吕海霞
- 作品数:9 被引量:90H指数:6
- 供职机构:中国农业科学院油料作物研究所更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金中国农业科学院油料作物研究所所长基金国家现代农业产业技术体系建设项目更多>>
- 相关领域:农业科学生物学更多>>
- 利用抑制差减杂交分离芝麻耐湿性相关基因被引量:14
- 2010年
- 为分离芝麻耐湿性相关基因,以敏感品种鄂芝2号和耐湿品种2541为实验材料,通过抑制差减杂交(SSH)构建了芝麻湿害胁迫的差减cDNA文库。在随机挑取的162个阳性克隆中,测序获得146条高质量的EST,含有106条非重复序列(Unigenes)。其中82条非重复序列与GenBank中的基因或蛋白具有较高的同源性,占全部序列的77.36%。对有功能注释的39条同源序列分析发现,其涉及植物的基础物质、能量代谢、信号转导、转录调控和解毒防御等方面,说明这些基因很可能参与到芝麻的耐湿性反应中。
- 王林海吕再萍张艳欣黎冬华吕海霞张晓燕张秀荣
- 关键词:芝麻CDNA文库
- 芝麻高纯度线粒体DNA提取技术研究被引量:13
- 2011年
- 以2个芝麻品种黄化苗为试验材料,通过比较植物线粒体DNA(mtDNA)提取过程中的关键影响因素DNase处理时间,建立了一种经济、快速、高效的芝麻mtDNA提取方法。该方法分别通过匀浆化处理、2 400 g离心15min结合12 000 g离心12 min的差速离心方法分离获得粗制线粒体,再经过DNase酶切处理1.5 h去除基因组DNA的污染,然后经0.6 mol/L蔗糖衬垫离心获得纯的线粒体,通过SDS-蛋白酶K方法裂解线粒体获得芝麻mtDNA。经过核酸蛋白分析仪分析表明:本技术每1 g芝麻黄化苗能获得1μg以上mtDNA;通过1.0%琼脂糖凝胶电泳检测表明获得mtDNA完整,无明显降解;并利用三类特异引物(核基因特异引物beta-actin、线粒体基因特异引物rrn26S以及叶绿体基因特异引物ARCP5)进行PCR检测表明提取的mtDNA为高纯度。芝麻高纯度mtDNA提取技术的建立,为研究与芝麻线粒体基因有关的性状(如细胞质雄性不育、抗逆性等)奠定了技术基础。
- 黎冬华王林海张艳欣吕海霞张晓燕刘佳张秀荣
- 关键词:芝麻MTDNA
- 芝麻空间诱变后代的变异及其AFLP标记多态性分析被引量:6
- 2011年
- 以"实践8号"搭载的豫芝8号与H98芝麻品种为材料,分析芝麻空间诱变SP2与SP3代植物学性状变异,并进行了分子水平检测。结果显示:(1)2个芝麻品种空间诱变SP2与SPSP3后代植株在叶片、株高、株型、花器、蒴果、育性、初花期等均出现了较丰富的变异,品种间突变类型及突变频率均存在差异,但是仅观察到小果变异(豫芝8号变异后代)与植株高大变异(H98变异后代)2种类型的株系变异SP2突变体在SP3代能稳定遗传;(2)利用30对AFLP引物组合,对2个品种SP2代与SP3代变异来源进行分子检测,发现空间环境能使芝麻基因组多个位点发生变异,变异频率高,并且品种间在分子水平变异频率也存在差异;(3)不同的突变类型发生的突变位点不同,即使是同一突变类型内检测到的位点变异也存在较大差异,说明基因组DNA水平上的变异并不能全部显现出来;(4)2个品种间既在形态上检测到相同的突变类型,又在分子水平检测到相同的变异位点。
- 吕海霞张艳欣王林海危文亮黎冬华张晓燕张秀荣
- 关键词:芝麻AFLP
- 芝麻DNA高效提取及PAGE快速银染方法被引量:11
- 2010年
- 为了快速、低成本获得高质量的芝麻基因组DNA,在借鉴其他作物DNA常规提取方法基础上,简化了提取步骤,减少了试剂用量,DNA经琼脂糖电泳检测无拖尾,且OD260/OD280在1.8~2.0之间,表明质量、纯度均较高,摸索了一套芝麻DNA高效提取方法。在常规变性聚丙烯酰胺凝胶(PAGE)银染程序基础上进行改良,减少了固定环节和试剂用量,缩短了染色和显影时间等,优化建立了芝麻PAGE快速银染方法。
- 吕海霞张艳欣王林海张晓燕张秀荣
- 关键词:芝麻聚丙烯酰胺凝胶
- 湿害胁迫对发芽期芝麻的影响及耐湿性评价方法建立被引量:18
- 2011年
- 为研究湿害胁迫对发芽期芝麻的影响,将7份发芽至露白的芝麻材料分别淹水处理3h、6h、9h、12h、15h和24h,继续培养5d后对电导率、死亡率、成苗率等指标进行测定。结果表明,随着胁迫处理时间的延长,电导率和死亡率不断增加,成苗率、根长和活力指数呈下降趋势,畸形苗率表现先升后降;6~12h时,成苗率和简易活力指数急剧下降,说明淹水6~12h是芝麻发芽期湿害的敏感时间段。31份高代品系经淹水胁迫7h、9h和12h后的发芽特性表明,9h处理时各项指标的变异系数明显大于其它时间处理,因此,淹水9h是评价芝麻发芽期耐湿性的适宜时间,相对成苗率可作为主要评价指标。依此方法对222份芝麻种质发芽期耐湿性遗传差异的评价结果显示,极不耐湿的材料70份;不耐湿的69份;中耐43份;耐湿28份;高耐湿的12份,分别为ZZM1501、ZZM2113、ZZM2147、ZZM2208、ZZM3342、ZZM3379、ZZM3410、ZZM4780、ZZM4781、09-P65、辽品芝3号、漯芝15。
- 王林海张艳欣黎冬华张晓燕吕海霞危文亮孙建张秀荣
- 关键词:芝麻发芽期
- 芝麻成株期茎点枯病原菌致病性研究被引量:1
- 2012年
- 通过对芝麻成株期茎点枯病病原菌的致病性进行研究,从而为芝麻种质资源的抗病性鉴定,发掘抗源,加快抗病育种进程提供技术方法。对感茎点枯病芝麻植株进行病原菌分离纯化及鉴定获得具有高致病力的病原菌株Macrophomina phaseolina,再进行芝麻成株期致病性鉴定,并对感病植株进行病原菌再分离及鉴定。对分离纯化的病原真菌进行表型及分子鉴定,从而确定该病原真菌为M.phaseolina,对该类型病原菌进行芝麻芽期致病力接种鉴定并选取致病力高的菌株用于芝麻成株期致病力接种鉴定。在接种后的成株期芝麻茎杆内,M.phaseolina会导致维管束组织形成一个由上往下逐渐坏死的棕黑色条纹,随后开始呈放射性收缩并坏死并逐渐扩大,所有病原菌接种的茎杆上都出现大量的菌核。对所有接种病原菌的植株感病茎杆进行病原真菌再分离纯化及鉴定,确定再次获得的病原真菌仍为M.phaseolina。芝麻茎点枯病病原菌的分离鉴定、致病性鉴定以及病原菌再分离结果都符合科赫法则,为芝麻茎点枯病相关研究提供方法支持。
- 黎冬华张艳欣王林海吕海霞危文亮齐小琼丁霞张秀荣
- 关键词:芝麻成株期
- 芝麻资源群体结构及含油量关联分析被引量:22
- 2012年
- 【目的】推测芝麻资源群体材料的遗传变异、群体结构和分子亲缘关系,通过关联分析检测群体中影响含油量表型的位点,为芝麻高油育种及开展其它性状关联分析等提供科学依据。【方法】利用20对SSR引物、43对SRAP引物及16对AFLP引物,对来自芝麻核心品的216份芝麻资源进行遗传多样性分析、群体结构分析和含油量性状关联分析。【结果】共检测到338个等位变异,群体遗传多样性为0.2493、多态性信息含量为0.2090。群体结构分析将216份芝麻资源分为2个亚群(POP1和POP2);其中,174份资源(80.56%)归属POP1亚群,42份资源(19.44%)归属POP2亚群。POP1亚群的遗传多样性(0.2180)、多态性信息指数(0.1840)等指标值都低于POP2亚群(分别为0.3190和0.2561),表明POP2亚群内种质遗传变异更为丰富。AMOVA分析表明,亚群内的遗传变异(86.83%)极显著高于亚群间的遗传变异(13.17%)(P<0.001)。关联分析重复检测出2年环境下与含油量性状极显著关联的分子标记8个(P<0.01)。这8个标记的性状变异解释率变幅为0.0343(标记M20E16-8)—0.0587(标记SSR12-2),总的变异解释率为0.2846(2008年)和0.3801(2009年)。【结论】以216份来自中国芝麻核心品的资源构成自然群体,群体结构简单、遗传变异较为丰富,可以用于开展芝麻重要目标性状的关联作图。应用关联分析方法在2个年度环境下重复检出8个标记与含油量性状极显著关联(P<0.01),这些标记可能与含油量性状存在稳定、可靠相关联。
- 危文亮张艳欣吕海霞王林海黎冬华张秀荣
- 关键词:芝麻含油量
- 芝麻耐湿性QTL定位及优异耐湿基因资源挖掘被引量:15
- 2014年
- 【目的】芝麻是对湿害极其敏感的作物,湿害是影响中国芝麻生产发展和单产提高的主要障碍因素,然而,芝麻耐湿性分子生物学研究基础薄弱,迄今,国内外有关芝麻耐湿性基因定位的研究尚未见报道。利用重组自交系(RIL)群体进行芝麻耐湿性QTL定位,结合芝麻核心种质群体进行耐湿性相关分子标记研究,并挖掘优异耐湿基因资源。【方法】以高耐湿芝麻品种中芝13与极敏感种质宜阳白杂交后连续自交6代构建206个株系的RIL群体。利用113对多态性分子标记扫描RIL群体获得基因型数据,用MapMaker/EXP.3.0软件构建遗传连锁图谱。2009年和2010年在武汉和鄂州2地点通过人工淹水胁迫获得RIL群体盛花期湿害后正常株率和存活株率的表型数据,用Microsoft Excel 2010软件进行表型数据方差分析,用QTLNetwork 2.0软件基于复合区间作图法进行QTL定位,利用主效QTL紧密连锁的分子标记扫描核心种质群体,并结合耐湿性表型数据分析得到相关有效分子标记。通过盛花期耐湿性表型重复鉴定筛选,结合分子标记辅助选择,获得优异耐湿基因资源。【结果】构建的遗传连锁图谱全长592.4 cM,共有70个标记位点进入15个连锁群,标记间的平均距离为8.46 cM。共检测到与盛花期耐湿性相关的6个QTL位点,定位在第7、9、13和15连锁群上,分别解释5.67%—17.19%的表型变异,加性效应值2.7190—9.7302,贡献率最大的QTL为qWH10CHL09,加性效应3.9394,其增效等位基因来源于母本中芝13,SSR标记ZM428与其紧密连锁(遗传距离为0.7 cM)。标记ZM428在186份芝麻核心种质中验证结果表明,该标记2种基因型的资源间在耐湿表型上存在显著差异(P=0.0163),因此,标记ZM428可作为芝麻耐湿性分子辅助选择的有效标记。还挖掘出8份优异耐湿基因资源,湿害后其正常株率均>70%,存活株率均>80%。【结论】检测到6个芝麻耐湿性相关QTL,其中,贡献率最大的1
- 张艳欣王林海黎冬华高媛吕海霞张秀荣
- 关键词:芝麻QTL定位
- 基于EST-SSR研究芝麻地方种质不同大小繁殖群体间多态性被引量:6
- 2011年
- 从1份芝麻地方种质的200株总样本中随机抽取20、25、30、35、40、45、50、55个单株组成不同大小的群体,基于15对EST-SSR标记从DNA水平上分析不同群体间多态性特点。结果表明,群体样本大小至少为30~35株时可代表该种质的遗传特性,田间实际采用不小于60~70株作为芝麻地方种质的繁殖更新群体将能较好避免基因漂变,此研究结果将为确定基因库芝麻地方种质资源繁殖更新适宜的样本大小提供理论依据。
- 张艳欣王林海吕海霞张晓燕柯涛董彩华张秀荣
- 关键词:芝麻地方种质繁殖更新EST-SSR