肖雪
- 作品数：7 被引量：6H指数：2
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- 富集分析研究microRNA与癌症的关联
- microRNAs(miRNA)是一类内源性的非编码小RNA，它通过降解或抑制某些靶基因转录后所得到的mRNA来实现其在转录后水平的调控。研究表明miRNA的调控对维持生物体正常的工作起到了重要作用，并与生物体很多疾病的...
- 肖雪
- 关键词：癌症MICRORNA
- 离子通道亚型与其基因共表达的关联研究
- 2008年
- 离子通道亚型与其基因共表达的关联对研究离子通道功能有重要意义。文章采用主成分分析和模糊C-均值聚类算法对数据进行分析,将方法应用到人类和小鼠两套表达谱数据,结果发现离子通道亚型中钾离子通道、钙离子通道、氯离子通道和受体激活型离子通道的表达谱聚类结果与生物学分类有较好的一致性,体现了离子通道亚型在mRNA水平上的共表达,并证实了通过离子通道表达谱能很好的对离子通道的功能亚型进行分类。
- 杨德武李霞肖雪杨月莹王靖
- 关键词：离子通道基因表达谱共表达
- 人类蛋白质互作网络hub蛋白与其结构域关联分析被引量：1
- 2008年
- hub蛋白质作为参与较多互作的"中心蛋白",在实现蛋白质功能和生命活动中发挥着关键作用.而结构域作为蛋白质上的基本功能区域,决定着蛋白质功能及蛋白质互作的情况.互作网络中hub蛋白质和结构域对于蛋白质功能的实现均起到决定性的作用.对蛋白质互作与结构域的关系分析表明,蛋白质互作与结构域之间存在着密切的联系.对人类蛋白质互作网络中的hub蛋白与结构域进行关联分析,探讨hub蛋白及其互作partner与结构域数目之间的关系,并通过hub蛋白质之间的互作对相应结构域的关系进行进一步的论证.
- 王靖李霞朱明珠肖雪
- 关键词：蛋白质互作网络连通度结构域
- microRNA层面上癌症的公共机制被引量：3
- 2009年
- microRNAs(miRNA)是一类内源性的非编码小RNA。已有研究表明miRNAs的靶基因中有不少癌症的相关基因。为了全面研究miRNA与癌症的关系,作者将19种癌症的相关基因集合分别富集到494个miRNAs靶基因集合上,得到各类癌症所富集的miRNAs。结果发现19种癌症仅集中地富集在144个miRNAs上,由此验证了癌症在miRNAs上的公共机制。在此基础上,作者对癌症富集较多的8个miRNAs做了进一步研究,结果发现这8个miRNAs均为高度保守的miRNAs,且它们的靶基因集合一致富集在基因本体论(gene ontology,GO)的基本生物学过程上,并与转录因子活性以及蛋白激酶活性相关。另一方面,在基于miRNA构建的癌症网络中,前列腺癌与乳腺癌,结肠癌与乳腺癌之间共享较多的miRNAs,表明了这些癌症在miRNA层面上存在密切的关系。
- 肖雪李霞张绍军
- 关键词：MICRORNA癌症
- 离子通道基因表达谱及其亚型一致性的研究
- 本文从离子通道表达谱数据出发,采用了除噪、标准化、主成分分析等方法对此套数据进行分析,再用模糊C-均值算法对预处理后的数据进行分类,研究此分类与其生物学亚型之间的一致性。结果进一步证实了可以通过基因表达谱的分析实现对离子...
- 杨德武李霞朱明珠王靖肖雪
- 关键词：离子通道基因表达谱一致性
- 文献传递
- 癌症关联的microRNA以及癌症中microRNA网络特性研究
- MicroRNAs(miRNA)是一类内源性的非编码小RNA,它通过降解或抑制某些靶基因转录后所得到的mRNA来实现其在转录后水平的调控。研究表明miRNA的调控对维持生物体正常的工作起到了重要作用,并且与生物体很多疾病...
- 肖雪
- 关键词：癌症网络特性
