张小轶
- 作品数：71 被引量：53H指数：5
- 供职机构：北京工业大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金北京市自然科学基金国际科技合作与交流专项项目更多>>
- 相关领域：医药卫生文化科学生物学化学工程更多>>
- HIV-1整合酶与芳香二酮酸类抑制剂相互作用的分子模拟研究被引量：2
- 2009年
- 用分子对接方法研究了一系列芳香二酮酸类抑制剂与HIV-1整合酶的识别及相互作用.结果表明,抑制剂结合到整合酶Asp64～Leu68,Thr115～Phe121,Gln148～Lys159和Mg2+所构成的口袋区,抑制机理与5CITEP相似.采用分子动力学模拟和MM/PBSA方法计算了芳香二酮酸类抑制剂与整合酶之间的结合自由能,计算结果与实验值相吻合,平均绝对偏差为3.6kJ/mol,体系范德华相互作用和溶剂化效应的非极性项是利于形成复合物的主要因素.相关性分析结果表明,结合自由能值与疏水相互作用有较强的线性相关(R=0.61),基于此,用多元线性回归方法给出了一个能较强预测芳香二酮酸类抑制剂与HIV-1整合酶的结合自由能预测模型,为后续基于抑制剂结构的抗HIV-1药物分子设计提供指导.
- 胡建平张小轶唐典勇常珊
- 关键词：整合酶分子设计
- 用分子模拟方法研究HIV-1整合酶突变体的耐药性机理(英文)被引量：2
- 2009年
- 二酮酸类化合物(DKAs)是目前最有前景的HIV-1整合酶(integrase,IN)抑制剂.为了解DKAs引起的多种耐药株共有的耐药性机理,选择3种S-1360引起的IN耐药突变体,用分子对接和分子动力学模拟,研究了野生型和突变型IN与S-1360的结合模式,基于该结合模式探讨了3种耐药突变体所共有的耐药性机理.结果表明:在突变体中,S-1360结合到耐药突变IN核心区中的位置靠近功能loop 3区却远离与DNA结合的关键残基,结合位置不同导致S-1360的抑制作用部分丧失;残基138到166区域的柔性对IN发挥生物学功能很重要,S-1360能与DNA结合的关键残基N155及K159形成氢键,这2个氢键作用降低了该区域的柔性,突变体中无类似氢键,因而该区域柔性增高;在突变体中,S-1360的苯环远离病毒DNA结合区,不能阻止病毒DNA末端暴露给宿主DNA;T66I突变导致残基Ⅰ的长侧链占据IN的活性口袋,阻止抑制剂以与野生型中相同的方式结合到活性中心,这均是产生抗药性的重要原因.这些模拟结果与实验结果吻合,可为抗IN的抑制剂设计和改造提供帮助.
- 张小轶何红秋刘斌王存新
- 关键词：耐药性HIV-1整合酶分子动力学
- 抑制HIV病毒与宿主细胞融合的非对映体多肽及其用途
- 本发明涉及一种抑制HIV病毒与宿主细胞融合的非对映体多肽及其用途。所述非对映体多肽为序列表中序列1所示多肽CT105；或者序列表中序列2所示多肽CT106；或者序列表中序列3所示多肽CT107。还包括应用所述多肽得到的化...
- 谭建军苑红领曾毅李春华刘斌张小轶王存新
- 文献传递
- 通用型离心管架
- 本发明公开了通用型离心管架，由支撑丝(1)、支撑板(2)和基座(3)组成，支撑丝(1)由刚韧富有弹性的尼龙丝或猪鬃制成，支撑丝(1)固定于两块平行的支撑板(2)内侧，呈相对分布，两侧支撑丝(1)的末端留有间隙，支撑板(2...
- 王存新刘斌张海锋陈慰祖何红秋谭建军张小轶李春华
- 生物物理课中“互动式”教学方法初探被引量：11
- 2010年
- "互动式"教学模式突出"以人为本"的教育思想,是以培养学生自主意识和创新能力为目标的教学结构模式。在生物物理教学改革中,探索了互动式教学方法的应用,取得了良好的教学效果。
- 李春华张小轶王存新
- 关键词：生物物理互动式教学模式课程教学改革
- 一种非核糖体蛋白质‑RNA复合物近天然结构的筛选方法
- 一种非核糖体蛋白质‑RNA复合物近天然结构的筛选方法，属于蛋白质‑RNA分子对接复合物结构预测领域。首先，通过构象搜索获得蛋白质‑RNA各种可能的结合模式；然后，对其合理性进行评价，其间综合考虑了蛋白质‑RNA分子间的静...
- 李春华张弘古村刘斌谢小露张蕾谭建军张小轶王存新
- 文献传递
- 抗HIV-1融合抑制剂耐药机制研究
- 谭建军张小轶陈慰祖王存新
- 一种喷雾式微生物液体样品分布装置
- 本发明公开了一种喷雾式微生物液体样品分布装置，包括气囊(1)、吸管(3)和喷雾管(5)，这三者依次紧密相连并可拆卸，吸管上设有刻度(4)，喷雾管(5)末端的喷雾头(6)设有数个均匀分布的液体分配孔，吸管(3)的近气囊端填...
- 王存新刘斌张海锋陈慰祖何红秋谭建军张小轶李春华
- 文献传递
- 通用型离心管架
- 本实用新型公开了通用型离心管架，由支撑丝(1)、支撑板(2)和基座(3)组成，支撑丝(1)由刚韧富有弹性的尼龙丝或猪鬃制成，支撑丝(1)固定于两块平行的支撑板(2)内侧，呈相对分布，两侧支撑丝(1)的末端留有间隙，支撑板...
- 王存新刘斌张海锋陈慰祖何红秋谭建军张小轶李春华
- 文献传递
- 预装式琼脂糖凝胶电泳上样缓冲液及使用方法
- 预装式琼脂糖凝胶电泳上样缓冲液及使用方法，属于琼脂糖凝胶电泳技术领域。该缓冲液包括数滴滴状浓缩上样缓冲液、塑封、封舌，塑封由低密度聚乙烯塑料对折紧密粘合而成，每滴滴状浓缩上样缓冲液均匀注入密封在塑封折缝处，数滴滴状浓缩上...
- 刘斌李春华李杉段彦华张小轶谭建军王存新
- 文献传递
