李晶
- 作品数:4 被引量:25H指数:3
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- 相关领域:农业科学生物学更多>>
- 猕猴桃EST序列的SSR信息分析被引量:11
- 2009年
- 【研究目的】通过筛查猕猴桃EST数据库中的SSR重复序列,可为开发出新型的猕猴桃EST-SSR标记和分子生物学研究奠定理论基础;【方法】从NCBI公共数据库中最新公布的猕猴桃表达序列标签(Expressed Sequence Tag,EST)中随机抽取56400条序列,应用SSRHunter软件查找微卫星(Microsatellite,SSR)重复序列;【结果】研究结果表明,从猕猴桃EST序列中获得了7939条SSR,其中包括二核苷酸重复5131条(64.63%),三核苷酸重复1237条(15.58%),四核苷酸重复284条(3.58%),五核苷酸重复397条(5.00%),六核苷酸重复890条(11.21%)。在二核苷酸重复序列中,AG/CT共分布4654条(90.70%)。大约每2.48kb长度的单一基因序列中即存在1个SSR,即平均7个单一基因中存在1个SSR;【结论】在猕猴桃EST序列中,二核苷酸重复序列是最丰富的重复单元,其次为三核苷酸重复和六核苷酸重复。在所获得的SSR重复单元中,AG/CT为优势重复。
- 姜春芽徐小彪廖娇倪志华李晶
- 关键词:猕猴桃表达序列标签微卫星
- 果树根际微生态研究现状及展望被引量:10
- 2010年
- 果树根际微生态系统是以果树-土壤-微生物及其环境条件为主要内容的微生态系统。从系统角度概括了果树根际营养、土壤酶、土壤微生物、根际线虫及根系分泌物间的相互关系和相互作用,并指明果树根际微生态应在样品采集、土壤养分调控、根系分泌物作用机制和线虫病害等方面开展深入研究,通过合理栽培管理措施改善根际环境,为果树正常生长提供良好的土壤微生态环境。
- 倪志华李晶廖娇徐小彪
- 关键词:根际微生态根际营养土壤酶活性土壤微生物根际线虫根系分泌物
- 猕猴桃EST序列的SSR信息分析(摘要)(英文)
- 2009年
- [目的]通过筛查猕猴桃EST数据库中的SSR重复序列,为开发出新型的猕猴桃EST-SSR标记和分子生物学研究奠定理论基础。[方法]从NCBI公共数据库中最新公布的猕猴桃表达序列标签(Expressed Sequence Tag,EST)中随机抽取56 400条序列,应用SSRHunter软件查找微卫星(Microsatellite,SSR)重复序列。搜索的标准是:二核苷酸、三核苷酸、四核苷酸、五核苷酸和六核苷酸最少重复次数分别为7次、5次、4次、4次、3次,包括复合型微卫星。微卫星的重复次数越多,相应的检验出等位基因数目就越多。[结果]从猕猴桃EST序列中获得了7 939条SSR,其中包括二核苷酸重复5 131条(64.63%),三核苷酸重复1 237条(15.58%),四核苷酸重复284条(3.58%),五核苷酸重复397条(5.00%),六核苷酸重复890条(11.21%)。大约每2.48 kb长度的单一基因序列中即存在1个SSR,即平均7个单一基因中存在1个SSR。在二核苷酸重复序列中,AG/CT共分布4 654条(90.70%)。在三核苷酸中,较为丰富的3种重复基元是ACC/GGT,AAG/CTT和CGC/GCG,共分布817条,它们占三核苷酸重复中各重复基元的66.04%。在其他基元中,还包括AGG/CCT,AGC/GCT,AAC/GTT,ATC/GAT,AGT/ACT,CGA/TCG,AAT/ATT7种重复基元,共420条SSR序列,占33.96%。AGT与CGT重复基元未见分布。[结论]在称猴桃EST序列中,二核苷酸重复序列是最丰富的重复单元,其次为三核苷酸重复和六核苷酸重复。在所获得的SSR重复单元中,AG/CT为优势重复。
- 姜春芽徐小彪廖娇倪志华李晶
- 关键词:猕猴桃表达序列标签微卫星
- 八种野生壳斗科植物果实营养成分的分析研究被引量:4
- 2005年
- 对采自井冈山山区的甜槠、苦槠、锥栗、茅栗、青冈、华南石栎、红钩栲、多穗柯等八种野生壳斗科植物果实的营养成分进行分析,结果表明其果实营养成分均以淀粉、糖类为主,同时含有丰富的蛋白质、脂肪、维生素以及Ca、Mg、Fe等多种人体所必需的矿物质元素,并依据所测营养指标对其营养品质作出了初步评价。
- 杨武英丁菲李晶曾婷婷
- 关键词:果实营养成分壳斗科植物野生矿物质元素营养指标