贾善刚 作品数:8 被引量:55 H指数:6 供职机构: 西北农林科技大学动物科技学院 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 国家高技术研究发展计划 国家科技支撑计划 更多>> 相关领域: 农业科学 生物学 更多>>
中国部分地方黄牛品种线粒体D-loop区的遗传变异与进化分析(英文) 被引量:13 2007年 测定了13个黄牛品种125个个体的线粒体D-loop区段的全序列,包括12个中国地方黄牛品种的123个个体和德国黄牛2个个体,并进行了分析。结果显示,共检测到93个变异位点,57个单倍型,平均核苷酸差异(average number ofnucleotide differences,k)为22.708,核苷酸多样度(nucleotide diversity,π)为0.0251±0.00479,单倍型多样度(haplotypediversity,Hd)为0.888±0.026,表明我国黄牛品种遗传多样性非常丰富。构建的Neighbor-Joining进化树显示这13个品种主要分成两大类型:普通牛和瘤牛;新发现的特殊类型Ⅲ只有一个西藏阿沛甲咂牛的个体,它与牦牛D-loop序列最相近,证明西藏地区的黄牛与牦牛之间存在基因渗入现象。普通牛和瘤牛在日喀则驼峰牛中占的比例分别是64.3%和35.7%,在阿沛甲咂牛中占的比例分别是50.0%和50.0%,证明了西藏的黄牛也有瘤牛类型。云南牛品种的单倍型非常丰富证明了云南在中国黄牛起源上的重要地位;在27个中国黄牛品种中(本研究11个品种以及GenBank上的16个品种)找到了中国瘤牛的核心单倍型i1,并且对它进行了讨论。同时证明了西藏瘤牛独立于中国瘤牛核心类群的特殊性。 贾善刚 陈宏 张桂香 王志刚 雷初朝 姚茹 韩旭关键词:进化 黄牛 D-LOOP 云南昭通黄牛mtDNA D-loop区遗传变异分析 被引量:8 2007年 为检测云南昭通黄牛的遗传多样性,测定并分析了云南昭通黄牛线粒体D—loop区段全序列。结果显示,D—loop序列四种碱基A、T、C、G的频率分别是:32.9%、28.6%、24.8%和13.6%;共检测到48个变异位点,平均核苷酸差异(k)为22.762,核苷酸多样度(π)为2.504%,存在6个单倍型,单倍型多样度(Hd)为0.952±0.096,显示出极高的遗传多样性。检索了与昭通黄牛地理分布相近的8个黄牛品种的D—loop序列资料,统计分析发现,9个黄牛品种间的遗传距离在0.0000~0.0376之间,昭通与其他黄牛品种的遗传距离最远,提示云南黄牛有着特殊的起源地位。 周艳 陈宏 贾善刚 房兴堂中国部分地方黄牛品种母系起源进化分析 本研究利用PCR和测序技术测定了18个黄牛品种187个个体的线粒体D-loop区段的全序列,包括17个中国地方黄牛品种(5个北方品种,9个南方品种,和3个西藏品种)的185个个体和德国黄牛2个个体,并进行了母系起源进化分... 贾善刚关键词:地方黄牛 母系起源 普通牛 西藏黄牛 全序列 文献传递 14个中外黄牛品种的遗传多样性分析 被引量:7 2007年 利用12对微卫星DNA标记对14个中外牛品种进行了遗传多样性分析,通过计算多态信息含量(PIC)、平均杂合度(H)、有效等位基因数(Ne)及聚类分析,评估各品种内遗传变异和各品种间遗传相关。结果表明,12个微卫星座位共检测到170个等位基因,Ne为1.194 7-11.175 2,H为0.618 9-0.782 9;12个位点均为高度多态位点,PIC为0.528 1-0.810 5。恩施黄牛与郧巴牛相聚,枣北牛与南阳牛相聚,然后二者聚为一类;湘西牛自成一类;郏县红牛与秦巴牛相聚,再与黄陂黄牛聚为一类;早胜牛与平陆山地牛聚为一类;安西牛自成一类;德国黄牛与西门塔尔牛相聚后,再与夏洛来牛聚为一类。 张自富 昝林森 王志刚 张桂香 廖信军 贾善刚 韩旭 于福清 张剑关键词:微卫星 黄牛品种 东亚部分国家黄牛的母系起源研究 黄牛的驯化加速了人类社会的进化,推动了农业社会的进步.本研究利用黄牛线粒体完整的控制区序列来研究其母系遗传起源。实验采集了25个省264份的血液样品,加上NCBI的GenBanl(下栽的序列,形成了一个大数据库,包括来自... 贾善刚 陈宏 周艳 雷初朝 张秀清 姚茹 张智英 房兴堂关键词:母系起源 母系遗传 线粒体 遗传育种 黄牛 文献传递 中国南方部分黄牛品种mtDNA D-loop区的遗传变异与分类分析 被引量:16 2008年 【目的】检测中国黄牛品种的遗传多样性和遗传亲缘关系。【方法】扩增、测序并分析了8个南方黄牛品种(川南牛、务川牛、温岭牛、隆林牛、湘西牛、郧巴牛、昭通牛、锦江牛)共计40个个体的线粒体D-loop区(mtDNAD-loop)全序列。【结果】共检测到56个变异位点,17个单倍型,平均核苷酸差异(K)为20.364,核苷酸多样度(π)为2.25%,单倍型多样度(Hd)为0.750±0.074;4种碱基A、T、C、G的频率分别为33.2%,28.2%,25.1%和13.5%;56处多态位点中,转换49处(占多态位点87.5%),颠换4处(占7.14%),缺失/插入3处(占5.36%);在样本数量超过3的群体中,锦江牛和昭通牛分别显示出最贫乏和最丰富的遗传多样性;构建的NJ进化树表明,云南昭通牛与其他7个品种的亲缘关系最远。【结论】普通牛较瘤牛具有丰富的遗传多样性,支持普通牛的多地区起源说;云南昭通牛含有不同于印度瘤牛的瘤牛血统,从分子水平上支持云南是潜在的瘤牛起源驯化中心。 周艳 陈宏 贾善刚 雷初朝关键词:黄牛 线粒体D-LOOP区 我国部分黄牛品种线粒体D-loop区遗传多样性与起源分化 被引量:18 2009年 为了解我国地方黄牛品种线粒体DNA的遗传变异情况,文章测定了16个地方黄牛品种206个个体线粒体D-loop区的全序列,共检测到101个变异位点;99种单倍型,其中73种是普通牛单倍型,26种是瘤牛单倍型;平均核苷酸差异为22.6920,单倍型多样度为0.9320,核苷酸多样度为0.0227,表明我国黄牛品种遗传多样性非常丰富。构建的NJ进化树显示16个品种来源于两大母系:普通牛和瘤牛;构建的Network图表明73种普通牛单倍型可以分为3大单倍型群;26种瘤牛单倍型分为5种单倍型群,推测我国瘤牛在迁移过程中,至少经历了4次群体扩张事件。通过分析比较地方黄牛品种与内罗门牛共有的H3单倍型,发现其中只有16%的序列与内罗门牛的H3单倍型非常相似,其余84%的序列均发生了鸟嘌呤变异,推测这些变异很可能是我国瘤牛固有的变异。 张桂香 郑友民 王志刚 韩旭 贾善刚 陈宏关键词:黄牛 D-LOOP区 分化 ob基因及其表达产物的生物学效应 被引量:1 2005年 ob基因自从被克隆后,围绕其表达产物的作用机理和生物学效应进行了大量的研究,最近研究证明Leptin对小鼠大脑发育有重要功能,标志着Leptin的研究进入了一个新的阶段,今后将从单一的营养调控研究转向兼顾神经生物学的研究,更深入研究Leptin作用机理。同时国内外学者从分子领域探究ob基因在畜禽育种上的作用,做了很多的工作,也取得了重要的成果。本文总结了ob基因的重要生物学效应,为理解ob基因的作用机制和进一步研究人类肥胖治疗和提高动物生长繁殖性状水平提供必要的支持。 贾善刚 张丽 赵高峰 陈宏关键词:生物学效应 OB基因 肥胖 动物生长 畜禽育种 繁殖性状