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Cas9-CRISPR敲除hae3基因对斑马鱼血红蛋白生成的影响被引量：3: 2015年; 为获得hae3基因缺失的突变体,并研究hae3基因对血红蛋白生成的影响,以斑马鱼Danio rerio为研究对象,利用Cas9-CRISPR技术,成功建立了缺失血红蛋白hae3基因的鱼类模型,采用显微注射技术将hae3 sgRNA与Cas9 RNA混合后对斑马鱼第一细胞期受精卵动物极进行注射,利用序列测定与比对、T7核酸酶酶切方法成功检测到了hae3基因的敲除,并对缺失hae3基因的斑马鱼和对照组斑马鱼同时进行固蓝(O-dianisidine)染色。结果表明,与对照组相比,试验组斑马鱼血红蛋白含量明显下降,并有畸形表型。研究表明,胚胎时期hae3基因的缺失会严重影响斑马鱼血红蛋白的生成,而且伴随畸形发育表型。; 蔡畅王丛丛吴智超刘云郭亚南许强华; 关键词：斑马鱼血红蛋白基因敲除

3种高原裂腹鱼肝脏组织转录组比较分析: 2024年; 青藏高原低温、低氧的极端环境特征是生物适应性进化的天然实验室。裂腹鱼亚科鱼类广泛分布于青藏高原附近水域,在长期进化过程中适应了独特的高原环境。为揭示裂腹鱼适应高原环境的关键信号通路,以2种高海拔(>3000 m)的高原裂腹鱼[巨须裂腹鱼(Schizothorax macropogon)、拉萨裂腹鱼(S.waltoni)]和1种低海拔(<1000 m)的原始裂腹鱼[齐口裂腹鱼(S.prenanti)]为研究对象,对3种裂腹鱼的能量代谢主要组织—肝脏进行转录组测序比较分析。通过对高海拔与低海拔裂腹鱼肝脏转录组的比较,在2种高海拔裂腹鱼中找到共同差异变化的基因106个,其中66个基因表达上调,40个下调。GO和KEGG富集分析显示,氧化还原过程、血液发生相关途径、氨基酸的代谢和类固醇的生物合成是高海拔裂腹鱼应对高原环境的最重要途径。其中,氧化还原和血液生成相关基因(如:faxdc2、cpox、cyp51和NADH-cytochrome b5 reductase 2)的高表达可能在应对高原环境中发挥着重要作用。该研究为鱼类高原低氧适应的分子机制研究提供了新见解。; 郝恬汤先湖江守文江守文许强华; 关键词：裂腹鱼肝脏低氧

三种裂腹鱼血细胞及血浆的元素含量测定与比较: 2023年; 为探究高原裂腹鱼对高原低氧环境的适应性,本实验采用电感耦合等离子体质谱(ICP-MS)分析法测定并比较了两种高海拔的裂腹鱼,拉孜裸鲤(Gymnocypris scleracanthus)(4580 m)与尖裸鲤(Oxygymnocypris stewartia)(3650 m)和一种低海拔的齐口裂腹鱼(Schizothorax prenanti)(650 m)体内血细胞及血浆中的11种元素含量。结果表明,血细胞Cr、Mg和Cu的含量在三种裂腹鱼间呈显著差异;分布于低海拔的齐口裂腹鱼血浆中K和P的含量显著高于拉孜裸鲤和尖裸鲤,Na的含量显著低于两种高海拔裂腹鱼。为适应高原低温缺氧环境,裂腹鱼会通过调控体内元素含量来调整机体代谢水平。本研究结果可为裂腹鱼高原低氧环境的生理适应机制研究提供新的思路。; 侯微微吴智超江守文林枫许强华; 关键词：裂腹鱼青藏高原血细胞血浆

宏基因组学技术在水产动物病毒鉴定中的应用被引量：2: 2019年; 近年来水产养殖生产中病毒性疾病的发生越来越严重,所以对水产动物病毒的深入研究成为水产研究者的一个重要课题。随着宏基因组学技术的不断发展,以及测序成本的快速下降,基于宏基因组学技术的水产动物病毒鉴定技术逐渐成为水产动物病毒鉴定的主要技术之一。本文总结了基于宏基因组学的水产动物病毒鉴定技术的主要方法,详细综述了鉴定技术的实现流程,评述了几种基于宏基因组学的水产动物病毒鉴定技术的优缺点,并对基于宏基因组学的水产动物病毒鉴定技术的未来发展方向进行了展望。; 彭司华江守文江守文孙丹陈洁; 关键词：宏基因组学病毒鉴定

齐口裂腹鱼zona pellucida3的克隆表达及其蛋白活性研究被引量：3: 2015年; 为了研究齐口裂腹鱼Schizothorax prenanti的低温适应性,根据齐口裂腹鱼卵巢转录组测序结果设计引物,采用RT-PCR法克隆得到齐口裂腹鱼zona pellucida 3(Schizothorax prenanti zona pellucida 3,sp-zp3)基因的编码区,将目的基因重组到表达载体,并将质粒转染至中国仓鼠的卵巢细胞(CHO-K1)中进行表达,分离纯化得到ZP3蛋白后,对其冰晶结合活性进行初步测定。结果表明:齐口裂腹鱼zp3基因在中国仓鼠卵巢细胞中高效表达,并纯化得到重组蛋白SP-ZP3,该蛋白具有一定的冰晶结合活性。研究表明,一些鱼类ZP蛋白可能具有冰晶结合活性,当选择压力存在时这些ZP蛋白将进化出具有冷适应性的功能。; 马战领胡瑞芹黄巧吴智超陈良标; 关键词：齐口裂腹鱼

吉木萨尔凹陷芦草沟组页岩油地球化学特征与运聚意义被引量：5: 2023年; 准噶尔盆地吉木萨尔凹陷芦草沟组甜点段页岩油资源丰富,前人在页岩油来源、运聚特征及物性差异原因等方面存在争论。结合芦草沟组纵向分子地球化学特征分析,基于其上、下甜点段及邻近层段泥岩、碳酸盐岩与砂岩抽提物的分子化合物组成、地球化学参数的对比分析,揭示了芦草沟组上、下甜点段页岩油生成与运聚特征,并解释了上、下甜点段原油物性差异原因。研究结果表明:芦草沟组上、下甜点段具有更高的总有机碳质量分数、游离烃质量分数及烃类可采系数,显示明显的生烃聚集特征;上、下甜点段沉积环境还原性与水体咸度相较于其他层段更高,藻类输入生源特征更为显著;上、下甜点段内砂岩储集的烃及原油与泥岩、碳酸盐岩抽提物具有相似的分子组成特征,而与上、下甜点之间的层段显著不同,揭示芦草沟组上、下甜点段之间存在一个由分子组成迥异的石油运聚隔断层,上、下甜点段为2套独立的自生自储、内源成藏的油气系统;芦草沟组上、下甜点段页岩油生成与运聚过程的差异性在一定程度影响了原油物性垂向倒置的形成。; 李洪波吴智超吴智超金秀辉张敏; 关键词：页岩油地球化学芦草沟组吉木萨尔凹陷准噶尔盆地

3种不同海拔裂腹鱼肾脏转录组比较: 2024年; 裂腹鱼亚科鱼类长期生活在青藏高原缺氧环境,是研究低氧适应机制的天然生物模型。对3种裂腹鱼:高海拔(>3600 m)的孤唇裂腹鱼和巨须裂腹鱼与低海拔(<700 m)齐口裂腹鱼的主要渗透调节器官肾脏进行转录组分析。通过对孤唇裂腹鱼和巨须裂腹鱼与齐口裂腹鱼的肾脏转录组进行比较分析,分别筛选出504个和478个差异表达基因,其中有199个共同差异表达基因。对共同差异基因进行GO(Gene Ontology)和KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)的富集分析发现,两组共同差异基因主要富集在糖酵解/糖原生成过程、脂质生物合成过程和血管生成等通路上。其中eno3、fbp1α、prpf19和ctsz等基因的高表达可能在高海拔裂腹鱼长期适应低氧环境中起着重要作用。本研究为揭示高原鱼类长期低氧适应提供了新思路。; 汤先湖郝恬江守文吴智超吴智超; 关键词：裂腹鱼转录组糖代谢低氧

独角雪冰鱼与其他三种南极鱼鳃组织的转录组差异分析被引量：1: 2021年; 为探究血红蛋白缺失对免疫功能造成的影响,针对一种缺乏血红蛋白和功能性血红细胞的南极独角雪冰鱼(Chionodraco hamatus)和3种具有血红蛋白和血红细胞的南极鱼物种(伯氏肩孔南极鱼(Trematomus bernacchii)、博氏南冰■(Pagothenia borchgrevinki)和革首南极鱼(Notothenia coriiceps))的鳃组织进行转录组测序比较研究。结果表明:在参与比较的7498个基因中,2796个基因在南极冰鱼鳃中呈显著变化,其中,1584个基因在南极冰鱼鳃组织中的表达量显著降低,1212个基因表达量显著上升。差异基因的KEGG Pathway富集分析显示,33条与免疫和低氧相关的通路(如HIF-1信号通路)在南极冰鱼鳃中得到了富集。差异基因的GO富集分析也揭示出南极冰鱼在与免疫功能和红细胞发生相关的多个生物过程GO通路中(如免疫系统发育、稳态过程和造血或淋巴器官发育等)发生了富集。值得一提的是,在南极冰鱼鳃中表达量下降的基因(如gata1a,tfr1a,kmt2a,slc4a1a,myb,alas2,epor,slc25a37和metap2a等)中许多都与免疫功能和红细胞发生相关,这与南极冰鱼血红细胞发生受抑制相一致。可见,独角雪冰鱼与其他三种南极鱼鳃组织在免疫方面基因的表达差异显著,为揭示南极鱼类免疫机制的进化提供了参考资料。; 王小彤李文豪林枫江守文翟万营吴智超许强华; 关键词：免疫

中部太平洋大眼金枪鱼(Thunnus obesus)种群遗传结构的初步研究: 2014年; 大眼金枪鱼(Thunnus obesus)是世界最重要的渔业资源之一,经济价值较高,捕捞压力的加大使中部太平洋大眼金枪鱼过度捕捞程度愈发严重。开展种群遗传结构研究将为大眼金枪鱼资源的可持续利用与开发提供科学依据。本文以取自中西太平洋和中东太平洋共182尾大眼金枪鱼个体为研究对象,分析研究其线粒体DNA控制区第一个高变区(the first hypervariable region,HVR-1)457bp的序列,共发现115个变异位点,定义了178种单倍型。序列多样性分析结果显示:8个采样点核苷酸多样性在0.03074—0.04362之间,单倍型多样性在各个采样点都较高,变动范围在0.996—1.000之间;分子方差分析显示99.97%的遗传变异性来自于种群内;群体间的高基因交流值Nm和低分化指数Fst揭示中东太平洋与中西太平洋群体间基因交流频繁,不存在显著的遗传分化。; 吴智超许强华许柳雄戴小杰戴小杰; 关键词：种群遗传结构线粒体DNA 控制区

Asb14a 基因在斑马鱼肌间骨发育中的作用: 2024年; 为进一步研究肌间骨(intermuscular bone)发育的分子机制,利用CRISPR/Cas9打靶技术、茜素红染色及实时荧光定量PCR方法,研究了斑马鱼(Danio rerio)Asb14a基因敲除后肌间骨的发育情况。结果表明:本研究中成功构建了插入2 bp和缺失50 bp的Asb14a基因敲除纯合斑马鱼品系;茜素红染色显示,成年Asb14a^(-/-)突变体与野生斑马鱼相比,肌间骨数量显著减少了35%(P<0.0001),说明敲除Asb14a基因会减少斑马鱼肌间骨的数量;实时荧光定量PCR结果显示,骨骼发育相关基因(bmp6、sp7、sox6、alpl、collala、sox6和smad1)在Asb14a^(-/-)突变体中的表达水平发生了显著性变化,从分子角度验证了Asb14a基因与肌间骨发育间的关联性。研究表明,Asb14a基因参与了斑马鱼肌间骨发育,敲除该基因会影响斑马鱼肌间骨的生成,这一发现为进一步研究肌间骨发育的分子机制提供了重要线索。; 牛明慧王化敏胡瑞芹胡鹏胡鹏陈良标; 关键词：斑马鱼

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吴智超

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