袁小松
- 作品数：13 被引量：15H指数：2
- 供职机构：中国农业科学院兰州兽医研究所家畜疫病病原生物学国家重点实验室更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国际原子能机构基金甘肃省自然科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 亚洲璃眼蜱成蜱不同发育期miR-451与MIF表达谱的动态分析被引量：1
- 2015年
- [目的]micro RNA(miRNA)作为一类内源性的非编码RNA,仅有18—25 nt,其广泛存在于动植物细胞中,可诱导生物基因沉默,参与细胞生长、发育、基因转录和翻译等诸多生命活动的调控过程。以亚洲璃眼蜱为研究对象,对miR-451及其靶基因(巨噬细胞游走因子,MIF)在相互作用关系进行分析。[方法]参考miR-451成熟体序列(AAA CCG UUA CCA UUA CUG AGU UU)来自研究单元亚洲璃眼蜱高通量测序所获得的结果。根据该成熟体序列设计stem-loop及PCR引物,RT-PCR扩增获得蜱源性miR-451序列;并对不同物种来源的miR-451序列特征进行分析。基因合成方法获得抑制miR-451的ds RNA序列,用于亚洲璃眼蜱饥饿成蜱体内注射。参考美洲钝眼蜱MIF基因(登录号:AF289543.2),设计亚洲璃眼蜱的特异性实时荧光定量引物,以β-actin作为内参基因,采用SYBR Green real-time RT-PCR方法检测注射ds RNA后亚洲璃眼蜱饥饿成蜱不同发育时间点MIF基因的表达水平,以及miR-451的表达谱特征。[结果]琼脂糖凝胶电泳检测miR-451的PCR产物条带与预期大小一致,为72 nt。不同物种来源的miR-451具有较高的保守性,特别是种子序列极度保守,仅在短尾负鼠miR-451成熟体的19位点处存在A→U的突变。miR-451的RNA干扰实验证实,0-30 h miR-451表达逐渐上调,6 h达到最高值,其拷贝数为1.0×108。随后表达丰度逐渐降低。30 h其表达水平与PBS对照组相同。48-60 h miR-451再次出现一个表达上调微小变化过程。而miR-451抑制后的MIF直到30 h才有表达的上调,42 h达到峰值(拷贝量仅为9.0×103),此后其表达规模受到抑制,48 h时与PBS对照组水平一致。84 h后表达才逐渐上调,直到90 h达到峰值,并呈现正态分布趋势。[结论]利用RT-PCR获得亚洲璃眼蜱成蜱阶段miR-451序列,生物信息学方法分析了miR-451序列在不同物种间具有较高保守性。miRNA的保守性决定其靶标基因的特异性,因此,以上结果提示miR-451
- 罗金袁小松郝佳伟田占成谢俊仁陈泽任巧云殷宏罗建勋刘光远
- 关键词：MIF
- Hlo:miR:275在长角血蜱卵中的表达动态变化
- 基于microRNA的重要性及其在寄生虫和寄生虫病防控方面的潜在应用价值,本研究就hlo：miR：275在长角血蜱卵不同发育时期的表达变化情况进行了分析.根据数据库中hlo：miR：275的成熟体序列信息,设计特异性茎环...
- 王芳芳刘光远罗金袁小松田占成谢俊仁王素艳郭锦霞
- 关键词：长角血蜱MICRORNA荧光定量PCR
- miR-275在长角血蜱不同发育阶段及组织中表达的动态变化被引量：1
- 2014年
- 根据本实验室建立的高通量测序数据库中长角血蜱miR-275的成熟体序列信息,设计出特异性茎环引物及PCR扩增引物,同时以长角血蜱β-actin基因(GenBank登录号:AY254898)为内参基因,绘制标准曲线,计算长角血蜱miR-275的标准拷贝数,采用GraphPad Prism 5软件分析miR-275在长角血蜱不同发育时期及不同组织中的表达情况。结果显示,长角血蜱miR-275和β-actin标准曲线的回归系数均大于0.99,熔解曲线峰值单一,Ct值的变异率均小于5%,表明引物特异性好,标准曲线重复性和稳定性高。用real-time PCR方法对miR-275在长角血蜱卵的不同发育时期、蜱不同发育阶段及不同组织中的表达情况进行分析。结果显示,miR-275在长角血蜱卵发育到第16天的拷贝数最大,为(13.07±1.63)×106 copies/μL,是表达量最低的第5天的43.57倍;在饱血成蜱中拷贝数最多,为(18.95±1.55)×106 copies/μL,是饥饿成蜱的236.88倍;长角血蜱卵巢中拷贝数是最高的,为(15.29±3.59)×106 copies/μL,是表皮表达量的10.47倍。结果表明,miR-275在长角血蜱卵的发育、细胞增殖、组织分化等过程中可能起到了至关重要的作用。
- 王芳芳罗金袁小松谢俊仁田占成王素艳郭锦霞刘光远
- 关键词：长角血蜱MICRORNA荧光定量PCR
- 四种蜱源MIF基因的原核表达及表达产物的反应原性分析
- 2013年
- 为研究不同蜱源巨噬细胞移动抑制因子(MIF)基因的生物学特性,本研究设计了1对特异性引物,采用PCR从亚洲璃眼蜱、青海血蜱、血红扇头蜱、麻点璃眼蜱中扩增MIF基因的完整阅读框,并对该序列一级结构特征进行分析。PCR产物经BamHⅠ+EcoRⅠ双酶切后亚克隆到表达载体pGEX-4T-1上,重组质粒转入感受态细胞BL21(DE3),37℃下用1mmol/L IPTG诱导表达,通过SDS-PAGE分析MIF基因体外的表达特征;接着用亚洲璃眼蜱全蜱血清与四种不同蜱种MIF重组蛋白进行Western-blot分析。结果显示,MIF基因完整阅读框全长351bp,编码116个氨基酸。氨基酸比对结果显示,亚洲璃眼蜱、青海血蜱、血红扇头蜱、麻点璃眼蜱MIF基因推导的氨基酸序列与已知的长角血蜱MIF基因推导的氨基酸序列相似性分别为98%、93%、93%、92%。SDS-PAGE结果显示,诱导的MIF重组蛋白的分子质量约为38.5ku。亚洲璃眼蜱全蜱血清与亚洲璃眼蜱MIF重组蛋白有较强的反应原性,且该血清与青海血蜱、血红扇头蜱、麻点璃眼蜱MIF重组蛋白存在交叉反应。结果表明,蜱MIF是一种良好的抗原分子。
- 袁小松罗金谢俊仁田占成田美媛郑进峰王芳芳张以芳刘光远
- 关键词：巨噬细胞移动抑制因子原核表达
- 残缘璃眼蜱subolesin基因的原核表达及表达产物的反应原性分析被引量：1
- 2015年
- 为研究残缘璃眼蜱subolesin基因的生物学特性以及寻找新的抗蜱和蜱传病疫苗候选抗原,根据GenBank上登录的小亚璃眼蜱subolesin基因核苷酸序列设计特异性引物,以残缘璃眼蜱、亚洲璃眼蜱、微小牛蜱的饥饿成蜱cDNA为模板,扩增出subolesin基因的完整阅读框(ORF)。将残缘璃眼蜱subolesin基因的PCR产物经EcoRⅠ+NotⅠ双酶切后连接至表达载体pGEX-4T-1,把重组质粒pGEX-4T-1-subolesin导入感受态细胞BL21(DE3)中,在37℃、1mmol/L IPTG条件下诱导表达。利用SDS-PAGE分析subolesin基因的体外表达特征;用Western-blot分析Subolesin蛋白的反应原性。结果显示,残缘璃眼蜱、亚洲璃眼蜱、微小牛蜱subolesin基因的ORF长度分别为492、492、486bp,分别编码163、163、161个氨基酸。subolesin基因序列和推导的氨基酸序列的比对结果显示,残缘璃眼蜱、亚洲璃眼蜱、微小牛蜱与参考的小亚璃眼蜱的核苷酸序列同源性分别为98%、98%、89%,氨基酸序列同源性分别为98%、99%、93%。SDS-PAGE和Western-blot结果显示,重组残缘璃眼蜱Subolesin蛋白的分子质量为45ku,纯化的subolesin重组抗原可与抗残缘璃眼蜱全蜱血清、残缘璃眼蜱唾液腺、卵巢血清有较强的反应原性。
- 王素艳田占成谢俊仁陈泽任巧云罗金王芳芳袁小松李凯陈秋语殷宏刘光远
- 关键词：原核表达反应原性
- 长角血蜱MESK基因的克隆及其生物学特性分析
- 2013年
- 为进一步了解MESK基因在长角血蜱免疫应答中的作用,克隆了长角血蜱MESK基因全长序列,采用有关生物信息学软件对该基因序列的一级结构进行了分析;构建了真核表达载体pEGFP-C1-MESK,采用脂质体转染法在HEK293细胞及HeLa细胞中对其进行了表达。48h后对细胞进行裂解,用兔抗长角血蜱阳性血清与表达出的重组蛋白进行反应,以检测重组蛋白的免疫活性。结果显示,MESK基因全长为1 426bp,包括1个1 185bp的开放阅读框。该基因含有5个N-糖基化位点、5个豆蔻酰化位点、9个酪氨酸蛋白Ⅱ激酶磷酸化位点、1个酪氨酸蛋白激酶位点、2个cAMP和cGMP依赖性蛋白激酶磷酸化位点、1个蛋白磷酸激酶C磷酸化位点。SDS-PAGE分析及Western-blot分析表明,表达出的重组蛋白的分子质量约为71ku,且以与兔抗长角血蜱阳性血清反应,免疫原性良好。结果表明,MESK基因可以作为一种重要的分子标记参与蜱分类的研究,在作为候选抗蜱疫苗的研究中具有重要的开发价值。
- 赵波刘光远罗金张萍田占成谢俊仁田美媛王芳芳袁小松
- 关键词：长角血蜱生物信息学克隆真核表达
- 四种蜱源MIF基因的原核表达及反应原性分析
- 蜱是寄生性节肢动物,在其吸血过程中通过多种机制逃避宿主的抗蜱免疫反应,其中蜱分泌的巨噬细胞移动抑制因子(MIF)能通过非特异性地抑制宿主巨噬细胞识别外来抗原的能力,在其吸血过程中发挥着重要作用。为了研究MIF免疫学特性,...
- 谢俊仁袁小松罗金田占成王芳芳张以芳刘光远
- 关键词：巨噬细胞移动抑制因子原核表达
- 文献传递
- 长角血蜱卵中miR:275荧光定量PCR标准曲线的建立
- 为了研究miR：275在长角血蜱卵不同发育时期的表达变化情况,采用实时相对荧光定量PCR,构建miR：275、内参基因的标准质粒和标准曲线.根据成熟体序列信息,设计特异性茎环引物及PCR扩增引物,通过qRT：PCR检测m...
- 王芳芳刘光远罗金袁小松田占成谢俊仁王素艳郭锦霞
- 关键词：长角血蜱MICRORNA荧光定量PCR
- 亚洲璃眼蜱不同发育阶段及其组织中microRNA-10表达分析被引量：3
- 2014年
- 【目的】MicroRNA(miRNA)是一类长度为20—22个核苷酸(nt)且高度保守的非编码小RNA。迄今为止,在病毒、动物、植物中都有发现,如在Mareks病毒、果蝇、斑马鱼、人类以及拟南芥等多种生物中都有存在。其通过与靶基因特异性的碱基互补配对使靶基因降解或者受到抑制,在转录后水平调控靶基因的表达水平。miRNAs参与多种生物的细胞增殖、分化、代谢与死亡等多种生物学过程。为了解microRNA-10在亚洲璃眼蜱中的潜在生物学功能,试验获得亚洲璃眼蜱miR-10的前体、成熟体序列;分析亚洲璃眼蜱不同发育阶段及组织miR-10的表达水平,及亚洲璃眼蜱miR-10的生物学意义;为进一步研究miR-10与亚洲璃眼蜱生长发育间的关系奠定基础。【方法】用Trizol Reagent分别提取不同发育阶段及组织的总RNA,用SYBR?Prime Script TMmiRNA RT-PCR Kit(TaKaRa Code:RR716)制备cDNA。参考miRBase数据库中isc-miR-10(登录号:MI0012262)序列,设计特异性引物,通过PCR的方法从亚洲璃眼蜱中扩增获得miR-10前体序列,通过MEGA4软件将此前体序列与已知物种的miR-10前体序列进行比对分析;利用qPCR技术分析亚洲璃眼蜱不同发育阶段及组织miR-10的表达情况;推测miR-10在亚洲璃眼蜱中的生物学功能。【结果】获得亚洲璃眼蜱miR-10的前体序列CUACAUCUACCCUGUAGAUCCGAAUUUGUUUGCCACUAGACUACAAAUUCGGUUCUAGAGAGGCUUUGUGUGG,大小为73bp;亚洲璃眼蜱的miR-10前体序列与肩突硬蜱的相似性最高,是95.9%,且与其他节肢动物相似性在88.9%—91.7%之间;miR-10在不同物种间高度保守。miR-10的成熟体序列为UACCCUGUAGAUCCGAAUUUGU,种子序列为ACCCUGU。在亚洲璃眼蜱的不同发育阶段中,饥饿若蜱的miR-10的表达水平最高,是卵的48.3倍;饥饿成蜱是卵的7.78倍;饥饿幼蜱是卵的2.78倍。在饥饿雌性成蜱吸血过程中,吸血3d的成蜱是饥饿成蜱的约4.28倍,吸血5d的成蜱是饥饿成蜱的约0.31倍,饱血自然脱落的�
- 袁小松罗金田占成谢俊仁王芳芳田美媛张以芳刘光远
- 关键词：MIR-1克隆
- 环形泰勒虫裂殖体表面蛋白基因PCR诊断方法的建立被引量：10
- 2014年
- 为寻求一种快速灵敏的环形泰勒虫病PCR检测方法,基于环形泰勒虫裂殖体表面蛋白(Theirelia annulata surface protein,TaSP)基因序列保守区设计特异性引物,通过PCR技术扩增出该基因长为393bp的高免疫原性区片段。用该引物对环形泰勒虫、中华泰勒虫、瑟式泰勒虫、尤氏泰勒虫、吕氏泰勒虫、绵羊泰勒虫、马泰勒虫、驽巴贝斯虫、牛巴贝斯虫基因组模板进行特异性试验,对环形泰勒虫基因组模板进行梯度稀释后扩增,以确定试验的敏感性,同时用本试验建立的方法与常规显微镜镜检方法对150份血清样品进行检测。特异性试验结果显示,在被检测的9个样本中,只有环形泰勒虫基因组模板中扩增出了符合大小的特异核苷酸片段;敏感性试验结果表明,PCR对环形泰勒虫的扩增效率可达到10-10;通过对150份血清样品的检测,并与血涂片方法进行比较,结果显示PCR方法具有特异性强、敏感度高等特点,适用于牛环形泰勒虫病的检测。
- 郑进峰罗金谢俊仁田美媛袁小松王芳芳郭锦霞李奎刘光远
- 关键词：环形泰勒虫PCR诊断方法
