刘超
- 作品数:43 被引量:31H指数:4
- 供职机构:中国科学院计算技术研究所更多>>
- 发文基金:国家重点基础研究发展计划国家自然科学基金国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域:自动化与计算机技术生物学理学医药卫生更多>>
- 基于改进型Retinex算法的轴承滚子瑕疵检测系统设计
- 2019年
- 基于机器视觉的工件瑕疵检测技术已经成为了重要的发展趋势,然而在实际的检测环境中,光照不均问题对检测结果带来了非常大的影响。因此,光照校正处理成为了机器视觉检测的关键步骤,但是现有的光照校正算法往往存在图像细节丢失的问题,直接影响了检测效果。针对这一问题,提出了一种改进型的Retinex光照校正算法,采用中值滤波代替了高斯环绕函数,从而实现了光照分量的估计,并使用信息熵函数完成了对原图光照均匀程度的判定。同时,基于所提算法搭建了一套轴承滚子瑕疵检测系统,并对所提算法的性能进行验证。实验结果表明,与现有的Retinex系列光照校正算法相比,该算法能够更好地保留工件的图像细节,从而实现更优的检测准确率。
- 刘超刘超刘畅张玉成余翔
- 关键词:中值滤波机器视觉
- N-糖肽的规模化质谱解析方法进展被引量:6
- 2016年
- 蛋白质糖基化修饰的鉴定是蛋白质翻译后修饰分析中最具挑战性的任务之一,近几年尤其受到关注.快速发展的质谱技术为规模化的蛋白质糖基化修饰研究提供了有效的手段.与其他基于质谱技术的翻译后修饰鉴定相比,糖基化鉴定的难点在于糖链是大分子而且存在微观不均一性,另外糖链本身可以在串联质谱中碎裂且与肽段的碎裂规律不同,导致蛋白质组学的质谱解析方法和软件难以完整地鉴定肽段序列和糖链结构.完整N-糖肽的鉴定是糖基化分析的热点内容之一,针对N-糖肽的鉴定,近年来,人们开发了多种多样的质谱解析方法,其中包括用N-糖酰胺酶切除糖链后鉴定N-糖基化位点的方法、基于电子转运裂解的糖肽肽段鉴定、基于高能碰撞裂解与电子转运裂解联用或碰撞诱导裂解与三级谱联用的完整N-糖肽鉴定等等.本文对这些质谱解析方法进行了整理和综述,简要指出了目前完整糖肽鉴定软件存在的一些不足,展望了未来的发展方向.
- 曾文锋张扬刘铭琪吴建强张晓今杨皓刘超迟浩张昆孙瑞祥杨芃原贺思敏
- 关键词:糖肽糖基化质谱
- Open-pFind:新一代开放式搜索引擎显著提高肽段质谱鉴定率
- 目前,蛋白质组学已经成为本世纪生命科学的研究重点[1]。其中,人们主要使用质谱技术对生物样品进行分析,基于质谱数据的蛋白质鉴定已经成为蛋白质组学的核心技术[2]。尽管质谱仪和相关计算技术近年来发展迅速,但由于质谱数据的规...
- 迟浩刘超杨皓曾文锋孙瑞祥贺思敏
- 关键词:蛋白质鉴定
- 文献传递
- 一种提高单同位素峰判断准确率的方法和系统
- 本发明公开了一种提高单同位素峰判断准确率的方法和系统。所述方法,包括下列步骤:根据选定的串联质谱,确定候选同位素峰簇;根据所述候选同位素峰簇的色谱流出曲线的相似度和强度比值,确定同位素峰簇的起止;根据所述同位素峰簇的起止...
- 袁作飞刘超王海鹏付岩孙瑞祥贺思敏
- 一种从头测序方法
- 本发明提一种从头测序方法,该方法包括:在通过酶切产生的两个数据集中查找镜像肽段对应的镜像谱图;从所述镜像谱图中检测高可信谱峰和普通谱峰;根据所述高可信谱峰和普通谱峰构建有向无环图,其中,所述高可信谱峰对应的结点是高可信结...
- 杨皓迟浩曾文锋周文婧刘超贺思敏
- 从头测序方法及装置
- 本发明提供了从头测序方法,其包括将待解析的谱图转化为质谱连接图,统计所述质谱连接图中各条路径的得分,提取路径得分高的前若干条普通路径和修饰路径作为候选肽段,其中,所述普通路径为仅由普通边组的路径,所述修改路径为由普通边和...
- 杨皓迟浩周文婧何昆曾文锋刘超孙瑞祥贺思敏
- 文献传递
- 交联蛋白鉴定软件pLink
- 交联质谱技术将质谱技术与交联技术相结合,为研究蛋白质的三维结构与蛋白质间的相互作用提供了新的技术手段。本课题组在前人工作的基础上研发了应用于化学交联技术的二肽交联鉴定软件系统pLink[1],并于2012年发表于Natu...
- 尹吉澧孟佳明樊盛博迟浩刘超杨皓胡蓝青贺思敏孙瑞祥董梦秋
- 关键词:蛋白质组学蛋白质鉴定质谱
- 文献传递
- 交联肽段鉴定质量控制方法研究
- 化学交联质谱技术可以用于研究蛋白质结构和蛋白质相互作用[1]。由于单谱内的打分归一化效果不够理想,过滤环节需要对打分归一化得出多谱之间可以比较的分数,排序后,根据FDR阈值进行质量控制。对单谱打分进行归一化的过程称为多谱...
- 陈镇霖方润乾刘超迟浩孙瑞祥贺思敏
- 文献传递
- pSite:肽段从头测序结果中氨基酸层次假发现率的控制方法研究
- 基于质谱数据的蛋白质鉴定算法主要分为两类:数据库搜索和肽段从头测序。肽段从头测序方法不依赖于数据库信息,直接根据谱图中谱峰信息推断肽段序列。尽管该方法已经成为基于质谱数据的蛋白质鉴定的主流方法之一,目前仍然缺乏假发现率的...
- 杨皓迟浩曾文锋周文婧刘超贺思敏
- 文献传递
- pFind:蛋白质组海量质谱数据的深度解析系统
- 质谱技术是蛋白质组学研究中样品分析的重要利器。然而,当前质谱数据的解析率水平仅有30%-50%,也就是说,至少有一半数据在采集之后被白白浪费[1,2]。质谱数据解析能力的不足也直接制约着蛋白质组信息的进一步挖掘。因此,我...
- 迟浩曾文锋张昆杨皓刘超孙瑞祥贺思敏
- 关键词:蛋白质组学质谱搜索引擎
- 文献传递