游倩
- 作品数:11 被引量:21H指数:3
- 供职机构:福建农林大学更多>>
- 发文基金:国家现代农业产业技术体系建设项目国家自然科学基金引进国际先进农业科技计划更多>>
- 相关领域:农业科学生物学理学化学工程更多>>
- 基于ISSR标记的甘蔗黑穗病菌遗传多样性分析
- 由甘蔗黑穗病菌(Ustilago scitaminea Syd.)引起的甘蔗黑穗病是我国蔗区最重要的真菌性病害.为了解该病原菌的分子分化,对采集自全国7个省(区)、38个甘蔗栽培品种上的100个甘蔗黑穗病菌菌株进行单孢分...
- 游倩刘小兰许莉萍阙友雄陈如凯
- 关键词:甘蔗黑穗病ISSR地理来源
- 基于SP-SRAP标记分析甘蔗黑穗病菌遗传多样性
- 本研究首次利用单引物SRAP(single primer-sequence related amplification polymorphism,SP-SRAP)标记技术分析100份来自全国7个省(区)的甘蔗黑穗病菌菌株...
- 刘小兰游倩阙友雄许莉萍陈如凯
- 关键词:甘蔗黑穗病菌SRP聚类分析地理来源
- 甘蔗葡聚糖酶ScBG1基因的电子克隆及序列分析被引量:4
- 2013年
- 为了揭示甘蔗β-1,3-葡聚糖酶基因的结构特点和功能特性,从而为该基因的研究和应用提供基础。以水稻β-1,3-葡聚糖酶基因(U72255.1)为搜寻探针,运用电子克隆技术,获得一条甘蔗β-1,3-葡聚糖酶基因全长cDNA,命名为ScBG1,并对其进行生物信息学分析。结果表明:该基因的cDNA序列全长为1842bp,包含一个1488bp完整的开放读码框,编码495个氨基酸残基,属于糖基水解酶第十七家族,为疏水性蛋白,含有信号肽。将ScBG1与其他植物种的β-1,3-葡聚糖酶基因进行序列比对,发现该基因具有保守和典型的葡聚糖酶结构域,碱基序列的保守性为45%~73%。研究结果为该基因的实验克隆奠定基础,也为甘蔗β-1,3-葡聚糖酶基因的分子功能研究提供参考。
- 薛扳佟郭晋隆苏亚春罗俊游倩阙友雄
- 关键词:甘蔗Β-1,3-葡聚糖酶基因电子克隆生物信息学
- 甘蔗β-1,3-葡聚糖酶基因的电子克隆与分析被引量:13
- 2012年
- 以高粱β-1,3-葡聚糖酶基因(β-1,3-glucanase gene)cDNA序列为探针,搜索甘蔗EST数据库,而后通过电子克隆技术,拼接获得甘蔗β-1,3-葡聚糖酶基因ScBG。采用生物信息学方法,对该基因编码蛋白从氨基酸组成、理化性质、跨膜结构域、卷曲螺旋、亚细胞定位、信号肽、功能域及高级结构等方面进行了预测和分析。结果表明:ScBG基因全长1270bp,包含一个长达1011bp的完整开放读码框(open reading frame,ORF),编码336个氨基酸,分子量为34.8KD,理论等电点为4.98。该蛋白质很可能是胞外定位的诱导物释放型酸性葡聚糖酶,是一种稳定的分泌蛋白,且可信度达最高等级1。该蛋白属于糖苷水解酶第17家族,含有N端信号肽,在第7~29位氨基酸处含有跨膜信号区,在第31~321位氨基酸处含有糖苷水解酶17家族结构域,含2个主要的功能结构域。10个物种ScBG蛋白氨基酸序列的同源性分析表明,甘蔗ScBG基因编码蛋白与高粱β-1,3-葡聚糖酶基因的编码蛋白的同源性最高,达79.82%。以上研究结果为ScBG基因下一步的分子克隆、功能鉴定和应用提供基础。
- 方静平苏亚春游倩阙友雄许莉萍陈如凯
- 关键词:甘蔗3-葡聚糖酶电子克隆生物信息学
- 甘蔗品种的AFLP和SSR标记鉴定及其应用被引量:4
- 2018年
- 品种遗传多样性和指纹图谱是育种、品种权保护和新品种推广等工作的重要参考和依据。本研究选用38个来自国家甘蔗品种区域试验的甘蔗新品种(系),以9对AFLP标记扩增出348个位点,多态性位点248个,多态性比率为72.26%;15对SSR标记扩增出180个位点,多态性位点176个,多态性比率为97.78%。38个新品种(系)的遗传相似系数分布在0.668~0.847之间,其箱线图分布特征显示,其中的FN、MT、YZ、YG、GT等系列品种(系)遗传基础相似。通过UPGMA聚类表明,可在遗传相似系数为0.732处将38个甘蔗新品种(系)划分为2个群体,其中福农09-2201和桂糖06-1492作为一个子群体最先被划分出来,它们在群体中的异质性较强;另外,在遗传相似性系数为0.770处划分出一个子群体a,其中包含参照品种ROC22、福农07-3206、福农40、海蔗22、桂糖09-12、柳城07-150等品种(系)。ROC22具有广适应性和高产高糖等优良特性,子群体a中的另外几个品种(系)则更有可能拥有这些特性,具有更高的推广潜力。本研究选择60个SSR位点构建了38个甘蔗新品种(系)的指纹图谱,对品种鉴定及品种权的保护具有重要作用,可望直接应用于指导甘蔗种质资源的遗传多样性评价和分子指纹图谱鉴定,并将为这些品种(系)推广布局或作为杂交亲本利用提供参考和借鉴。
- 汪洲涛游倩高世武王春风李竹马晶晶阙友雄许莉萍罗俊
- 关键词:甘蔗分子标记种质鉴定
- 甘蔗种质资源分子身份证及SSR指纹数据库的构建
- 甘蔗指纹数据库的建立,不仅为育种工作者和品种测试单位提供了一个便利的数据共享平台,也为甘蔗品种鉴定及其知识产权保护,提供科学依据,还可为未来行业标准——甘蔗分子标记DUS指南的制定奠定基础。本研究利用7个gSSR和8个E...
- 游倩许莉萍苏亚春郭晋隆吴期滨阙友雄
- 关键词:甘蔗种质资源SSR分子身份证指纹数据库
- Axiom Sugarcane100K SNP芯片开发及其应用于遗传作图和抗SCYLV相关QTLs定位
- 甘蔗是生产蔗糖和生物能源乙醇的重要C4作物,已广泛种植于全球100多个热带和亚热带国家。蔗糖约占世界食糖总产的78%,占中国食糖总产的90%以上,同时,在全球范围内,大约60%的生物乙醇来自甘蔗。然而,甘蔗的生产受到许多...
- 游倩
- 关键词:甘蔗数量性状位点
- 甘蔗种质资源的SSR遗传多样性分析及指纹数据库构建
- 种质是甘蔗杂交育种的基础,对甘蔗分子遗传多样性所进行的研究,可为甘蔗标记辅助育种提供基础数据,而栽培品种的分子遗传多样性研究,对甘蔗品种多系布局有一定的指导作用。同时,基于SSR位点的荧光标记获得的甘蔗种质资源分子指纹数...
- 游倩
- 关键词:甘蔗种质资源SSR
- 文献传递
- 甘蔗种质资源的SSR遗传多样性分析
- 种质是甘蔗杂交育种的基础,甘蔗种质资源的遗传多样性分析,对亲本选择和杂交组合配置具有一定的指导作用,其中育成品种的遗传多样性分析,还可为品种多系布局提供参考依据。为此,本研究采用7个gSSR和8个EST-SSR荧光标记位...
- 游倩许莉萍苏亚春郭晋隆吴期滨阙友雄
- 关键词:甘蔗种质资源SSR毛细管电泳
- 文献传递
- 甘蔗种质资源分子身份证及SSR指纹数据库的构建
- 甘蔗指纹数据库的建立,不仅为育种工作者和品种测试单位提供了一个便利的数据共享平台,也为甘蔗品种鉴定及其知识产权保护,提供科学依据,还可为未来行业标准——甘蔗分子标记DUS指南的制定奠定基础。本研究利用7个gSSR和8个E...
- 游倩许莉萍苏亚春郭晋隆吴期滨阙友雄
- 关键词:甘蔗种质资源SSR分子身份证指纹数据库
- 文献传递