金双
- 作品数：4 被引量：24H指数：3
- 供职机构：西南民族大学更多>>
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- 牦牛抗逆基因的克隆及生物信息学分析研究
- 钟金城柴志欣陈智华字向东陈雪梅金双陈玉红
- 1.任务来源1国家民委重点科研项目："牦牛对高寒草地生态环境适应性的分子机理研究"；2四川省应用基础研究项目:"牦牛抗逆基因的克隆及生物信息学分析研究"；3西南民族大学学科建设项目:"野牦牛线粒体基因组结构及适应性的分子...
- 关键词：
- 关键词：牦牛基因克隆生物信息学饲养管理
- 4个牦牛品种的RAPD遗传多样性研究被引量：14
- 2007年
- 研究采用RAPD分子标记技术对麦洼、九龙、大通和天祝白牦牛等4个牦牛品种共124头牦牛进行了遗传多样性分析。结果表明：①每个RAPD引物扩增的DNA片段数在18～33个，且所有品种均表现多态，标记多态频率平均为38．63％，检测片断大小在0．25～5kb之间；②用Shannon多样性指数公式计算牦牛品种的遗传多样性指数（HO），结果显示九龙、麦洼、大通、天祝白牦牛的遗传多样性指数分别为0．311、0．262、0．252和0．216；③采用Rogers遗传距离公式分析4个牦牛品种问的遗传距离（DR）结果：天祝白牦牛与九龙牦牛遗传距离最大（0．0414），与大通牦牛的距离最小（0．0383）；④根据DR值，将4个牦牛品种聚为两大类，九龙牦牛聚为一类，其它3个牦牛品种聚为一类。大通牦牛和天祝白牦牛在较近的水平上首先聚为一类，然后与麦洼牦牛聚为一大类。
- 肖玉萍钟金城金双
- 关键词：牦牛RAPD分子标记
- 牦牛EPO基因部分片段的克隆测序及其分析被引量：6
- 2007年
- 根据GenBank中牛EPO基因序列设计一对引物,对九龙牦牛、大通牦牛、巴州牦牛及三江黄牛EPO基因部分序列进行PCR扩增、克隆和测序。结果表明,获得的九龙牦牛、大通牦牛及巴州牦牛该基因部分片段大小均为1 444 bp,三江黄牛为1 427 bp;在EPO基因核苷酸水平上,大通牦牛与巴州牦牛、九龙牦牛、三江黄牛的同源性依次为99.9%、99.6%、99.2%,巴州牦牛与九龙牦牛、三江黄牛的同源性依次达99.5%、99.2%,九龙牦牛与三江黄牛同源性为99.4%;在氨基酸水平上,大通牦牛与巴州牦牛、九龙牦牛、三江黄牛同源性依次为100%、99.2%、99.2%,巴州牦牛与九龙牦牛、三江黄牛同源性均为99.2%,九龙牦牛与三江黄牛氨基酸序列同源性高达100%。NJ法构建的物种间系统进化树表明,大通牦牛与巴州牦牛先聚为一类,再与九龙牦牛聚为一类,最后与三江黄牛聚为一类。
- 金双钟金城陈智华马志杰卓娅
- 关键词：牦牛促红细胞生成素克隆测序
- 大额牛Myf-5基因克隆、序列分析及其分子系统进化研究被引量：4
- 2007年
- 对大额牛Myf-5基因进行PCR扩增、T-A克隆和序列分析,并应用DNAMAN4.0、BioEdit 4.8.10、DnaSP4.10、Mega3.1等生物信息学软件同普通牛、黑猩猩、恒河猴、人、狗、家鼠、软体贝壳、鸡、斑马鱼9个物种相应基因编码区核苷酸序列和氨基酸序列进行了比对分析,在此基础上采用NJ、ME和UPGMA法对其编码区核苷酸序列构建了分子系统进化树。结果表明:①大额牛Myf-5基因由3个外显子和2个内含子组成,其大小分别为660、76、1 226、852、407 bp;外显子和内含子数与其他9个物种相同,但大小存在较大的差异;外显子与内含子连接区遵循GT-AG基因组成规则。②大额牛与普通牛、黑猩猩、恒河猴、人、狗、家鼠、软体贝壳、鸡、斑马鱼的Myf-5基因编码区核苷酸序列同源性分别为99.0%、90.0%、90.5%、90.5%、87.2%、84.8%、72.9%、64.3%、51.8%,相应的氨基酸序列同源性分别为99.6%、94.9%、94.6%、94.9%、89.9%、88.7%、81.6%、70.4%、56.6%,这说明大额牛与其他9个物种在Myf-5基因的编码区核苷酸和相应氨基酸序列上具有较高的保守性。③用NJ、ME和UPGMA等3种方法聚类构建的分子系统进化树表明,3种方法的聚类结果基本一致,即大额牛与普通牛首先聚为一类,人、黑猩猩、恒河猴也先聚为一类,这两类相聚后再依次同其他物种聚在一起。这与mtDNA、其他功能基因和动物学分类的研究结果一致,表明Myf-5基因适合用于物种间系统进化关系的研究。
- 陈玉红钟金城马志杰胡汉傈金双罗虹
- 关键词：大额牛克隆分子系统进化
