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刘香琼

作品数:2 被引量:3H指数:1
供职机构:哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院更多>>
发文基金:黑龙江省研究生创新科研项目黑龙江省教育厅资助项目黑龙江省卫生厅科研项目更多>>
相关领域:医药卫生生物学更多>>

文献类型

  • 2篇中文期刊文章

领域

  • 2篇医药卫生
  • 1篇生物学

主题

  • 1篇信使
  • 1篇信使RNA
  • 1篇牙周
  • 1篇牙周病
  • 1篇遗传学
  • 1篇遗传学分析
  • 1篇源性
  • 1篇生物信息
  • 1篇生物信息学
  • 1篇生物信息学研...
  • 1篇通路
  • 1篇内源
  • 1篇内源性
  • 1篇基因
  • 1篇基因表达
  • 1篇表观

机构

  • 2篇哈尔滨医科大...
  • 1篇哈尔滨医科大...
  • 1篇莱比锡大学

作者

  • 2篇刘香琼
  • 1篇吴欣
  • 1篇徐建凯
  • 1篇贾晓东
  • 1篇陈秀杰
  • 1篇杨瑞智
  • 1篇刘磊

传媒

  • 1篇现代口腔医学...
  • 1篇生物化学与生...

年份

  • 1篇2019
  • 1篇2013
2 条 记 录,以下是 1-2
排序方式:
基于基因表达变异性的通路富集方法研究被引量:1
2013年
当前的通路富集方法主要是基于基因的表达差异,很少有方法从通路变异性(方差)角度对其富集分析.我们注意到用合适的统计量描述通路的变异性时,在疾病表型下一些通路的变异性有明显的上升或者下降.因此本研究假设:通路变异性程度在不同表型中存在差异.本文设计了14种描述通路变异性的统计量与检验方法,检测不同表型下变异性有差异的通路即富集通路,并将富集结果与文献检索结果进行比较,同时,分析不同芯片预处理方法对数据和结果的影响.研究结果表明:5种预处理方法中,多阵列对数健壮算法(RMA)是数据预处理的最优方法;不同表型下通路的变异性程度存在差异;根据文献检索的通路结果,14种基于变异性的通路富集方法中,以通路中各基因欧氏距离的方差做统计量进行permutation检验(方法 11)能有效识别显著通路,其富集结果优于基因集富集分析(GSEA).综上所述,基于通路变异性的通路富集策略具有可行性,不仅对通路富集分析有一定的理论指导意义,而且为人类疾病研究提供新的视角.
贾晓东陈秀杰吴欣徐建凯谭福建刘香琼刘磊杨瑞智
关键词:通路
牙周病的表观遗传学分析:生物信息学研究被引量:2
2019年
目的本生物信息学分析基于牙周炎的高通量RNA测序以及芯片数据,通过整合长链非编码RNA,微小RNA以及信使RNA的表达谱数据,旨在构建参与牙周炎生物学过程的竞争性内源性RNA(ceRNA)网络。方法搜集到一个微小RNA和三个信使RNA表达谱数据,用来构建长链非编码RNA的竞争性内源性RNA网络。结果六种基因(HSPA4L,PANK3,YOD1,CTNNBIP1,EVI2B and ITGAL),三种微小RNA(miR-125a-3p,miR-200a,and miR-142-3p),和三种长链非编码RNA(MALAT1,TUG1,FGD5-AS1)参与了牙周炎的竞争性内源性RNA网络。结论本研究预测出的基因学和表观遗传学的生物标记物可能在牙周炎的发病机制中发挥着至关重要的作用。
王田田刘香琼李思敏
关键词:信使RNA
共1页<1>
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