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杨恩泽
作品数:
3
被引量:10
H指数:1
供职机构:
暨南大学药学院
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发文基金:
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相关领域:
医药卫生
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合作作者
王峰
暨南大学药学院
吴秋红
暨南大学药学院
高辉
暨南大学药学院
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阳春砂二酮辅酶A合成酶的基因克隆及序列分析
被引量:1
2013年
目的对阳春砂姜黄素生物合成途径的关键酶二酮辅酶A合成酶(diketideCoAsynthase,DCS)基因的编码cDNA序列进行克隆,为研究阳春砂姜黄素生物合成与基因调控奠定基础。方法结合阳春砂的转录组注释,根据编码区序列设计引物,通过PCR方法克隆阳春砂DCS基因的编码区cDNA。结果PCR扩增了一个长1170bp的基因片段,该片段编码由389个氨基酸组成的DCS。同源性比对结果显示基因编码蛋白与姜黄的DCS具有氨基酸一致性达96%,与水仙等植物的查耳酮合酶(chalconesynthase,CHS)氨基酸一致性达66%-69%。进化树分析结果显示,与姜黄CurcumaeLongae具有较近的亲缘关系。结论首次从阳春砂中克隆DCS基因获得其编码区序列,为分析基因表达特性及其在姜黄素生物合成中的功能奠定基础。
杨恩泽
高辉
吴秋红
王峰
关键词:
阳春砂
姜黄素
hMnSOD及其异构体在肿瘤转移中的作用
目的: 研究h Mn SOD在肿瘤转移过程中的作用并对其分子机制进行初步探索,探讨h Mn SOD异构体对肿瘤转移影响的差异。方法: 对不同种类细胞中hMnSOD及其截短型异构体的表达谱进行分析并测定其SOD活力。构建h...
杨恩泽
关键词:
锰超氧化物歧化酶
剪接异构体
肿瘤转移
文献传递
阳春砂磷酸甲羟戊酸激酶的基因克隆与表达谱分析
被引量:9
2015年
目的:为了了解阳春砂磷酸甲羟戊酸激酶(PMK)的功能与表达特性,根据阳春砂的转录组注释设计引物,PCR 克隆阳春砂甲羟戊酸途径中的关键酶磷酸甲羟戊酸激酶基因的编码区 cDNA,使用生物信息学方法对其编码的蛋白进行相似性检索及同源序列比对,构建进化树,预测二级及三级结构并分析其功能,探索其各器官中的表达差异.结果:获得了全长1539 bp 的编码阳春砂 PMK 的 cDNA 序列,命名为 AvPMK (GenBank 登录号:KF569902),编码由512个氨基酸组成的磷酸甲羟戊酸激酶,该蛋白含有 GHMP 激酶超家族特异的 N -保守区域、C -保守区域和 ATP 结合位点 Gly-X-Gly-XX-Ala.AvPMK 与其他植物的 PMK 氨基酸相似性达61%~69%,进化树结果显示其与二穗短柄草(Brachypodium distachyon)等单子叶植物具有较近的亲缘关系.AvPMK 蛋白包含14个α-螺旋(Alpha helix),占37.1%;16个β链(Beta strand),占15.6%;32个无规则卷曲结构,占47.3%,无跨膜结构域,其3级结构含有一个催化反应的口袋状结构域.实时荧光定量 PCR 结果显示 AvPMK 基因在叶中表达量较高,茎、根中表达量相对较低.结论:首次从阳春砂仁中扩增磷酸甲羟戊酸激酶的基因片段,为分析其基因表达特性及其在砂仁萜类生物合成中的功能奠定基础.
杨恩泽
陆颖锶
吴秋红
王峰
关键词:
阳春砂
萜类化合物
基因克隆
表达谱分析
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