葛辰
- 作品数:6 被引量:7H指数:1
- 供职机构:苏州大学更多>>
- 发文基金:江苏省水产三项工程项目江苏省农业科技自主创新基金江苏省科技支撑计划项目更多>>
- 相关领域:农业科学生物学文化科学更多>>
- 中国4大湖泊大鳞副泥鳅群体遗传多样性分析被引量:6
- 2014年
- 为保护大鳞副泥鳅种质资源,制定合理的野生资源保护策略,并为大鳞副泥鳅良种选育确定合适的育种基础群体,通过第二代测序技术自主开发并合成微卫星引物400对,经验证后随机采用其中的17个多态性微卫星标记对太湖、洪泽湖、洞庭湖和巢湖等4大湖泊的野生大鳞副泥鳅群体进行遗传多样性分析。检测到各基因座的平均观测等位基因和有效等位基因数分别为9.5和5.5个。平均期望杂合度为0.5665,平均Fst值为0.2194(〉0.2),Nm为0.8894(〈1),表明4个大鳞副泥鳅群体间遗传交流较少,存在着较高程度的遗传分化。4个大鳞副泥鳅群体的等位基因数为5.4~6.2(平均5.8),观测杂合度0.2732~0.3864,期望杂合度0.5629~0.5893,多态信息含量(PIC)为0.5503~0.5754,表明4个群体具有丰富的遗传多样性。4个大鳞副泥鳅群体间的遗传距离为0.5283~0.9677,洪泽湖和太湖群体间的遗传距离最小(0.5283),而太湖和巢湖群体间遗传距离最大,亲缘关系相对较远。基于遗传距离的聚类结果显示4个群体先聚为2个分支,其中太湖和洪泽湖群体聚为一支,洞庭湖和巢湖群体聚为另一支,这与4个大鳞副泥鳅野生群体的地理分布一致。中国4大湖泊大鳞副泥鳅自然群体具有丰富的遗传多样性,每个群体宜作为独立的保护单元进行保护。4个大鳞副泥鳅群体中太湖群体和洪泽湖群体的遗传多样性最高,可作为进一步遗传选育的基础群体。
- 李彩娟凌去非葛辰朱鹏飞王国成叶竹青韩晓飞
- 关键词:大鳞副泥鳅微卫星分子标记
- 大鳞副泥鳅转录组分析、SNP开发及生长相关分子标记的筛选
- 本研究采用2011年构建的大鳞副泥鳅混合群体,进行二代测序,获得SNP标记信息,通过PCR-SSCP验证,筛选得到可用的SNP标记;利用筛选的SNP标记对2013年构建的3个大鳞副泥鳅家系进行遗传结构分析,并进行了SNP...
- 葛辰
- 关键词:大鳞副泥鳅分子标记基因表达
- 文献传递
- 大鳞副泥鳅转录组第二代测序分析与微卫星分子标记的开发
- 为开发大鳞副泥鳅微卫星分子标记,通过Illumina高通量测序对大鳞副泥鳅进行转录组测序,获得105M reads,组装后得到71887条非冗余转录组序列,平均长度1464.58 bp。基因注释发现与Nr和Sting数据...
- 李彩娟凌去非葛辰叶竹青韩晓飞
- 关键词:大鳞副泥鳅转录组测序微卫星分子标记
- 文献传递
- 日粮中不同硒水平对大鳞副泥鳅肌肉品质的影响
- 2013年
- 将大鳞副泥鳅幼鱼随机分为5组,分别用含硒量为0.0(0.31)、0.1(0.39)、0.2(0.48)、0.4(0.50)和0.6(0.62)mg/kg的饲料投喂60 d,每组3个重复。试验结束后测定各组大鳞副泥鳅肌肉中的一般营养成分、矿物元素含量、氨基酸含量,并对其进行营养品质评价。结果表明:投喂不同硒含量的饲料对大鳞副泥鳅肌肉的水分、粗脂肪、粗蛋白没有显著影响(P>0.05),但在0.2(0.48)mg/kg饲料组其粗蛋白含量达到最大值,水分达最小值;灰分在0.1(0.39)、0.2(0.48)和0.4(0.50)mg/kg组显著或极显著低于对照组(P<0.05或P<0.01);Fe、Zn、Mn、Se、K、Na元素在0.2(0.48)mg/kg饲料组均显著或极显著高于对照组(P<0.05或P<0.01);TAA、EAA、EAAI和DAA与对照组相比均无显著性差异,但在0.1(0.39)mg/kg饲料组均达到最大值。
- 郝小凤凌去非李彩娟葛辰
- 关键词:大鳞副泥鳅硒营养评价
- 浅析地方高校科研管理
- 2017年
- 科研管理作为地方高校科研水平不断提高的重要推动力量,保证了科研工作的稳定高效进行。科研管理作为地方高校行政管理的组成部分,受到传统管理模式的影响,落后的服务理念制约着地方高校的科研发展。随着国家进一步加强对科研的重视,加大对科研的投入,地方高校科研水平的提升也势在必行,这就要求科研管理紧跟时代步伐,为科研队伍、科研成果、科研成果转化等提供更先进的服务,从而为地方高校的科研建设奠定扎实的基础。
- 葛辰
- 关键词:地方高校科研管理
- 基于第二代测序的大鳞副泥鳅生长相关SNP标记的开发
- 2014年
- 大鳞副泥鳅是鳅科重要经济鱼类,通过Illumina HiSeq 2000测序平台对2个大鳞副泥鳅样本的转录本进行了高通量测序,其中AB2011M-1是群体中生长较快的10尾鱼的混合转录本,AB2011M-2是生长较慢的10尾鱼的混合转录本。通过对以上2个混合转录本的测序,分别获得了65 536和80 786个单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNP)突变;对2个测序样本进行表达差异的比较,获得了39个表达差异基因。随机选取120个位点设计引物,进行验证分析,共获得16个有效的多态性标记。
- 葛辰凌去非李彩娟叶竹青韩晓飞王国成朱鹏飞
- 关键词:大鳞副泥鳅高通量测序引物设计