赵祖国
- 作品数:37 被引量:201H指数:7
- 供职机构:广东医科大学更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金国家高技术研究发展计划东莞市科技计划项目更多>>
- 相关领域:医药卫生环境科学与工程生物学文化科学更多>>
- 城市污水再生利用生物学安全评价系统研究
- 国内外实践经验表明,废水的再生回用是开源节流、改善生态环境、解决城市缺水问题的有效途途经之一。但是针对污水及再生水中可能存在的各种致病微生物,现有世界各国再生水回用标准中,却没有一整套系统的微生物学安全评价体系。本课题就...
- 王新为赵祖国张小英金敏谌志强李君文
- 文献传递
- 云南白药水提取物抑制铜绿假单胞菌AlgR2-AlgR1双组份调控系统磷酸化研究被引量:2
- 2013年
- 目的:研究亚致死剂量的云南白药水提取物(Aquatic Extract of Yunnan Baiyao,AEYB)对铜绿假单胞菌(Pseudomonas Aeruginosa,PA)AlgR1-AlgR2双组份调控系统的磷酸化、海藻酸盐的生物合成及生物膜形成的影响。方法:通过放射性同位素标记方法研究AEYB对AlgR1-AlgR2磷酸化的影响;采用real-time PCR分析YBX海藻酸盐合成酶基因algD转录的影响;用咔唑法和结晶紫法分别对海藻酸盐和静态生物膜进行定量测定。结果:AEYB并不抑制AlgR2的自磷酸化,但能抑制AlgR2的磷酸基团向AlgR1转移,从而抑制AlgR1的磷酸化。AEYB可显著下调algD基因的转录,并抑制alginate的合成,最终减少PA静态生物膜的形成。结论:云南白药可通过抑制AlgR1-AlgR2系统的磷酸化的途径来减少PA的alginate的生物合成,对PA生物膜的形成具有抑制作用。
- 赵祖国赵静刘军张腊喜喻云梅
- 关键词:铜绿假单胞菌海藻酸盐生物膜
- 一种新的好氧反硝化菌筛选方法的建立及新菌株的发现
- 笔者利用间歇曝气富集氰化钾选择培养基筛选好氧反硝化细菌,并进行鉴定,并与已报道的napA基因进行Blast比较,发现具有较大差别,初步认为Pseudomonas sp.Y2-1-1是一株新的好氧反硝化菌.
- 李君文孔庆鑫王新为金敏古长庆赵祖国
- 关键词:好氧反硝化硝酸盐还原酶
- 文献传递
- 一种羟胺氧化酶基因序列的PCR扩增及其生物信息学分析被引量:2
- 2009年
- 采用PCR法获得不动杆菌Acinetobactor sp.YY-5的一种羟胺氧化酶(Hydroxylamine oxidored uctase,HAO)编码基因序列并进行生物信息学分析.根据自养菌的HAO基因序列保守区设计4对引物,通过RT-PCR获得预期大小的部分序列,再采用Genome walking PCR法向所得的部分序列两侧延伸;对所得序列在NCBI中进行blast分析,并用FGeneSB进行开放读码框(Open read frame,ORF)预测.结果表明,RT-PCR获得了一段462bp的序列,通过Genome walking PCR向两侧延伸后,获得了一段3152bp长的序列;ORF预测结果显示所得序列可能有4个ORF,RT-PCR获得的462bp序列所在ORF长555bp,对应氨基酸序列相对分子质量(Mr)大小为20.2×103;在Gene bank中进行的Blast比对分析显示,除保守区的引物序列外,未发现有与此ORF存在明显相似性的HAO基因,表明这可能是一种新型羟胺氧化酶基因.
- 赵祖国孔庆鑫王景峰金敏王新为李君文
- 关键词:不动杆菌生物信息学生物脱氮基因序列开放读码框
- 《卫生微生物学》教材“二次开发”之探讨被引量:2
- 2014年
- 本文主要针对现在广泛使用的2012年人民卫生出版社出版的《卫生微生物学》(第五版)教材,从教学内容对课程教学的优化、教材的"二次开发"进行了探讨,对提高该门课程教学质量、培养实用型高等技术人才具有重要意义。
- 郭莲仙孙铭薇赵祖国梁一
- 关键词:卫生微生物学课程优化
- 活性污泥宏基因组芯片DNA的制备方法被引量:3
- 2009年
- 宏基因组芯片的探针是通过构建环境DNA的宏基因组文库而获得的,为了获得理想的活性污泥宏基因组文库和宏基因组芯片探针,必须获得高质量的活性污泥DNA.本文作者采用8种不同的DNA提取方法提取活性污泥的总DNA,并通过比较DNA总量、纯度、完整性、是否含有PCR酶抑制剂、能否进行限制性内切酶酶切等指标来评价不同提取方法对活性污泥总DNA提取效果的影响.结果表明,溶菌酶–SDS–蛋白酶K–酚氯仿抽提处理活性污泥所提取的总DNA效果最好,提取的DNA总量多、纯度高,DNA片段大于23kb,无需进一步纯化就可直接进行PCR扩增反应或SauAⅠ限制性内切酶酶切,但DNA如果需要EcoRⅠ、HindⅢ等限制性内切酶酶切,则需采用Roche公司琼脂糖凝胶回收试剂盒将DNA进一步回收纯化.
- 金敏赵祖国王景峰谌志强陈照立邱志刚王新为李君文
- 关键词:活性污泥DNA提取探针
- 氯灭活水中脊髓灰质炎病毒机制的研究被引量:4
- 2008年
- 目的探讨氯对脊髓灰质炎病毒核酸和衣壳蛋白的破坏在灭活病毒中的作用,并对病毒基因组受损区域进行定位,阐明氯灭活脊髓灰质炎病毒的机制。方法以不同剂量(0.1、0.5、1.0、1.5和2.0mg/L)的有效氯对脊髓灰质炎病毒作用不同时间(0、15、30、45和60min),采用大片断逐步步移PCR(long-overlapping PCR)分析氯对病毒全基因组的损伤,以ELISA技术分析氯对病毒衣壳蛋白的破坏,以细胞培养检测病毒感染性。结果脊髓灰质炎病毒各部分对氯的抵抗力强弱存在如下关系:病毒衣壳>基因组蛋白编码区>基因组5′端非编码区(noncoding region,NCR)>基因组3′端NCR>poly A尾;脊髓灰质炎病毒的polyA尾和3'端NCR破坏可造成病毒的感染性下降,但不能完全灭活病毒;5′端NCR的破坏与病毒感染性的消失一致,损伤区域主要位于富含二级结构的区域。结论氯主要通过破坏脊髓灰质炎病毒核酸而非衣壳蛋白灭活病毒;病毒基因组5′NCR内二级结构区域的破坏对脊髓灰质炎病毒具有致死效应。
- 赵祖国喻云梅金敏王新为李君文
- 关键词:脊髓灰质炎病毒氯非编码区
- 纳米氧化铝在多重耐药质粒RP4接合转移过程中对细菌形态学的影响被引量:3
- 2008年
- 目的探讨纳米氧化铝(平均粒径为20nm)对液相条件下多重耐药质粒RP4接合转移的影响,并从形态学角度初步探讨其影响机制。方法接合供体菌为大肠杆菌HB101(RP4),受体菌为Salmonella aberdeen Kauffmann 50312(strR),供、受体菌液均为109cfu/ml(浓度比为1∶3),纳米Al2O3浓度分别为0.005、0.05、0.5、5、50mmol/L,25℃静止接合8h后计算转接合子数,然后采用透射电镜和激光扫描共聚焦显微镜进行形态学研究。结果RP4的接合转移随着纳米Al2O3浓度的升高具有上升趋势。5mmol/L和50mmol/L纳米Al2O3组接合率分别为空白对照组的150倍和40倍,差异均有统计学意义。透射电镜观察结果表明,空白对照组只能观察到单个供、受体菌接合,5mmol/L和50mmol/L纳米Al2O3组能观察到多个细菌同时发生接合的情况;50mmol/LAl2O3组一些细菌观察不到完整的细胞膜结构,该损伤可能是引起50mmol/L纳米Al2O3组接合率低于5mmol/L纳米Al2O3组的原因。激光扫描共聚焦显微镜观察结果提示纳米Al2O3能损伤细菌的细胞膜,细胞膜的损伤程度与进入细菌的纳米Al2O3的浓度呈正相关。结论纳米Al2O3能够促进接合子的产生,其影响机制可能是因为纳米Al2O3能够改变细胞膜通透性,间接影响接合过程,或者直接促进接合基因的表达所致。
- 喻云梅赵祖国邱志刚金敏王新为李君文
- 关键词:纳米氧化铝细菌耐药性透射电子显微镜激光扫描共聚焦显微镜
- 回收污水中肠道病毒方法的改进被引量:2
- 2006年
- 介绍了一种城市污水中肠道病毒的浓集方法:病毒浓集前在污水中加入带阳电荷的物质聚氯化铝,30mg/L的聚氯化铝可使f2噬菌体回收率达到(92.06±8.65)%,pH值为6.5时f2回收率达(92.15±6.02)%,温度对回收率没有影响。该方法不仅对病毒的回收率高(>80%),且浓集污水量较大(20L)、效果稳定。
- 张小英赵祖国王新为郭金鹏谌志强李君文
- 关键词:污水肠道病毒
- MBR中微生物群落结构的演变与分析被引量:41
- 2008年
- 为了揭示膜-生物反应器中微生物群落结构多样性的演变过程,通过细胞裂解法直接提取不同时期污泥中的基因组DNA,利用基于16S rDNA的PCR-DGGE技术获得了微生物群落的DNA特征指纹图谱,并对条带进行了统计分析和切胶测序,使用序列数据进行了同源性分析并建立了系统发育树.DGGE分析表明,在反应器运行前17d内污泥中微生物群落结构变化很大,与接种污泥的相似性系数下降到了29.2%,从而说明MBR中处理工艺和进水水质的改变导致微生物群落结构多样性降低.在试验过程中,Pseudomonas和Aeromonas hydrophila等种群一直保持着较为稳定的优势地位,也有原始种群如Bacillus sp.的消亡和以Enterococcus faecalis、Comamonassp.、Fusobacteriumsp.等为代表的次级种群的强化和演变.UPGMA聚类分析将DGGE图谱区分为3大类群并对应于各自的运行时期.测序结果表明,MBR中微生物菌群间进化距离较大,其中Proteobacteria纲和Bacillus属细菌较多.在反应器运行后期演变为优势地位的菌群(如Comamonassp.)加剧了膜污染物的产生和积累.
- 张斌孙宝盛季民赵祖国
- 关键词:膜-生物反应器微生物多样性PCR-DGGE克隆测序