毕德玺
- 作品数：12 被引量：6H指数：2
- 供职机构：上海交通大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划国家科技支撑计划更多>>
- 相关领域：生物学医药卫生农业科学化学工程更多>>
- 细菌基因组序列中ε-聚赖氨酸合成酶的生物信息学识别与分析被引量：3
- 2015年
- 【目的】ε-聚赖氨酸的合成由ε-聚赖氨酸合成酶(Pls)所控制,考察Pls在细菌中的分布和保守的序列特征。【方法】基于Pls的作用机制,在蛋白序列中识别与底物结合和缩合相关的结构域,以及决定底物特异性的氨基酸残基,进而在已测序基因组中预测Pls。【结果】发现110个已测序的基因组中编码113个预测的Pls,主要分布在放线菌中,也在两株革兰氏阴性菌中被发现。一些亲缘性较高菌株的Pls一致性较高。【结论】Pls在放线菌中可能广泛分布。Pls的腺苷化、巯基化和底物缩合结构域有相对较高的序列保守性,而跨膜结构域和Linker区相对不保守。
- 王静谭之磊毕德玺贾士儒欧竑宇
- 关键词：Ε-聚赖氨酸
- A Site-Specific Integrative Plasmid Found in Pseudomonas aeruginosa Clinical Isolate HS87 Along with A Plasmid Carrying An Aminoglycoside-Resistant Gene
- 毕德玺欧竑宇
- Bacterial Type Ⅱ toxin-antitoxin locus distribution and classification
- 欧竑宇卫以青毕德玺邓子新
- 多重耐药肺炎克雷伯菌可移动基因组的研究
- 微生物能够通过基因水平转移的方式获得致病和耐药等相关基因。质粒、插入序列（insertion sequence，IS）、转座子、整合子、整合性接合元件（integrative and conjugative elemen...
- 毕德玺
- 关键词：肺炎克雷伯菌多重耐药
- Mapping the resistance-associated mobilome of a carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae strain reveals insights into factors shaping these regions
- Dramatic increases in the levels of multiple-antibiotic resistance associated with Klebsiella pneumoniae,parti...
- 毕德玺欧竑宇
- SecReT4:细菌四型分泌系统及效应蛋白的开放数据库
- 毕德玺邓子新欧竑宇
- BACTERIAL TYPE Ⅱ TOXIN-ANTITOXIN LOCUS DISTRIBUTION AND CLASSIFICATION
- 欧窮宇卫以青毕德玺邓子新
- 文献传递网络资源链接
- The conservation and diversity of bacterial integrative and conjugative elements
- 毕德玺邓子新欧竑宇
- 文献传递
- 链霉菌基因组中放线菌型整合性接合元件的识别被引量：2
- 2013年
- 【目的】链霉菌染色体重组和外源DNA片段插入是影响其遗传多样性的主要因素。旨在考察放线菌型整合性接合元件(AICE)在链霉菌遗传多样性中所发挥的作用。【方法】基于AICE的特征性模块,采用隐马尔科夫模型预测链霉菌基因组序列中的AICEs。【结果】在已全测序的12条链霉菌染色体和35个质粒中,共识别出29个AICEs,其中12个为首次报道。Streptomyces coelicolor基因组中发现了4个AICEs,而其近缘的Streptomyces lividans却没有。【结论】AICEs都整合在链霉菌染色体的核心区,且都具有典型的整合环出、复制和接合转移等核心模块,这些可自行转移的元件在链霉菌基因组可塑性中扮演了重要角色。
- 徐珍毕德玺李鹏谭之磊邓子新欧竑宇贾士儒
- 关键词：隐马尔科夫模型
- 链丝菌素生物合成基因簇的克隆及其异源表达
- 2016年
- 通过基因组粘粒文库的高通量接合转移、异源表达和生物活性测定,结合DNA序列测定,从刺孢吸水链霉菌AA97026中筛选具有广谱抗菌活性的小分子化合物及其生物合成基因簇,获得1个对革兰氏阳性细菌和红酵母均有抑制活性的阳性克隆1H5,其部分DNA序列与链丝菌素生物合成基因相似。含1H5的异源链霉菌宿主的发酵液均能检测到链丝菌素的不同组份,表明1H5含有完整的链丝菌素生物合成基因簇。
- 陈萌徐敏王业民白亭丽毕德玺邓子新陶美凤
- 关键词：链霉菌异源表达
