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樊欢: 作品数：28 被引量：107H指数：5; 供职机构：江苏省疾病预防控制中心更多>>; 发文基金：国家自然科学基金江苏省自然科学基金国家科技重大专项更多>>; 相关领域：医药卫生农业科学轻工技术与工程更多>>

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利用CRISPR/Cas9基因编辑技术抑制EV71复制被引量：3: 2016年; 目的：利用CRISPR/Cas9基因编辑技术对肠道病毒71型（EV71）的特定基因进行编辑，评价其抑制EV71复制的效应。方法针对EV71的VP4区设计CRISPR/Cas9表达质粒pCas-Guide-GFP-G1及含PAM序列的DNA片段并转染Vero细胞株。采用噻唑蓝（ MTT）法测定细胞毒性，转染后接种病毒观察细胞病变作用（ CPE），荧光定量RT-PCR法检测EV71含量，免疫共沉淀结合荧光定量RT-PCR法测定 Cas9-gRNA 在细胞内与 EV71 RNA 特异性结合的能力。结果成功构建pCas-Guide-GFP-G1表达质粒；转染细胞后未见明显细胞毒性效应；细胞转染后接种病毒发现pCas-Guide-GFP-G1＋PAM1组细胞病变明显少于其他对照组；培养上清中 EV71含量较对照组降低了40.4%（P=0.056），细胞中 EV71含量较对照组降低了52.8%（P=0.014）；pCas-Guide-GFP-G1＋PAM1组在细胞内与 EV71 RNA 特异性结合能力最高。结论针对 EV71的 VP4基因设计的CRISPR/Cas9表达质粒在特定PAM存在下能通过对EV71基因组的剪切实现抑制EV71病毒复制的作用，可以为EV71治疗提供新的途径。; 吴涛朱小娟樊欢葛以跃陈银郭喜玲赵康辰史智扬朱凤才崔仑标; 关键词：肠道病毒71型病毒复制

一种呼吸道病原体检测试剂盒: 本发明公开了一种呼吸道病原体检测试剂盒，该试剂盒是基于多重PCR结合核酸侵入反应及纳米金显色原理使用的，包含了6种引物探针组合中的1种或几种，可用于同时检测甲型流感/禽流感病毒（FluA）、乙型流感病毒(FluB)、SA...; 樊欢戚宇华朱政崔仑标葛以跃史智扬吴涛; 文献传递

江苏省3个城市2012—2015年手足口病聚集性与暴发疫情监测分析被引量：27: 2016年; 目的分析江苏省无锡、常州、连云港3个城市2012-2015年手足口病聚集性和暴发疫情的流行病学特征及其影响因素，为全省手足口病的防控提供科学依据。方法依据《手足口病聚集性和暴发疫情处置工作规范（2012版）》，主动收集3个城市2012-2015年手足口病聚集性和暴发疫情资料，实验室确认试验采用荧光定量RT-PCR 方法，分析描述疫情的时间、地区、场所分布及其规模，采用logistic回归模型分析疫情罹患率和持续时间的影响因素。结果 2012-2015年3个城市共报告手足口病疫情1 425起（其中聚集性疫情1 314起，暴发疫情111起）。发病时间主要集中在每年3-6月和9-12月，分别占58.18%（829/1 425）和33.68%（480/1 425）；无锡市报告的疫情较多，占59.30%（845/1 425）；疫情场所主要在托幼机构，占68.63%（978/1 425）。931起聚集性和暴发疫情经实验室确认试验显示，2012年、2014年以肠道病毒71型（EV71）和柯萨奇病毒A组16型（Cox A16）两种病毒株主导流行，2013年、2015年分别以单一病毒株EV71和Cox A16为优势毒株。多因素logistic回归分析结果显示，疫情的罹患率与周围环境卫生状况有关，卫生状况越好，罹患率越小（中 vs. 差：OR=0.150，95%CI：0.034～0.667；好 vs. 差：OR=0.072，95%CI：0.016～0.317）；疫情持续时间与报告的及时性有关，报告时间越晚，疫情的持续时间越长（4～7 d vs. 1～3 d：OR=3.452，95%CI：2.293～5.198；8 d vs. 1～3 d：OR=12.108，95%CI：7.767～18.763）。结论江苏省3个城市手足口病聚集性和暴发疫情的时间特征呈现双峰分布，病毒型别存在年份差异，托幼机构是疫情主要场所，疫情报告的及时性对控制疫情起关键作用。; 樊欢符院生单军施超张雪峰霍翔鲍昌俊嵇红; 关键词：手足口病疫情聚集性

一种脑炎相关的病毒检测试剂盒及其应用: 本发明公开了一种脑炎相关的病毒检测试剂盒及其应用，该试剂盒是基于多重PCR结合核酸侵入反应及纳米金显色原理使用的，包含了5种引物探针组合，可用于同时检测东方马脑炎病毒、西方马脑炎病毒、流行性乙型脑炎病毒、西尼罗病毒和尼帕...; 戚宇华樊欢朱政葛以跃崔仑标周明浩; 文献传递

一种呼吸道病原体检测试剂盒: 本发明公开了一种呼吸道病原体检测试剂盒，该试剂盒是基于多重PCR结合核酸侵入反应及纳米金显色原理使用的，包含了6种引物探针组合中的1种或几种，可用于同时检测甲型流感/禽流感病毒（FluA）、乙型流感病毒(FluB)、SA...; 樊欢戚宇华朱政崔仑标葛以跃史智扬吴涛; 文献传递

高通量测序H7N9禽流感病毒基因组模板制备方法的优化及应用被引量：4: 2013年; 目的:建立一种较优的高通量测序H7N9禽流感病毒基因组模板制备方法,用于H7N9禽流感病毒基因组监测。方法:分别以6碱基随机引物反转录生成单链cDNA,合成双链cDNA;流感病毒通用反转录引物U12反转录生成单链cDNA,6碱基随机引物合成双链cDNA;U12引物反转录生成单链cDNA,通用流感病毒全基因扩增引物混合物生成双链cDNA制备高通量测序模板、构建测序文库、测序并分析数据,比较3种方法对高通量测序效率的影响,并与传统Sanger测序方法比较其测序的准确性,选择其中较优的方法用于高通量测序。结果:以U12引物反转录cDNA,通用流感病毒全基因扩增引物混合物生成双链cDNA制备的高通量测序模板,在测序族生成数、覆盖率、单核苷酸多态性及读长等方面均优于另外两种方法。结论:本研究建立的H7N9禽流感病毒基因组模板制备方法用于高通量测序具有准确性高,周期短,成本相对较低,可同时检测多个样本等特点,可用于大规模H7N9禽流感病毒基因组监测。; 赵康辰郭喜玲祁贤葛以跃朱政陈银樊欢朱叶飞史智扬汪华崔仑标周明浩; 关键词：禽流感病毒高通量测序

多重PCR结合核酸侵入反应及纳米金显色技术检测呼吸道病原体被引量：2: 2016年; 目的建立一种呼吸道病原体多重PCR结合核酸侵入反应及纳米金显色的检测方法.方法针对几种重要的呼吸道病原体（甲型流感病毒、乙型流感病毒、SARS冠状病毒、嗜肺军团菌、脑膜炎奈瑟菌以及腺病毒）保守区基因设计引物,进行多重PCR反应、核酸侵入反应及纳米金显色反应,对多种呼吸道病原体同时进行检测,以人偏肺病毒、呼吸道合胞病毒、人鼻病毒、肺炎链球菌4种呼吸道病原核酸评价其检测特异性,以体外转录的病毒RNA或扩增的PCR片段评价其检测敏感性.结果成功建立了一种呼吸道病原体多重PCR结合核酸侵入反应及纳米金显色的检测技术.建立的检测方法可特异的检测目的病原体,且与人偏肺病毒、呼吸道合胞病毒、人鼻病毒、肺炎链球菌无交叉反应.该方法对不同靶标的检测灵敏度介0.5 ～50拷贝/μL.结论建立的呼吸道病原体多重PCR结合核酸侵入反应及纳米金显色技术的检测方法,具有较高的检测特异性及灵敏度,检测通量高,肉眼即可观察结果,在传染病病原体检测方面具有广阔的应用前景.; 樊欢戚宇华朱政葛以跃崔仑标吴涛史智扬; 关键词：呼吸道病原体多重PCR

2009—2018年江苏省EV71分子流行病学及其基因特征分析被引量：9: 2019年; 目的阐明2009—2018年江苏省肠道病毒71型(EV71)的流行病学、基因变异及遗传进化特征。方法对2009—2018年江苏省EV71发病资料和病原学检测情况进行统计分析。选取80株EV71病毒分离株进行VP1区全长基因序列测定,并对核苷酸及氨基酸序列与疫苗株进行差异性比较并构建系统进化树。结果2009—2018年江苏省共报告手足口肠道病毒阳性病例41 858例,EV71为主要病原,占36.52%,重症病例中,以EV71为主,但EV71所占病原构成比逐渐下降。EV71在每年的4—6月出现流行高峰,主要感染6个月~5岁年龄段儿童,男性比例高于女性,地区分布上,江苏省EV71流行呈现一定的地区聚集性,高发地区主要集中在南京、苏州、无锡、连云港。江苏省地区流行的EV71毒株属于C4a亚型;80株EV71分离株的VP1基因核苷酸序列与3株EV71疫苗株(H07、FY23、FY7VP5)差异性分别为0.6 %~5.5%、0.8 %~5.7%和1.9 %~6.9%;EV71分离株的VP1基因氨基酸序列与H07、FY23、FY7VP5差异性分别为0~1.4%、0.3%~2.0%和0.3%~2.0%;80株EV71分离株免疫表位中的氨基酸除个别位点发生突变,并未呈现年度和地区规律性的氨基酸突变。结论2009—2018年,江苏省地区流行的EV71具有明显的时间、人群和地理分布特征。80株EV71分离株属于C4a亚型,EV71分离株与疫苗株核苷酸序列变异较大,但氨基酸同源性较高,推断存在一定的同义突变,不存在抗原漂移的风险,为EV71疫苗在江苏省的应用提供了参考。; 樊欢嵇红霍翔胡建利祁贤鲍倡俊; 关键词：手足口病 EV71 流行病学

一种微生物实验室用消毒衣柜: 本实用新型公开了一种病原微生物实验室工作服消毒衣柜的设计，包括：衣柜体、衣柜门，所述衣柜腔在衣柜门关闭时为完全密闭状态，衣柜腔内设置有空气循环风扇、臭氧发生器、臭氧探测器、紫外线消毒灯、红外加热装置和温度监测仪；衣柜腔底...; 樊欢嵇红李志峰鲍倡俊朱凤才霍翔

2010-2022年江苏省手足口病暴发疫情流行病学特征及其影响因素分析: 2024年; 目的了解江苏省2010-2022年手足口病(HFMD)暴发疫情流行病学特征及其影响因素,为当地HFMD的预防控制提供参考依据。方法收集中国疾病预防控制中心突发公共卫生事件信息管理系统中江苏省2010年1月1日-2022年12月31日上报的238起HFMD暴发疫情的相关数据,对江苏省HFMD暴发疫情的流行病学特征进行统计学描述,应用ArcGIS 10.7和GeoDa1.18软件分析其空间分布特征,并采用多因素非条件logistic回归模型分析HFMD暴发疫情罹患率和持续时间的主要影响因素。结果江苏省2010-2022年上报的238起HFMD暴发疫情累计暴露人数167 934人,累计发病数5 296例,暴发疫情罹患率中位数为3.43%;HFMD暴发疫情在春季(3-5月)和秋季(9-11月)高发,分别占36.97%和29.83%;有68.07%的HFMD暴发疫情由苏南地区报告,暴发疫情发生的主要场所为托幼机构或学校,占99.16%;HFMD暴发疫情发现时间和持续时间分别为0~44 d和3~78 d,发现时间和持续时间中位数分别为8 d和15.5 d;HFMD暴发疫情流行优势毒株在2010、2012、2014、2015、2018、2019和2021年均以柯萨奇病毒A16型(Cox A16)为主,2011、2013和2017年均以肠道病毒71型(EV71)为主,2020年以柯萨奇病毒A6型(Cox A6)为主,2016年以Cox A16和EV71为主,2022年以Cox A16和Cox A6为主;HFMD暴发疫情在空间上呈现聚集性分布,暴发疫情罹患率的高-高聚集区主要位于无锡市惠山区、滨湖区、梁溪区、江阴市,常州市武进区、溧阳市和连云港市赣榆区、海州区、连云区;多因素非条件logistic回归分析结果显示,Cox A16感染和混合感染、疫情持续时间≥21 d、报告来源为其他机构的江苏省HFMD暴发疫情罹患率较高,暴发场所为其他机构的江苏省HFMD暴发疫情罹患率较低,事件级别为一般、场所地为县镇、疫情发现时间≥15 d的江苏省HFMD暴发疫情持续时间较长。结论江苏省2010-2022年HFMD暴发疫情主要发生在春、秋两季,Cox A16为主�; 李明阳程晓庆魏叶樊欢张雪峰鲍倡俊尚庆香嵇红; 关键词：暴发疫情流行病学特征空间分布特征

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