并成功克隆到pGBKT7诱饵载体中,且转化在有诱饵载体pGBKT7-eSRKs的Y2HGold在SD/-Trp营养缺陷平板上生长良好,表明表达产物对酵母细胞无毒性;显色反应结果表明对报告基因也无自激活作用,为下一步利用酵母双杂交系统检测SCR蛋白与SRK蛋白胞外域高变区的相互作用奠定基础.
- 杨红朱利泉彭一波罗兵杨昆张贺翠吴志刚黄丹高启国
- 关键词:酵母双杂交自激活作用
- 利用酵母双杂交系统鉴定羽衣甘蓝ARC1与结球甘蓝SRK激酶结构域的相互作用
- 自交不亲和性(Self—incompatibility, SI)是一种“钥匙和锁”形式防止开花植物自交的机制,研究比较深入的甘蓝等芸薹属植物的自交不亲和反应从S基因座的两个基因相互识别开始,雄性决定因子SCR (S lo...
- 张贺翠
- 关键词:自交不亲和甘蓝酵母双杂交
- 甘蓝自交不亲和信号转导元件ARC1与EXO70A1的相互作用被引量:3
- 2011年
- 从甘蓝型油菜与羽衣甘蓝柱头中克隆出ARC1与EXO70A1基因的编码区,序列分析显示推导的甘蓝型油菜ARC1比羽衣甘蓝ARC1少编码2个氨基酸,ARC1蛋白在羽衣甘蓝与甘蓝型油菜中存在45个氨基酸的差异,其序列相似度与一致性分别达到95.9%和93.9%;推导的EXO70A1在2种植物中仅有6个氨基酸的差异,其序列相似度与一致性分别达到99.4%和98.9%;EXO70A1蛋白在种内和物种间都保持着高度的保守性,其保守的程度高于ARC1。应用酵母双杂交系统检测2种蛋白质的相互作用,发现在二倍体酵母细胞中,全长的ARC1与EXO70A1之间存在较强的相互作用,能激活4个报告基因(ADE2、HIS3、AUR1-C和MEL1)的表达;去除C-端(包括臂重复区)316个氨基酸残基后的ARC1N与EXO70A1之间表现出较弱的相互作用,只能激活3个报告基因(ADE2、AUR1-C和MEL1)的表达,表明ARC1的臂重复区可能并不位于ARC1与EXO70A1的互作界面的核心区段,ARC1的N-端结构域对ARC1与EXO70A1互作起关键作用;同时发现不同ARC1-EXO70A1组合的互作强度相当,其可能原因是ARC1和EXO70A1在甘蓝与甘蓝型油菜中存在的这些序列差异并未影响ARC1-EXO70A1互作界面的构象。
- 杨昆张贺翠Richard CONVERSE朱利泉杨永军薛丽琰罗兵常登龙高启国王小佳
- 关键词:自交不亲和蛋白质相互作用酵母双杂交
- 蔬菜硝酸盐含量测定方法的改进被引量:13
- 2014年
- 针对水杨酸消化比色法测定植物体内硝酸盐含量中存在的问题,经过优化筛选,将此测定方法的提取条件优化为:温度90℃、时间30 min;每10 g绿色蔬菜加入0.2 g活性炭能消除颜色的影响,回收率达到96%。
- 李帮秀张贺翠王三根万华方杨昆刘文清
- 关键词:蔬菜硝酸盐
- EXO70在拟南芥和水稻基因组中的倍增被引量:2
- 2015年
- 作为胞泌复合体的一个重要组件,EXO70在人类、小鼠及酵母中均由单基因编码.为研究EXO70在拟南芥和水稻基因组中倍增的异同,从拟南芥和水稻基因组中钓取所有的EXO70家族基因,分析后发现,拟南芥中包含23个EXO70基因,其中15个基因位于染色体的负链;选择性剪接的存在共产生27种成熟的m RNA.水稻中共发现47个EXO70基因座,它们分别分散于12条染色体的正负链,其中的29个基因位于正链;分别包含Os EXO70H3和Os EXO70H4在内的11号染色体和12染色体的5′端存在一段约2×106 bp区段的序列高度同源;Os EXO70基因倍增的复杂性高于拟南芥EXO70.EXO70基因在拟南芥和水稻中均存在密码子使用偏好性,At EXO70和Os EXO70的密码子偏好性存在较大的差异.Pfam03081是EXO70蛋白质共有的结构域,且在三维结构上极为保守,这可能决定不同的EXO70蛋白存在相同或相近的功能.结果表明,EXO70在拟南芥和水稻2个物种进化中均存在多次加倍,Os EXO70倍增的次数、方式和复杂性都高于At EXO70;高度保守的Pfam03081可能是决定EXO70蛋白功能的关键因素;像其他基因一样,EXO70同义密码子的偏性模式存在明显的物种特异性.
- 杨昆张毅吕俊赵永斌张贺翠韩叙何光华
- 关键词:基因倍增密码子偏好性