陈玉红
- 作品数：11 被引量：23H指数：3
- 供职机构：西南民族大学更多>>
- 发文基金：四川省应用基础研究计划项目更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 小型猪与梅山猪Prop1基因的比较分析被引量：1
- 2007年
- Prop1是一种新发现的参与早期胚胎垂体发育的特异性转录因子。在人和动物均已发现由于该基因突变而引起的综合性垂体功能障碍,进而影响生长和繁殖。小型猪与梅山猪比较,其繁殖力和生长性能差异显著,为了了解这些差异的遗传基础,本试验对五指山猪、藏猪和版纳猪3种小型猪的Prop1基因进行克隆测序,并与已知梅山猪的序列进行对比,结果为:五指山猪与藏猪外显子1第69位发生G-A碱基替换,编码同义氨基酸;藏猪外显子2第115位发生A-G碱基替换,编码终止密码子;藏猪与版纳猪外显子3第466位和第631位均发生C-T碱基替换,第466位藏猪编码同义氨基酸;第631位版纳猪编码丝氨酸(TCC),梅山猪编码脯氨酸(CCC),即2种猪的Prop1基因产物不同。在Prop1基因终止密码下游250左右有一个腺苷酸丰富区,五指山猪与藏猪有15个腺苷酸串联,版纳猪有12个。上述结果为进一步研究大猪和小型猪之间生产性能差异的遗传基础提供了新线索。
- 衡文娜郭春华张晓晖张重庆陈玉红
- 关键词：繁殖力梅山猪五指山猪藏猪
- 大额牛HSL基因外显子Ⅰ部分片段的序列测定及分析被引量：7
- 2007年
- 对大额牛HSL基因外显子Ⅰ部分序列进行PCR扩增、测序及氨基酸预测,并同其它牛种的资料进行了比对分析,构建了分子系统进化树。结果表明:大额牛其核苷酸序列与牦牛、普通牛、瘤牛、水牛间的同源性分别为99.6%、99.4%、99.2%、97.0%。相应的氨基酸序列大额牛与水牛的同源性为97.6%;与普通牛、瘤牛、牦牛的同源性均为99.4%,仅在第33位有1个氨基酸变异,即大额牛为异亮氨酸,而其它3个牛种均为缬氨酸,这是由该基因片段的第97位碱基发生转换(A←→G)造成的。从分子系统进化树看,瘤牛和普通牛先聚为一类,再依次与牦牛、大额牛、水牛相聚,这与传统的牛种分类结果一致。
- 常怀普钟金城陈智华胡汉傈马志杰李子良杨蓉生陈玉红张亚美
- 关键词：大额牛
- 牦牛抗逆基因的克隆及生物信息学分析研究
- 钟金城柴志欣陈智华字向东陈雪梅金双陈玉红
- 1.任务来源1国家民委重点科研项目："牦牛对高寒草地生态环境适应性的分子机理研究"；2四川省应用基础研究项目:"牦牛抗逆基因的克隆及生物信息学分析研究"；3西南民族大学学科建设项目:"野牦牛线粒体基因组结构及适应性的分子...
- 关键词：
- 关键词：牦牛基因克隆生物信息学饲养管理
- 荷斯坦奶牛乳中上皮粘蛋白MUC1的多态性研究被引量：2
- 2004年
- 本实验采用十二烷基硫酸钠——聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)研究了50头荷斯坦牛乳的MUC1的生化遗传特性。实验结果表明:荷斯坦牛乳MUC1呈现多态性,呈现出一条或两条迁移率不同的区带,从中共发现5种分子量分别为196kd、190kd、183kd、176kd、156kd的复等位基因的MUC1区带。由此可知,荷斯坦牛乳MUC1基因座受A、B、C、D、E5个复等位基因支配,表现出6种基因型。
- 秦天莺马嵬周静陈玉红郑玉才
- 关键词：中国荷斯坦牛MUC1多态性
- 牦牛核苷酸序列资源的调查
- 2006年
- 目的了解牦牛核苷酸序列的资源状况,为今后的相关选题和研究提供重要参考.方法根据GenBank的序列记录,从登录号、记录名称、序列长度、DNA/mRNA、接受日期、完整/不完整编码区序列、递交机构7个项目进行统计,分析数据量和增长率、数据的递交机构、覆盖的基因和区域、包含完整CDS的记录4个方面的情况.结果从1995年至2005年,共有19个机构递交了相关序列,总碱基数达160321 bp,这些序列覆盖了65种不同基因或区域.
- 余劲聪字向东陈玉红
- 关键词：牦牛核苷酸序列
- 小型猪与梅山猪Prop1基因的比较分析
- 2007年
- Prop1是一种新发现的参与早期胚胎垂体发育的特异性转录因子。在人和动物均已发现由于该基因突变而引起的综合性垂体功能障碍,进而影响生长和繁殖。小型猪与梅山猪比较,其繁殖力和生长性能差异显著,为了了解这些差异的遗传基础,本试验对五指山猪、藏猪和版纳猪三种小型猪的Prop1基因进行克隆测序,并与已知梅山猪的序列进行对比,结果为:五指山猪与藏猪外显子1第69位发生G-A碱基替换,编码同义氨基酸;藏猪外显子2第115位发生A-G碱基替换,编码终止密码子;藏猪与版纳猪外显子3第466位和第631位均发生C-T碱基替换,第466位藏猪编码同义氨基酸;第631位版纳猪编码丝氨酸(TCC),梅山猪编码脯氨酸(CCC),即两种猪的Prop1基因产物不同。在Prop1基因终止密码下游250左右有一个腺苷酸丰富区,五指山猪与藏猪有15个腺苷酸串联,版纳猪有12个。上述结果为进一步研究大猪和小型猪之间生产性能差异的遗传基础提供了新线索。
- 衡文娜郭春华张晓晖张重庆陈玉红
- 关键词：繁殖力梅山猪五指山猪藏猪
- 不同牛种Myf-5基因部分片段的克隆测序分析
- 用PCR方法扩增并测定了三江黄牛、德昌水牛、大额牛和九龙牦牛Myf-5基因的部分序列。结果表明:所测序列包括Myf-5因(5219bp)的全部外显子2序列和内含子1、3的部分序列。通过Blast序列比较分析,三江黄牛、德...
- 陈玉红陈雪梅钟金城陈智华胡汉傈张亚美马志杰常怀普
- 关键词：PCR
- 文献传递
- 藏绵羊生长激素释放激素基因内含子Ⅱ部分序列的分析被引量：2
- 2007年
- 对藏绵羊生长激素释放激素(GHRH)基因内含子Ⅱ部分序列进行了PCR扩增和测序,用Genbank中的Blastn方法与普通牛相应基因序列进行了比对分析。结果表明,藏绵羊与普通牛GHRH基因内含子Ⅱ部分序列间同源性为92%;2个物种该基因内含子Ⅱ部分序列间的碱基变异类型主要表现为碱基转换和颠换,亦存在碱基插入和缺失。
- 马志杰魏雅萍钟金城刘剑磊陈玉红徐惊涛
- 关键词：藏绵羊内含子
- 肉兔微卫星标记与生产性能的相关性研究被引量：6
- 2007年
- 本研究检测了13个卫星标记与兔生产性状(产仔数、初生窝重、21 d、28 d、90 d窝重)间的相关性,研究结果表明,13个微卫星标记中有5个标记与家兔生产性状相关。位点5L1E8及D7Utr5不同基因型除对初生重影响显著外(P>0.05),位点19L1G5除对产仔数影响不显著外(P>0.05),分别对其余四个性状的影响均达到显著水平(P<0.05);而位点D3Utr7对五个生产性状均达到显著影响(P<0.05)。其余8个位点对各性状影响均未达到显著水平(P>0.05)。
- 黄邓萍谢晓红雷岷曹胜兰银永忠张琴钟金城赵胜刘勇涛陈玉红
- 关键词：微卫星DNA
- 大额牛Myf-5基因克隆、序列分析及其分子系统进化研究被引量：4
- 2007年
- 对大额牛Myf-5基因进行PCR扩增、T-A克隆和序列分析,并应用DNAMAN4.0、BioEdit 4.8.10、DnaSP4.10、Mega3.1等生物信息学软件同普通牛、黑猩猩、恒河猴、人、狗、家鼠、软体贝壳、鸡、斑马鱼9个物种相应基因编码区核苷酸序列和氨基酸序列进行了比对分析,在此基础上采用NJ、ME和UPGMA法对其编码区核苷酸序列构建了分子系统进化树。结果表明:①大额牛Myf-5基因由3个外显子和2个内含子组成,其大小分别为660、76、1 226、852、407 bp;外显子和内含子数与其他9个物种相同,但大小存在较大的差异;外显子与内含子连接区遵循GT-AG基因组成规则。②大额牛与普通牛、黑猩猩、恒河猴、人、狗、家鼠、软体贝壳、鸡、斑马鱼的Myf-5基因编码区核苷酸序列同源性分别为99.0%、90.0%、90.5%、90.5%、87.2%、84.8%、72.9%、64.3%、51.8%,相应的氨基酸序列同源性分别为99.6%、94.9%、94.6%、94.9%、89.9%、88.7%、81.6%、70.4%、56.6%,这说明大额牛与其他9个物种在Myf-5基因的编码区核苷酸和相应氨基酸序列上具有较高的保守性。③用NJ、ME和UPGMA等3种方法聚类构建的分子系统进化树表明,3种方法的聚类结果基本一致,即大额牛与普通牛首先聚为一类,人、黑猩猩、恒河猴也先聚为一类,这两类相聚后再依次同其他物种聚在一起。这与mtDNA、其他功能基因和动物学分类的研究结果一致,表明Myf-5基因适合用于物种间系统进化关系的研究。
- 陈玉红钟金城马志杰胡汉傈金双罗虹
- 关键词：大额牛克隆分子系统进化
