张松
- 作品数：3 被引量：56H指数：3
- 供职机构：清华大学医学院生物医学工程系更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域：生物学更多>>
- 蛋白质亚细胞定位的生物信息学研究被引量：45
- 2007年
- 细胞中蛋白质合成后被转运到特定的细胞器中,只有转运到正确的部位才能参与细胞的各种生命活动,如果定位发生偏差,将会对细胞功能甚至生命产生重大影响.蛋白质的亚细胞定位是蛋白质功能研究的重要方面,也是生物信息学中的热点问题,数据库的构建和亚细胞定位分析及预测加速了蛋白质结构和功能的研究.
- 张松黄波夏学峰孙之荣
- 关键词：亚细胞定位生物信息学数据库蛋白质
- 基于序列保守性和蛋白质相互作用的真核蛋白质亚细胞定位预测被引量：9
- 2008年
- 蛋白质的亚细胞定位是进行蛋白质功能研究的重要信息.蛋白质合成后被转运到特定的细胞器中,只有转运到正确的部位才能参与细胞的各种生命活动,有效地发挥功能.尝试了将保守序列及蛋白质相互作用数据的编码信息结合传统的氨基酸组成编码,采用支持向量机进行蛋白质亚细胞定位预测,在真核生物中5轮交叉验证精度达到91.8%,得到了显著的提高.
- 张松夏学峰沈金城孙之荣
- 关键词：亚细胞定位氨基酸组成序列保守性蛋白质相互作用支持向量机
- 一种基于GO分子功能信息的序列编码辅助预测亚细胞定位方法被引量：4
- 2007年
- 亚细胞定位与蛋白质的功能紧密相关.本研究提出了一种新的编码方式,试图根据那些与亚细胞定位相关的蛋白质分子功能信息,结合氨基酸二肽组成以提高亚细胞定位预测的性能.结果显示,在使用支持向量机和RH数据集的测试中,该方法的预测精度有了显著的提高,同时对于蛋白质序列N端的不准确性也具有一定的鲁棒性.
- 沈金城张松孙之荣
- 关键词：亚细胞定位支持向量机
