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焦岳宏

作品数:2 被引量:6H指数:1
供职机构:广西大学生命科学与技术学院更多>>
发文基金:引进国际先进农业科技计划广西壮族自治区科技攻关计划教育部科学技术研究重点项目更多>>
相关领域:农业科学生物学更多>>

文献类型

  • 2篇中文期刊文章

领域

  • 1篇生物学
  • 1篇农业科学

主题

  • 1篇序列标签
  • 1篇盐碱
  • 1篇玉米
  • 1篇胁迫
  • 1篇基因
  • 1篇基因序列
  • 1篇干旱
  • 1篇EST序列
  • 1篇表达序列标签

机构

  • 2篇广西大学

作者

  • 2篇焦岳宏
  • 2篇李有志
  • 2篇陆海峰
  • 2篇张洁
  • 1篇周洁
  • 1篇赖洪敏
  • 1篇任振胜

传媒

  • 2篇广西农业生物...

年份

  • 1篇2006
  • 1篇2004
2 条 记 录,以下是 1-2
排序方式:
玉米混合组织的EST文库的构建和部分EST序列的分析被引量:6
2004年
以CLONTEECH的pDNR-LIB质粒为载体,构建了干旱和盐碱共胁迫48h和相应的无胁迫正常生长条件下耐旱玉米(ZeamaysL.)YQ7-96品系的雌雄分化期(12片叶龄)的混合组织(叶、茎和花器)EST文库。该文库容量>2×105个克隆,覆盖了预计的玉米基因组5万个基因的4倍以上。随机对3168个克隆中插入的cDNA进行测序,获得有效序列2098条,其中,2002个克隆中的cDNA进行了5'端测序,96个克隆中的cDNA的进行了5'和3'两端测序。结果表明,3'端测序的96个克隆的cDNA都含有polyA尾巴;进一步对这2098条组装分析,形成168个重叠群(Contig)和1693个单拷贝EST(Singlet),代表了共计1861条独立基因(Unigene);根据GenBank中的玉米EST数据库和BLASTn分析软件进行核苷酸同源性分析,1731条(93.01%)EST的score值大于或等于100,130条(6.99%)的EST的score值小于100,说明这130条属于新的表达基因的序列,有21条可以定位在玉米的不同染色体上;BLASTx分析表明,2098条EST中,1007条(48%)有功能注释信息,1091条(52%)无功能注释信息。该文库中的EST将会对公共数据库中现存的玉米EST数据起到补充作用。
张洁焦岳宏陆海峰李有志
关键词:玉米干旱盐碱表达序列标签
一个基因序列及其注释数据库的管理系统
2006年
以微软公司的数据处理软件M icrosoft Exce l 2003为平台,利用其VBA语言,编写了能够从大量的基因及其注释结果中自动大规模地提取并处理关键信息项的宏程序系统——基因序列及其功能注释数据管理系统M DSA(m anagem en t system for database of sequences and functiona l annotation of genes)。由于具有多种文件输出格式,M DSA可与许多数据处理的操作系统兼容,如M icroG ridTA S(B ioR obotics L td,UK)微阵列制作仪中的基因信息上传软件系统。该管理系统是M icrosoft Exce l软件在专业数据库管理中二次开发的成功尝试,在前期的玉米EST和cDNA数据库管理工作中发挥了重要作用。
焦岳宏陆海峰任振胜赖洪敏周洁张洁李有志
关键词:基因
共1页<1>
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