董志敏
- 作品数：6 被引量：115H指数：4
- 供职机构：中国农业科学院作物科学研究所农业部作物种质资源与生物技术重点开放实验室更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家高技术研究发展计划国家科技重大专项更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 国外大豆种质的引进、研究与利用
- 邱丽娟常汝镇孙建英杨春明刘忠堂张孟臣景玉良王金陵刘章雄关荣霞辛哓云袁翠平董志敏李英慧李向华吴永美郭娟娟朱晓丽周波宁惠霞吕祝章周国安陈丽霞
- 该项目根据我国大豆产业发展的需求，共引进国内缺少的种质资源2300份。从形态生理学、遗传学和分子生物学方面对引进材料进行了鉴定评价，向全国30多个育种单位提供了优异种质万余份次。国内育种单位利用引进的63份种质，已培育出...
- 关键词：
- 关键词：大豆种质资源
- 一种获得大片段克隆的SMART全长cDNA文库构建方法被引量：8
- 2006年
- 针对SMART方法中PCR扩增削减了大片段基因所占比例，使文库中很难获得大片段克隆的问题，进行了方法改进。在原始SMART方法的基础上，以大豆叶片为材料，通过琼脂糖凝胶分级分离技术，将PCR扩增后合成的dscDNA分成3个等级，分别与载体连接、转化，构建相应亚库，每个亚库容量在1．0×10^6左右，重组率接近99％。改进方法所建文库的平均全长率53．6％，与改进前的（52．2%）相当。插入片段范围为0．5～3．5kb，最大插入片断长度比改进前的提高1．5kb。该方法提高了SMART方法中大片段克隆的获得率，为大豆功能基因组学研究提供了保障。
- 董志敏李英慧张宝石关荣霞常汝镇邱丽娟
- 关键词：全长CDNA文库
- 大豆基因组和转录组的核基因密码子使用偏好性分析被引量：59
- 2011年
- 研究大豆核基因密码子的使用模式,探讨影响其密码子组成和编码特点的因素,为运用基因工程技术提高改良大豆提供理论依据。以大豆基因组的46430个高置信编码基因和2071条大豆全长转录本序列为数据来源,应用CodonW软件对大豆全基因组密码子组成、同义密码子使用频率和全长转录组编码区密码子使用各项参数的计算和统计分析发现,基因的表达水平与编码区G+C和GC3s含量均呈极显著正相关,且G+C和GC3s含量越高的基因密码子使用偏好性越高,并确定了UCC和GCC为大豆最优密码子。编码区长度分组分析表明,密码子使用偏好性随编码区长度的增加而降低,编码区较长的基因则趋向于随机使用密码子,且在转录组数据范围内,编码区长度介于400～600bp的基因表达水平最高。大豆叶片和种子中特异表达基因的密码子使用偏好性和基因表达水平较为接近,但种子特异表达基因的G+C和GC3s含量均显著高于叶片特异表达基因,而其芳香族氨基酸含量则极显著低于叶片特异表达基因。
- 张乐金龙国罗玲王跃平董志敏孙守红邱丽娟
- 关键词：大豆基因组转录组密码子
- 大豆叶片全长cDNA文库的构建及表达序列标签初步分析
- 大豆是世界上食用油和高蛋白的主要植物资源,研究其基因组结构与功能,将从实质上解决大豆遗传研究中所面临的难题,进而给大豆遗传育种和大豆生产带来历史性的飞跃。在进行大规模的全基因组测序前,构建cDNA文库进行表达序列标签分析...
- 董志敏常汝镇关荣霞李英慧刘章雄邱丽娟
- 文献传递
- 全长cDNA文库的构建方法被引量：40
- 2006年
- 全长cDNA文库的构建是进行功能基因组研究的一种经济、快速、有效的途径,克服了传统cDNA文库的缺点,节省了基因克隆和功能鉴定的时间,促进了功能基因组的研究进程。目前有6种构建全长cDNA文库的方法,包括Oligo-Capping、CAPture、SMART、CAP-trapper、CapSelect、CAP-jumping。这几种方法在起始材料用量、文库构建技术、实验操作复杂程度和文库构建质量等方面构存在不同程度的优缺点,但综合比较而言,SMART和CAP-trapper这两种方法比较有实际应用价值。SMART法适于简单、快速地构建一般质量的cDNA文库,如果采用Little-cycleSMART和Large-sizeSMART这两种改进技术,所建文库质量也非常好;CAP-trapper法虽然对实验技术要求较高,实验过程复杂,但所建文库全长率高,冗余性低,建库效率高,是目前构建高质量文库最好的方法。
- 董志敏张宝石关荣霞常汝镇邱丽娟
- 关键词：全长CDNA
- 大豆叶片全长cDNA文库的构建与鉴定被引量：15
- 2006年
- 以大豆绥农14第一个三出复叶幼叶为材料提取mRNA，利用SMART技术合成了全长cDNA，经限制性内切酶SfiA和靳日消化后的cDNA克隆到质粒载体pDNR—LIB中，建成大豆叶片全长cDNA文库。文库容量1．2×10^6，重组率接近100％。对随机挑取的克隆进行菌液PCR鉴定，插入片断大小范围为0．25～2．0kb，主要集中在0．5～1．5kb，插入片断平均大小为0．9kb，这说明文库质量可保证大规模全长cDNA的获得。
- 董志敏李英慧张宝石关荣霞常汝镇邱丽娟
- 关键词：大豆叶片SMART全长CDNA文库
