林庆玲
- 作品数:15 被引量:17H指数:2
- 供职机构:首都医科大学宣武医院更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划教育部“新世纪优秀人才支持计划”更多>>
- 相关领域:医药卫生生物学更多>>
- 时钟基因启动子甲基化修饰在衰老小鼠不同组织中特异性改变
- 目的:动物几乎所有组织都存在生物钟。随着动物的衰老,其生物钟往往也发生着改变,它对衰老及与衰老相关的病理过程的影响也越来越引起研究者的重视。时钟基因DNA启动子甲基化是基因表达调控中常见而重要的机制,参与老化及相关疾病的...
- 陆璐林庆玲孙芳玲李雅莉蔡彦宁李林张兰
- 时钟基因甲基化修饰在衰老小鼠组织中的特异性改变
- 目的:随着动物的老化,其昼夜节律往往也发生改变。在衰老机制中,昼夜节律的改变越来越引起研究者的重视。然而,这些与衰老相关的昼夜节律的改变分子机制还不完全清楚。本实验对衰老动物时钟基因甲基化的增龄改变及与昼夜节律紊乱的关系...
- 陆璐林庆玲孙芳玲李雅莉蔡彦宁李林张兰
- 文献传递
- 启动子区E-box以及周围CpG岛的甲基化与基因节律性表达的关系被引量:2
- 2011年
- 目的探讨mPer2、mCry1和mDBP启动子区E-box以及周围CpG岛的甲基化是否影响E-box和BMAL1/CLOCK基因和蛋白相互作用的方式;以及启动子区的甲基化状态是否影响MAP激酶磷酸化酶1(MAP kinase phosphatise 1,MKP1)的组织特异性表达调控。方法分6个时间点取C57 BL/6J小鼠的肝脏和肾脏,提取DNA,通过重硫酸盐处理基因组DNA,以及测序检测E-box和周围CpG岛的甲基化状态。结果 mPer2、mCry1和mDBP启动子区E-box以及周围CpG岛无明显甲基化状态,肝脏和肾脏中MKP1的E-box以及周围CpG岛亦无明显甲基化状态。结论节律基因的启动子区E-box以及周围CpG岛的甲基化不参与节律基因表达的日节律性调控。
- 左晓虹刘姝林庆玲李宁陈彪蔡彦宁
- 关键词:时钟基因E-BOXCPG岛DNA甲基化
- 小鼠外周组织时钟基因启动子区甲基化分析被引量:2
- 2012年
- 目的应用一种简单快速经济的方法检测8个主要时钟基因PER1、PER2、CRY1、CRY2、CLOCK、NPAS2、BMAL1和BMAL2启动子区甲基化状态,检测小鼠外周组织肝、心、肾、胸腺、睾丸时钟基因启动子区甲基化状态。方法用偏重亚硫酸氢钠和对苯二酚对基因组DNA进行修饰。修饰后的DNA为模板,两套不同的引物对:甲基化特异性引物对和非甲基化特异性引物对扩增小鼠肝、心、肾、胸腺、睾丸组织时钟基因启动子区。PCR产物进行电泳和测序。结果扩增产物与预期片段大小相符合。PCR产物经过直接测序进一步证实小鼠外周组织时钟基因启动子区均为非甲基化状态。结论建立了一种检测小鼠时钟基因启动子区甲基化的新方法,借此证明成年小鼠5个外周组织8个时钟基因启动子区均呈非甲基化状态。
- 林庆玲蔡彦宁袁艳鹏左晓虹
- 关键词:时钟基因启动子甲基化特异性PCR
- 基于等位基因特异性引物延伸的高分辨率熔解曲线基因分型方法的建立被引量:1
- 2010年
- 目的建立基于等位基因特异引物延伸的高分辨率熔解曲线法(allele-specific-extension high resolution melting curve analysis,ASE-HRM)。方法 ASE-HRM法是在普通高分辨率熔解曲线法(high resolution melting curve analysis,HRM)的PCR反应体系中加入一条等位基因特异性延伸引物(allele-specific-extension,ASE),该引物末端终止于单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点,匹配一种等位基因。增加热循环次数,使等位基因特异性引物得以延伸。选取rs1869458位点,用ASE-HRM法和直接测序法对194个人源基因组DNA样品进行基因分型。结果通过分析熔解曲线扩增峰,可区分杂合型和纯合型SNP;通过分析有无引物延伸峰,可区分2种纯合型;同时证明长度为11到13个碱基的ASE引物能得到较好的分型结果;使用锁定核酸(locked nucleic acid,LNA)修饰扩增引物可增加扩增产物和延伸产物的解链温度(melting temperature,Tm)差距,简化基因分型。2种方法对所选DNA样品基因分型所得结果完全吻合。结论 ASE-HRM是一种简单、廉价、闭管并能用于检测所有类型SNP的基因分型法。
- 袁艳鹏林庆玲左晓虹蔡彦宁
- 关键词:单核苷酸多态性高分辨率熔解曲线
- 帕金森病患者外周血白细胞中时钟基因Bmal1和Bmal2的表达被引量:2
- 2011年
- 目的研究帕金森病患者时钟基因的表达,探讨帕金森病的分子时钟机制。方法实验对象为17例帕金森病(PD)患者(9例男性,8例女性)和16例正常人对照(9例男性,7例女性),分别在夜间21:00、00:00、06:00和09:00四个时间点取血样,用实时定量RT—PCR检测时钟基因Bmal1和Bmal2的mRNA表达水平。结果PD患者中,Bmal1在21:00、00:00、06:00的表达水平与正常对照差异具有显著性:21:00[(22.17±4.09),(51.14±8.31),P=0.003];00:00[(30.30±5.45),(100.00±24.71),P=0.008];06:00[(19.02±3.33),(65.61±14.11),P=0.002]。Bmal2在21:00、00:00的表达水平与正常对照差异有显著性:21:00[(48.09±7.40),(84.96±9.34),P=0.005];00:00[(65.85±7.88),(100.00±11.78),P=0.025]。结论PD患者的周围分子时钟发生了改变。PD患者时钟基因Bmal1和Bmal2在外周血的相对表达水平明显减低,为疾病监控和研究疾病对药物的反应性提供分子基础。
- 林庆玲蔡彦宁袁艳鹏左晓虹陈彪
- 关键词:BMAL1昼夜节律白细胞帕金森病
- 衰老小鼠不同组织八种时钟基因启动子甲基化修饰的特异性改变
- 目的动物几乎所有组织都存在生物钟。随着动物的衰老,其生物钟往往也发生着改变,它对衰老及与衰老相关的病理过程的影响也越来越引起研究者的重视。时钟基因DNA启动子甲基化是基因表达调控中常见而重要的机制,参与老化及相关疾病的病...
- 陆璐林庆玲孙芳玲李雅莉蔡彦宁李林张兰
- 文献传递
- 衰老小鼠不同组织八种时钟基因启动子甲基化修饰的特异性改变
- 目的 动物几乎所有组织都存在生物钟.随着动物的衰老,其生物钟往往也发生着改变,它对衰老及与衰老相关的病理过程的影响也越来越引起研究者的重视.时钟基因DNA 启动子甲基化是基因表达调控中常见而重要的机制,参与老化及相关疾病...
- 陆璐林庆玲孙芳玲李雅莉蔡彦宁李林张兰
- 关键词:抗衰老药物药理活性时钟基因
- 帕金森病患者外周血白细胞中时钟基因Bmal1和Bma12的表达
- 研究帕金森病患者时钟基因的表达,探讨帕金森病的分子时钟机制。实验对象为17例帕金森病(PD)患者(9例男性,8例女性)和16例正常人对照(9例男性,7例女性),分别在21:00、00:00、06:00和09:00四个时间...
- 张燕莉林庆玲蔡彦宁袁艳鹏左晓虹陈彪
- 关键词:BMAL1昼夜节律白细胞帕金森病
- 文献传递
- 中国人群PITX3基因多态性与帕金森病的相关性被引量:7
- 2012年
- 目的分析中国人群PITX3基因多态性与帕金森病的相关性。方法使用连接酶检测反应(LDR)法,分析509例晚发性帕金森病(LOPD)患者、290例早发性帕金森病(EOPD)患者和494例正常对照中PITX3基因单核苷酸多态性(SNPs)位点rs2281983、rs4919621和rs3758549基因型。结果PITX3基因SNPs位点rs2281983、rs4919621和rs3758549的基因型和等位基因频率在799例帕金森病患者和494例正常对照组间(基因型频率P值分别为0.494,0.343,0.951;等位基因频率P值分别为0.369,0.297,0.823)、509例LOPD和494例正常对照组间(基因型频率P值分别为0.522,0.350,0.630;等位基因频率P值分别为0.413,0.328,0.571)、290例EOPD和494例正常对照组间(基因型频率P值分别为0.499,0.492,0.552;等位基因频率P值分别为0.321,0.301,0.931)、509例LOPD和290例EOPD间(基因型频率P值分别为0.577,0.710,0.127;等位基因频率P值分别为0.346,0.472,0.077)均差异无统计学意义。三个SNPs位点与PD无关联。结论中国人群中,PITX3基因多态性不是帕金森病的易感因素。
- 林庆玲蔡彦宁王丹慧丁晖顾朱勤马敬红陈彪
- 关键词:早发性帕金森病单核苷酸多态性