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芮斌: 作品数：10 被引量：12H指数：2; 供职机构：安徽农业大学生命科学学院更多>>; 发文基金：国家自然科学基金博士科研启动基金更多>>; 相关领域：文化科学生物学医药卫生化学工程更多>>

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大肠杆菌基因缺失菌株中碳中心代谢系统的通量平衡分析和通量变异分析被引量：1: 2013年; 大肠杆菌(E. coli)因其遗传信息简单且容易培养而被广泛用作各种生物化学、生物技术研究等的模式微生物。本文首先通过COBRA工具包构建了大肠杆菌碳中心代谢系统的小规模网络,然后分别模拟敲除了其中的25种酶,并利用代谢通量平衡分析和代谢通量变异分析研究了基因敲除后的代谢网络。通过这些结果的综合分析,我们可以推断大肠杆菌碳中心代谢系统的不同的酶对整个体系的作用。; 申铁金杰军金杰军乙引芮斌; 关键词：大肠杆菌代谢通量

生物化学理论课程教学与实践被引量：1: 2014年; 生物化学是现代生物学高速发展的前沿领域,更是农业院校多学科必修的专业基础课之一。针对基础差异较大、培养方向各异的非生物专业学生,从调整生物化学课程教学大纲,教学手段、教学方法的改进等方面进行了教学实践,激发了学生学习兴趣,提高了学生学习主动性和教学实效。; 马欢金青余梅芮斌蒋而康陶芳; 关键词：生物化学课程非生物专业教学

高等农业院校生物化学双语教学模式的实施探索被引量：4: 2014年; 双语教学不仅是我国高等农业院校教育改革的一项重要的内容,同时,它也是对我国的人才培养所提出的一个更高的要求。因此,双语教学在高等农业院校的开展是一个必然的趋势。本文主要是从我国高等农业院校生物化学双语教学的必要性,以及农业院校生物化学教学中可能存在的问题,来探讨如何在高等农业院校开展生物化学双语教学模式。; 芮斌杨康文汉张宽朝; 关键词：高等农业院校生物化学双语教学模式

E.coliT蛋白CM的原核表达及核磁方法指导下的晶体优化: 2013年; 越来越多的研究表明许多致病菌的病原性与生物体内莽草酸途径中的分支酸变位酶(chorismate mutase,CM)有着密切的关系,因此CM成为了开发新型抗生素和抗菌药物的热门靶标酶。采用分子克隆的方法,在感受态细胞BL21-Gold(DE3)中重组表达大肠杆菌(E.coli)T蛋白的CM(CM T)。通过Ni-NTA亲和层析柱、GE Superdex75凝胶过滤层析柱和GE MonoQ阳离子交换层析柱纯化后得到电泳纯的重组蛋白,质谱鉴定结果与原始序列基本吻合。经过蛋白质晶体试剂盒的初步筛选,在30%PEG 4000,100mmol/L NaAc pH4.6,200mmol/L NH4Ac条件中发现CM T晶体。利用核磁共振方法,分析CM T的1H-15N HSQC谱图信息,指导设计CM T晶体的优化方案,成功获得高衍射能力的CM T晶体,为CM T结构的解析奠定了坚实的基础。; 芮斌谢长林江娜文汉; 关键词：CMT 原核表达 HSQC

LC-MS在药物代谢组学中的应用性和研究性教学初探: 2016年; LC-MS技术以其分离效能高、速度快、灵敏度高等优势广泛应用于前沿科学领域,而在药物代谢组学的应用性和研究性教学中还极少采用。本文以LC-MS联用基本原理为基础,将液相串联质谱理论与药物安全性评价、毒性反应差异、生物标志物结构解析等方面的科研应用实践相结合,为提高LC-MS技术在药物代谢组学整体的教学水平提供了参考。; 芮斌王永康文汉; 关键词：教学初探

大肠杆菌菌体氨基酸组成对高渗透环境的响应被引量：2: 2012年; 在正常和高渗透压(高盐)环境下培养大肠杆菌,利用气相色谱质谱联用仪(GC-MS)对大肠杆菌代谢物中的氨基酸进行了定性定量分析。结果表明:在两组中均鉴定出14种氨基酸,且两组的氨基酸种类相同;与对照组中同种氨基酸的相对含量相比,实验组中脯氨酸和甲硫氨酸的相对含量明显降低,丝氨酸、苏氨酸、苯丙氨酸、天冬氨酸、鸟氨酸、赖氨酸和组氨酸的相对含量明显增加,而丙氨酸、甘氨酸、缬氨酸、亮氨酸、谷氨酸的相对含量与对照组相近。; 申铁杨琦郭玉双乙引文汉芮斌; 关键词：大肠杆菌 GC-MS 氨基酸分析

质量键合体:一种用于均匀标记底物上小规模代谢网络通量分析的新型同位素标记模型: 2023年; 13C代谢通量分析((13C metabolic flux analysis,13C-MFA))是目前唯一一种基于碳同位素标记实验,来精确测量代谢通量分布。该方法的一个关键部分,是定量描述同位素标记系统的模型。本文提出和设计了一种用于均匀标记底物上小规模代谢网络的同位素标记算法(质量键合体-Mass Bondmer)模型。Mass Isotopomer 是目前同位素标记算法中速度最快的,为了验证本文提出的 Mass Bondmer 标记算法的效果,将 Mass bondmer 和 Mass Isotopomer 的计算速度进行了比较。结果表明 Mass bondmer 比 Mass Isotopomer 颗粒数量更少、表示方法更简单、计算速度更快。; 芮斌; 关键词：代谢通量分析

人源EFA6A蛋白Sec7结构域的克隆表达与纯化: 2013年; 作为小GTP酶Arf6的鸟甘酸交换因子(GEF),人EFA6A蛋白主要包含PH和Sec7两个结构域,Sec7是行使GEF功能的核心区域。通过分析Jpred、Uniprot等生物信息学软件的预测结果,从全长1 024 aa中选取的重组Sec7结构域的边界为506-719,共214 aa。以人脑cDNA文库为模板,通过优化PCR程序成功扩增出Sec7基因,经NdeI和XhoI双酶切后亚克隆至原核表达载体p28a中,成功构建p28-Sec7重组子,测序结果与NCBI中公布的序列100%吻合。将重组质粒p28-Sec7转化至BL21-Gold(DE3)宿主菌中,终浓度0.3 mmol/L IPTG、16℃、24 h诱导表达,重组蛋白经过Ni柱和分子筛两步纯化。试验结果显示,重组Sec7成功表达,性质均一,纯度高于95%,表达量为70 mg/L。; 谢长林芮斌江娜赵晨唐雅珺文汉; 关键词：分子筛

大肠杆菌酶基因缺失菌株碳中心代谢系统的代谢通量分析: 2014年; 大肠杆菌(E.coli)因其遗传信息简单且容易培养而被广泛用作各种生物化学、生物技术研究的模式微生物.为了认识重要模式生物大肠杆菌的代谢系统中各种酶的作用,以软件分析的模式,对已经构建好的小型大肠杆菌代谢系统在cobra中进行代谢通量平衡分析FBA(Flux-Balance Analysis)和代谢通量变化性分析FVA(Flux Variability Analysis),分别单独敲除代谢系统中的25个酶基因,分析敲除各个酶基因后的FBA和FVA的计算结果,通过作图显示出在大肠杆菌代谢系统中不同酶基因被敲除后每个反应的两项结果变化和不同酶基因被敲除后全部反应的两项结果的变化,以此来推测大肠杆菌代谢系统中各种酶所起的作用.; 芮斌金杰军范亚东文汉; 关键词：代谢通量酶基因

农业院校生物化学实验教学综合改革的研究被引量：4: 2016年; 生物化学实验是农业院校重要的实践教学环节,在农业院校"双创型"人才培养体系中具有重要作用。在总结农业院校传统生物化学实验教学存在问题的基础上,结合自身教学实践,从强化实验教学管理、改革实验考核模式、尝试综合性和设计性实验、分层次实验教学、探索新的实验教学模式等方面探讨了农业院校生物化学实验教学综合改革的思路。; 文汉张宽朝芮斌; 关键词：生物化学实验教学