孙宇
- 作品数：82 被引量：638H指数：15
- 供职机构：首都儿科研究所更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金北京市科技计划项目北京市卫生系统高层次卫生技术人才培养项目更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学语言文字建筑科学更多>>
- 肠道病毒EV71及CA16在不同细胞系中细胞病变作用的研究被引量：2
- 2017年
- 目的研究CA16和EV71在4种细胞系中细胞病变作用的差异.方法随机选择滴度相似的EV71轻症、EV71重症和CA16轻症毒株各1株,分别感染RD、Vero、U251和SY5Y细胞,比较3株病毒在细胞病变的形态及程度、感染后的细胞存活率、病毒在细胞中的复制水平和病毒所致凋亡蛋白相关mRNA的表达水平等方面的差别.结果3株病毒的感染在同一细胞系中表现相似.镜下从形态学上无法对三株病毒加以区别;感染后病毒载量均表现为从高到低依次为Vero、RD、SY5Y细胞到U251细胞的顺序;病毒感染后细胞存活率的顺序与细胞内复制水平与相反,两者之间存在类似负相关的趋势.3株病毒的感染在3种细胞系中均有凋亡蛋白caspase-8、9和3相关mRNA的表达,提示可能3种细胞系中凋亡启动的途径相同.结论细胞水平的感染,提示这两种病毒感染所致临床表现的差异性并非单独由病毒所决定.
- 宋风霞赵林清朱汝南邓洁宋秦伟王芳孙宇钱渊
- 关键词：EV71CA16细胞系细胞病变效应
- 北京腹泻儿童中G9-Ⅵ轮状病毒再次出现并呈优势流行被引量：3
- 2016年
- 1994年从北京腹泻儿童中鉴定的国内首例G9型A组轮状病毒(Group A Rotavirus,RVA)株T203属于G9-Ⅵ(VP7基因进化树支Ⅵ),而之后国内流行的G9型RVAs主要属于全球广泛流行的G9-Ⅲ(VP7基因进化树支Ⅲ)。本研究于2010年通过基因测序从北京腹泻儿童中再次鉴定了一例RVA G9-Ⅵ。为了解北京儿童中G9-Ⅵ再次流行的情况,本研究对国内外人G9型RVAs的VP7基因进行多序列比对分析,在G9-Ⅲ和G9-Ⅵ病毒各自VP7基因序列比较保守、彼此间变异集中的区域设计杂交探针,经PCR合成地高辛标记的cDNA探针,建立区分G9-Ⅲ和G9-Ⅵ的斑点杂交方法;结合本实验室前期建立的RVA常见G和P基因型杂交鉴定方法,对2011-2012年门诊腹泻就诊患儿中RVAs的流行进行调查。结果显示G9型检出率最高(43.5%,57/131),其次是G3(30.5%)、G1(12.2%)和G2(11.5%),未发现G4型。P分型结果显示P[8]为主要基因型(85.2%),其次P[4]型(14.8%),未发现P[6]型。对57例G9型RVAs全部进行G9-Ⅲ和G9-Ⅵ杂交鉴定。结果显示:G9-Ⅵ占96.5%,取代G9-Ⅲ(3.5%)成为优势流行的G9型病毒。从VP7基因进化树图上看到,本研究鉴定的北京人RVA G9-Ⅵ同国内外近期多地出现的人RVA G9-Ⅵ进化关系密切,并且和加拿大的猪RVA株F7P4进化距离近。国内外新近重新出现的人G9-Ⅵ RVAs是否在进化过程中获得了比以往广泛流行的RVA G9-Ⅲ更强的传播能力或致病力,值得进一步研究。
- 董慧瑾孙宇赵林清邓莉朱汝南陈冬梅贾立平刘立颖张又钱渊
- 关键词：轮状病毒地高辛斑点杂交
- 柯萨奇病毒A6型所致手足口病临床特征分析被引量：29
- 2015年
- 目的 对柯萨奇病毒A6型（CA6）所致手足口病患儿临床表现进行回顾性分析,总结其临床特点,提高临床诊断水平.方法 制定统一手足口病观察表格,采集2013年4月至2014年12月疑似或临床诊断手足口病患儿的临床资料,留取咽拭子标本,采用实时荧光定量PCR法进行肠道病毒核酸检测,分析CA6阳性手足口病患儿临床特征,并与肠道病毒71型（EV71）和柯萨奇病毒A16型（CA16）阳性手足口病患儿进行比较.结果 经病原学确诊并且临床资料完整的809例手足口患者中CA6阳性198例,EV71阳性244例,CA16阳性367例;CA6组发病年龄均数为2.9±2.1岁,较其余两组发病年龄偏小,发热病例多见,齿龈部疱疹相对少见,躯干皮疹多见,且更具多形性,与其他两组之间差异均存在统计学意义（PEV71/CA6、PCA16/CA6均＜0.01）;实验室检查提示CA6组CRP升高病例数较多,与其他两组之间差异存在统计学意义（PEV71/CA6、PCA16/CA6均＜0.01）;随访病例中CA6组有甲脱落（18.3％,26/142）发生;观察全部CA6组病例未见重症手足口病.结论 近年CA6已成为北京地区儿童手足口病新的流行病原之一,其主要临床表现与以往EV71和CA16所致的手足口病有一定的差异,可供临床诊断时参考.
- 黄辉邓莉郑崇光宋秦伟邓洁朱汝南孙宇钱渊
- 关键词：手足口病柯萨奇病毒感染
- 来自肺炎患儿的A1基因亚型人偏肺病毒全基因组序列分析
- 2016年
- 人偏肺病毒（human metapneumovirus,HMPV）是婴幼儿呼吸道感染的重要病原之一。本研究目的在于分析在HMPV监测中发现的少见型别A1基因亚型BJ-1610的全基因组序列,为HMPV的进一步研究提供数据支持。BJ-1610来源于一名患有肺炎的3月龄女婴的鼻咽洗液标本。对该毒株进行全基因组RNA分段扩增、测序、序列拼接并分析其基因组特征、变异程度及是否存在重组等现象。BJ-1610株基因组全长为13 406nt（KU821121）。BJ-1610与HMPV参考株进行全基因和各蛋白核苷酸和氨基酸序列比较,显示全基因组的核苷酸相似性范围为81.2%-98.4%,其中相似性最高的为澳大利亚株（KC562226）,而SH和G基因则与其他澳大利亚株相似性更高。系统进化分析发现BJ-1610与HMPV A1基因亚型参考株位于同一分支,显示了与相似性分析相同的特征。对BJ-1610的膜表面蛋白F、SH和G蛋白序列进行分析结果显示,F蛋白最为保守,SH基因编码区的终止密码发生了突变,导致终止密码后移15位,长度由552bp变为567bp;G蛋白氨基酸序列突变较多,并导致N-糖基化位点的减少。HMPV作为儿童呼吸道疾病的重要病原之一,对其流行株基因组的分析将对其流行特征、遗传进化、致病机理、疫苗研制和抗病毒药物研发等方面的研究产生积极的推动作用。
- 郭春颖朱汝南孙宇赵林清邓洁王芳宋秦伟田润钱渊
- 关键词：儿童肺炎人偏肺病毒
- 2023年春季北京地区儿童急性呼吸道感染病原谱分析被引量：2
- 2024年
- 目的探讨北京地区儿童急性呼吸道感染(ARI)的病原谱。方法采用横断面研究,收集2023年2月6日(第6周)至5月28日(第21周)首都儿科研究所附属儿童医院因ARI就诊的9284例患儿呼吸道标本。根据标本来源,分为急诊就诊的流感样病例组、门诊ARI组及住院ARI组。流感样病例组进行流感病毒(Flu)及人偏肺病毒(HMPV)核酸检测;门诊ARI组进行Flu、呼吸道合胞病毒(RSV)、腺病毒、副流感病毒(PIV)核酸检测;住院ARI组进行Flu、RSV、HMPV、腺病毒、人博卡病毒(HBoV)、鼻病毒、PIV、冠状病毒、肺炎支原体(Mp)及衣原体核酸检测。结果流感样病例组320例患儿中男192例、女128例,就诊年龄4.7(3.6,6.9)岁,Flu A阳性117例(36.6%),其中甲型流感病毒H1N1亚型(H1N1)55例(47.0%),甲型流感病毒H3N2亚型(H3N2)62例(53.0%),第6~9周以H1N1为主(10.0%~50.0%),第10~16周以H3N2为主(15.0%~90.0%);HMPV阳性13例(4.1%),第15周检出率为5.0%(1/20),第20周达30.0%(6/20)。门诊ARI组7573例患儿中男4131例、女3442例,就诊年龄4.0(2.1,5.3)岁,阳性检出率RSV为32.9%(2491/7573),Flu A为12.1%(915/7573);第6~14周以Flu A为主(23.2%~74.7%),第15周开始以RSV为主,阳性检出率为24.8%(36/145)。住院ARI组1391例患儿中男804例、女587例,就诊年龄3.3(0.4,5.8)岁,阳性检出率鼻病毒为18.7%(260/1391)、RSV为12.4%(173/1391)、Flu A为10.2%(142/1391)[H1N1116例(81.7%)、H3N226例(18.3%)]及HMPV为3.1%(43/1391)。第7周开始检出H1N1[10%(6/60)],第11周达高峰[31.8%(21/66)],第8周开始检出H3N2[1.5%(1/68)]。住院ARI组Flu阳性患儿H1N1阳性检出率为81.7%(116/142)。第12周开始检出RSV,阳性检出率为1.3%(1/80),第19周达30.4%(35/115);第21周HMPV阳性检出率为12.1%(14/116)。结论北京地区2023年春季(2至5月)ARI患儿中首先出现Flu流行,前期以H1N1为主,后期以H3N2为主,RSV出现滞后流行,同时需密切关注HMPV。应加强对门诊监测,提前发出流行预警。
- 孙宇朱汝南王芳陈冬梅郭琪周禹彤姚尧贾立平赵林清
- 关键词：儿童急性呼吸道感染病原
- 人副肠孤病毒与儿童脓毒症和中枢神经系统感染的相关性被引量：6
- 2014年
- 目的 了解疑似中枢神经系统（CNS）感染患儿中人副肠孤病毒（HPeV）的感染状况及脓毒症感染的关系.方法 回顾性收集2012年因疑似CNS感染而在首都儿科研究所附属儿童医院住院患儿的脑脊液标本.采用针对HPeV基因组相对保守的5＇端非编码区和变异显著的衣壳蛋白基因3和1交界区的通用引物和分型引物,分别对脑脊液标本核酸进行反转录巢式PCR （RT-nPCR）扩增.阳性标本的PCR产物直接进行核苷酸序列测定,与GenBank中的序列进行比对分析并建立系统进化树.对HPeV筛查阳性的脑脊液标本进行肠道病毒（EV）、EB病毒（EBV）和人巨细胞病毒（HCMV）的检测.同时收集HPeV筛查阳性患儿的其他类型标本（包括血清、鼻咽洗液、粪便标本等）进行上述检测.结果 577份脑脊液标本中检测到18份HPeV阳性标本,检出率为3.1％.阳性患儿中男12例,女6例,年龄范围为15 d～14岁,其中3个月以下患儿最多,占7例;其次是3个月～1岁年龄组5例;另有3例阳性患儿＞9岁.对分型成功的10份脑脊液标本中HPeV的序列分析显示7份为HPeV 3型,3份为HPeV 1型.18份HPeV筛查阳性的脑脊液标本中EV、EBV和HCMV检测均为阴性.脑脊液HPeV筛查阳性患儿的其他类型标本中,8份血清标本中检出2份阳性（均为HPeV3）,其中1份与脑脊液标本检出及分型结果一致,而另1份对应脑脊液标本筛查为阳性,但未分出型别;2份粪便标本中检出1份阳性（HPeV1）,但对应脑脊液标本未分出型别.HPeV阳性患儿临床诊断主要是脓毒症（7/18）和CNS感染（4/18）.其中6例（6/8） HPeV3阳性患儿诊断为脓毒症.HPeV3感染多集中于8月份,而HPeV1则集中于1月份.结论 HPeV与北京儿童脓毒症和CNS感染性疾病相关.1岁以下儿童为易感人群.HPeV3型为脑脊液中主要的检出型别.
- 罗雷朱汝南赵林清邓洁王芳孙宇宋秦伟丁雅馨钱渊
- 关键词：中枢神经系统感染脓毒症儿童
- 对2009新甲型H1N1流行期间儿童病例中不同检测方法的结果分析
- 孙宇沙莉袁艺王菲胡风华李杰胡岚张宝元曹玲金丽敏李娟娟钱渊王晓颖朱汝南王芳邓洁赵林清曲东李颖任晓旭
- 一种用于检测人博卡病毒环状基因组的核酸组合物、试剂盒及其应用
- 本发明涉及一种用于检测人博卡病毒环状基因组的核酸组合物、试剂盒及其应用。本发明所述核酸组合物和试剂盒能够对人博卡病毒（下文简称HBoV）的环状基因组进行高效、准确的定量检测，从而能迅速且准确地判断样品中是否含有HBoV环...
- 赵林清张可祥德日孙宇
- 北京地区人冠状病毒NL63 N和E蛋白基因序列及生物信息学分析
- 2007年
- 为了解北京地区新近发现的新型冠状病毒-人冠状病毒NL63（Human coronavirus NL63,HCoV-NL63）的N和E蛋白编码基因的特征,从经RT-PCR检测阳性的临床标本中扩增得到的HCoV-NL63 N蛋白和E蛋白编码基因序列,分别克隆至pCF-T和pUCm-T载体中并进行测序,同时运用生物信息学的方法,对北京HCoV-NL63阳性标本BJ8081 N和E蛋白编码基因的核苷酸和氨基酸序列与HCoV-NL63原型株及其他几种冠状病毒的N和E蛋白编码基因的核苷酸和氨基酸序列进行比较分析和种系进化分析;用SOPMA方法对BJ8081 N和E蛋白的二级结构进行了预测分析,并对N和E蛋白的其他生物学特性进行了预测分析。经序列比对分析发现,BJ8081 N蛋白氨基酸序列在78-85肽段（FYYLGTGP）内与所比较的其他冠状病毒N蛋白相应位置的氨基酸序列完全相同,提示此区段可能为包括HCoV-NL63在内的所有冠状病毒N蛋白的保守区域。在BJ8081 N蛋白氨基酸序列的100-121肽段可能是和基因组RNA相结合的位置;在BJ8081 E蛋白的15-37位氨基酸可能是E蛋白的跨膜区域。研究对BJ8081 N蛋白和E蛋白的编码基因序列进行了测定和生物信息学分析,为今后对HCoV-NL63的进一步深入研究奠定了基础。
- 邢江峰朱汝南钱渊赵林清邓洁王芳孙宇
- 关键词：新冠状病毒HCOV-NL63N蛋白E蛋白生物信息学
- 近年北京人偏肺病毒基质蛋白、小疏水蛋白和粘附糖蛋白的遗传变异特征分析
- 2011年
- 为了探讨北京地区儿童中流行的人偏肺病毒(Human metapneumovirus,hMPV)结构蛋白基因特征,本研究着重对hMPV北京地区地方株的基质蛋白(Matrix protein,M)、小疏水蛋白(Small hydrophobic protein,SH)和粘附蛋白(Attachment protein,G)基因进行了基因特征的分析。本研究对2006年至2010年42株hMPV的M蛋白、49株SH蛋白和55株G蛋白基因特征进行了分析,进化分析显示北京地区流行的hMPV的这3个编码蛋白基因分别属于A2、B1和B2基因亚型。地方株M基因高度保守,A和B基因型之间存在7个氨基酸位点的变异(型内高度保守)。不同基因型(A和B)和不同基因亚型(A2和B1、A2和B2)之间的SH基因的氨基酸同源性在60.7%～64.4%之间,而同一基因亚型内的氨基酸同源性则在93.3%～100%之间;同一基因型不同基因亚型之间(B1和B2)的氨基酸同源性在84.7%～88.7%之间。不同年份不同基因亚型G蛋白具有遗传多样性,使用不同的终止密码、核苷酸缺失和插入导致其核苷酸长度不同,变异程度相当高。不同基因型和不同基因亚型之间的G基因的氨基酸同源性在34.0%～38.6%之间,同一基因亚型内的氨基酸同源性在81.5%～100%之间;同一基因型不同基因亚型之间的氨基酸同源性在64.3%～69.2%之间。2008年至2010年的B2基因亚型的毒株大多数在多个位点出现了相同的氨基酸突变,同时出现了2个氨基酸的插入或重复插入,这些毒株在B2基因亚型内形成了一个新的进化簇。抗原位点预测分析显示不同基因亚型的SH和G蛋白的抗原位点均存在差异。
- 朱汝南钱渊赵林清孙宇邓洁王芳
- 关键词：人偏肺病毒遗传变异分析
