鲍倡俊
- 作品数:136 被引量:982H指数:17
- 供职机构:江苏省疾病预防控制中心更多>>
- 发文基金:国家科技重大专项江苏省医学重点学科基金国家自然科学基金更多>>
- 相关领域:医药卫生农业科学文化科学轻工技术与工程更多>>
- 基于一体化系统的呼吸道合胞病毒分型即时检验检测技术的建立及应用
- 2024年
- 目的研发一款一体化呼吸道合胞病毒(RSV)分型即时检验(point-of-care testing,POCT)检测试剂并评估其性能。方法以RSV A和B亚型及ON1和BA9基因型的基因组保守序列设计特异性的引物和探针,优化PCR反应体系和条件,整合试剂玻璃化技术和多重检测平台,开发RSV分型POCT检测试剂,并对该产品的敏感度、特异度、重复性和临床性能进行评估。结果一体化RSV分型POCT检测试剂敏感度可达500拷贝/ml,特异度好,与临床上表现相似的病原体无交叉反应,试剂批间和批内重复性Ct值的变异系数均<5%,具有较好的重复性,检测试剂应用于53例临床样本测试,检测结果与对比试剂具有较高的一致性和符合率,阳性符合率高达98.11%。结论本研究开发的一体化RSV分型POCT检测试剂集成了"核酸提取-纯化-检测",实现了"样本进,结果出",操作简单,检测结果准确、可靠、稳定,可用于RSV A和B亚型的分型即时检验,为RSV的防控和诊疗提供助力。
- 邓斐朱立国许可祁贤余慧燕王慎骄鲍倡俊
- 关键词:呼吸道合胞病毒一体化
- 乙肝病毒表面抗原阳性孕妇产前病毒感染状态分析被引量:3
- 2012年
- 目的了解乙肝病毒表面抗原(HBsAg)阳性孕妇中乙肝病毒(HBV)感染相关指标分布特征,以评价HBV母婴阻断失败高危因素的分布强度及影响因素。方法采用现况调查方法,对2009年8月-2010年12月期间入选的895名HBsAg阳性孕妇进行人口学信息、与HBV感染相关的信息调查,采集血液样品检测HBsAg、HBeAg、抗-HBe及HBV DNA滴度等指标,并对结果进行统计分析。结果 HBsAg阳性孕妇产前HBeAg阳性率为33.4%,HBV DNA载量>107IU/ml者占25.2%,HBsAg滴度≥10 000IU/mL者占29.61%;HBeAg阳性者中,HBsAg滴度与HBV DNA载量间存在密切正相关关系(r=0.53,P<0.01);随孕妇年龄的增加,孕妇产前HBeAg阳性率和HBV DNA载量均有明显降低趋势。结论 HB-sAg阳性孕妇中存在母婴阻断失败高危险因素的比例较高。适当推迟怀孕年龄,可降低HBsAg阳性人群HBV母婴阻断失败的风险。
- 翟祥军刘耀珍刘红建刘黎静张秋民纪学中周余春曹名权孙翔朱叶飞朱立国卞倩彭红许卫国鲍倡俊羊海涛李杰朱凤才庄辉
- 关键词:孕妇母婴阻断阳性率
- 基于深度学习的猩红热流行趋势预测模型研究被引量:7
- 2022年
- 目的:探究季节性差分自回归滑动平均(seasonal autoregressive integrated moving average,SARIMA)模型和长短时记忆神经网络(long-short term memory neural network,LSTM)模型在江苏省猩红热发病趋势预测中的应用,为疫情防控工作提供理论依据。方法:以江苏省2005—2017年猩红热的逐月发病数据与气象数据作为训练数据,拟合SARIMA模型和LSTM模型,以江苏省2018—2019猩红热的逐月发病数据与气象数据作为测试集,检验模型的预测精度。结果:江苏省猩红热流行具有明显的季节性特征,每年4—6月和11月—次年1月为高发时间段。最优SARIMA模型为SARIMA(3,1,2)(1,1,1)_(12),最优LSTM的结构为以过去3个月的发病数据结合气象公因子作为模型输入,当前周期发病数为对应的期望输出,建立4层LSTM,每层包含32个长短时记忆神经元,以及1层全连接层。两种模型测试集的平均绝对误差百分比分别为35.97%、16.94%;均方根误差分别为227.85、152.46。提示LSTM神经网络的拟合效果和前瞻性预测精度优于SARIMA模型。结论:LSTM模型对江苏省猩红热发病趋势拟合和预测效果较好,可以用于流行趋势研判和风险评估,为优化和调整猩红热监测、防控策略和措施提供依据。
- 赵子平许可许可吴莹时影影沈文琪彭志行刘文东鲍倡俊
- 关键词:SARIMA模型猩红热
- 新冠病毒感染出院(舱)后复阳人员流行病学特征分析
- 2023年
- 目的描述并探索复阳人员特征及规律,为复阳人员的科学管理提供参考建议。方法采用回顾性分析方法,选取2022年3月至6月由苏州市第五人民医院和苏州金阊方舱医院诊断的新冠肺炎住院患者中出院(舱)后复阳的88例患者进行流行病学特征分析,包括一般资料、疫苗注射情况、首阳住院天数、出院后首次复阳间隔天数、复阳次数、核酸阳性Ct值。结果88例复阳人员均为无症状感染者,其中男性35例(39.8%),女性53例(60.2%),年龄范围在3~76岁之间,32人出现过1次复阳(36.36%)、28人出现过2次复阳(31.82%)、13人出现过3次复阳(14.77%);首次阳性时核酸检测Ct值较首次复阳时数值减小且差异具有统计学差异(P<0.01);新冠患者出院后至首次复阳时间间隔最长为28 d,复阳持续时间最长为3个月,患者出院后三个月内发生复阳频次平均为2次。结论复阳人员首次复阳核酸检测Ct值高于首次确诊阳性Ct值。未发现年龄、基础疾病、新冠疫苗接种剂次差异与复阳次数的相关性;未发现复阳人员具有传染性。
- 史晟玮尚庆香何家琪陈立凌崔鹏伟鲍倡俊蔡永彬
- 关键词:流行病学特征
- 2017-2021年江苏省临床分离耶尔森菌分子特征分析
- 2023年
- 目的:了解江苏省腹泻患者临床分离耶尔森菌的分布特点及分子特征。方法:2017-2021年,在小肠结肠炎耶尔森菌国家级主动监测点江苏省徐州市铜山区和盐城市东台市,采集腹泻患者粪便标本,进行耶尔森菌菌株分离;同时,收集全省哨点医院疑似耶尔森菌菌株。提取分离菌株DNA进行全基因组重测序,并上传至EnteroBase数据库进行耶尔森菌种型鉴定,原始数据经清洁和处理后进行16S核糖体RNA(16S rRNA)基因多态性分析;通过美国国家生物技术信息中心(NCBI)和病原菌毒力因子数据库(VFDB)扫描5种毒力基因(ail、ystA、ystB、yadA、virF)携带情况,同时构建K-mer树并进行基因组特征分析。结果:2017-2021年,共采集腹泻患者粪便标本2 058份,经分离鉴定,得到57株耶尔森菌;同时,通过哨点医院收集到2株耶尔森菌。经EnteroBase数据库比对,51株菌为小肠结肠炎耶尔森菌,4株菌为 Yersinia proxima,阿利克西奇耶尔森菌、马赛耶尔森菌、中间耶尔森菌及 Yersinia canariae各1株。16S rRNA基因多态性分析显示,全部菌株被聚类为3个大组,可区分小肠结肠炎耶尔森菌和其他耶尔森菌。51株小肠结肠炎耶尔森菌中,49株为毒力基因Ⅲ型(ail-、ystA-、ystB+、yadA-、virF-),2株为毒力基因Ⅱ型(ail+、ystA+、ystB-、yadA-、 virF-);8株其他耶尔森菌均为毒力基因Ⅳ型(ail-、ystA-、ystB-、yadA-、virF-)。K-mer分析可区分小肠结肠炎耶尔森菌和其他耶尔森菌,JS-XZ-2020001菌株与其他小肠结肠炎耶尔森菌距离较远,血清型为O8的小肠结肠炎耶尔森菌分布较集中。 结论:江苏省腹泻患者临床分离耶尔森菌以小肠结肠炎耶尔森菌为主,其他耶尔森菌少量并存,同时发现了 Yersinia proxima和 Yersinia canariae两个耶尔森菌新种型。小肠结肠炎耶尔森菌的毒力基因携带以Ⅲ型为主。16S rRNA基因多态性分析和K-mer分析均可有效区分小肠结肠炎耶尔森菌和其他耶尔�
- 周璐程晓庆段然仲慧祝雯雯鲍倡俊王鑫谈忠鸣
- 关键词:毒力基因
- 2012年江苏部分地区动物中发热伴血小板减少综合征病毒携带状况调查被引量:3
- 2015年
- 目的了解江苏部分地区动物中发热伴血小板减少综合征病毒(SFTSV)携带状况,探讨其可能的传播媒介和自然宿主。方法 2012年3月-12月在江苏省发现发热伴血小板减少综合征病例的7个市/县,采集鼠、牛、羊、刺猬、鸟类和蜱等动物标本,提取总核酸后,应用实时荧光RT-PCR法对标本进行布尼亚病毒S基因核酸的检测,阳性标本采用Vero细胞进行病毒分离。结果采集761只(管)动物,43只(管)检出SFTSV核酸阳性,阳性率为5.65%。采集3 728份标本,阳性49份,阳性率为1.31%。鼠的病毒携带率最高(6.84%),蜱标本阳性率最高(4.94%)。除蜱标本外的3 647份标本中检出阳性45份,阳性率为1.23%,不同器官阳性率分别为淋巴结(50.00%)、血清(2.34%)、脾(1.64%)、心(1.64%)、肝(1.28%)、肺(1.09%)、脑(0.94%)、肾(0.73%)、血块(0.41%)。5月标本阳性率最高(4.01%)。从1份羊血清及其体表1份蜱标本中各分离出1株SFTSV病毒。结论鼠、牛、羊和蜱均可携带SFTSV,可能是其自然宿主或传播媒介。
- 彭海燕崔岚崔仑标胡建利鲍倡俊李燕焦永军卞倩史智扬周明浩
- 关键词:实时荧光RT-PCR宿主媒介
- 江苏省狂犬病疾病负担研究被引量:2
- 2021年
- 目的通过对江苏省狂犬病的疾病负担进行统计分析和综合评价,为制定疾病防制策略提供参考依据。方法收集2008—2018年江苏省狂犬病疫情资料,进行流行病学特征分析,同时使用世界卫生组织(WHO)公布的计算工具评估因狂犬病早死导致的伤残调整寿命年(DALYs),并结合人力资本法评估早死间接经济负担。结果2008—2018年江苏省累计报告狂犬病病例565例,男女性别比为1∶0.42,所有病例中农民超过了73%;DALYs总损失为12318.22人年,年均损失1119.84人年;DALY强度为0.014人年/1000人;男性年均损失DALYs783.82人年,显著高于女性(t=2.984,P<0.05);45~59岁年龄组损失的DALYs居首位,约占总损失的35.15%;70~79岁年龄组DALY强度最高,为0.0219人年/1000人;江苏省每年因狂犬病死亡导致的间接经济负担为4929.29万元,其中45~59岁组所占比例最高。结论狂犬病主要负担人群为男性以及45~59岁年龄组人群,此外<15岁青少年儿童的负担也较大,应加强对此部分人群的关注,并制定相应防控对策。
- 王笑辰张楠周伟忠秦圆方李志锋胡建利鲍倡俊
- 关键词:狂犬病疾病负担伤残调整寿命年流行病学特征
- 基于微量中和试验的新冠感染者血清样本中和抗体高通量检测方法评价被引量:3
- 2022年
- 目的基于微量中和试验为金标准,评价两类三种高通量中和抗体检测方法的检测能力。方法以江苏省2020年以来发现的64例新冠病例为研究对象,采集早期和随访血清样本共117份开展中和抗体水平分析,用微量中和试验、假病毒中和抗体试验(PBNA)、竞争抑制试验[酶联免疫法(ELISA)和化学发光免疫法(CLIA)]别对血清样本进行测试,评价这些高通量中和抗体检测方法的相关系数及有效性的临界值等。结果新冠感染者假病毒中和抗体试验、酶联免疫法、化学发光免疫法相对于微量中和试验检测的相关系数分别为0.760、0.778和0.725,当微量中和试验的临界值取为1:10时(小于10为阴性),PBNA检测方法的Cutoff值为50时,ROC曲线下面积为0.901;ELISA检测方法的Cutoff值为1∶8时,ROC曲线下面积为0.934;CLIA检测方法的Cutoff值为1.28AU/ml时,ROC曲线下面积为0.838。结论建立的新冠病毒中和抗体高通量检测方法具有科学性和可行性,为新冠疫情常态化防控提供重要的技术手段。
- 孔筱筱张诗晗李志锋余慧燕邹鑫田华许可戴启刚陈银刘静娴郭宏雄郭喜玲鲍倡俊朱立国
- 关键词:微量中和试验中和抗体高通量
- 重组B亚单位/灭活菌体霍乱疫苗预防肠产毒性大肠埃希菌感染性腹泻专家共识
- 2023年
- 肠产毒性大肠埃希菌(ETEC)感染后表现为水样腹泻,严重者可致脱水、电解质失衡并导致死亡。重组B亚单位/灭活菌体霍乱(rBS/WC)疫苗是预防ETEC感染性腹泻的有效手段。国家儿童健康与疾病临床医学研究中心(浙江大学医学院附属儿童医院)和浙江省疾病预防控制中心组织国内临床医学、预防医学领域的专家参考有关病原学、流行病学、疫苗效果、安全性,以及卫生经济学等方面最新循证证据,制订了rBS/WC疫苗预防ETEC感染性腹泻的专家共识,指导临床医师和预防接种专业人员科学、规范接种疫苗,降低ETEC感染性腹泻的发病率。
- 季钗胡昱李明燕刘艳许玉洋俞骅沈建勇楼金玕周伟胡洁尹志英魏晶娇林君芬沈振宇缪梓萍李保东吴家兵李孝远许红梅欧剑鸣李琦向俊董琛易海华鲍倡俊郭世成闫绍宏刘莉莉寇增强常少英张少白郭翔祝小平张颖王邦茂曹曙光王培生赵智娴王达陈恩富
- 关键词:肠产毒性大肠埃希菌感染性腹泻
- 一起急性呼吸道感染症暴发疫情的病原学和流行病学研究被引量:4
- 2005年
- 目的:对一起急性呼吸道感染症暴发疫情进行流行病学和病原学研究,以明确诊断,控制疫情。方法:通过流行病学调查描述疫情流行特征;采用病例对照研究分析流行因素;患者的咽拭子标本中提取核酸;PCR法检测病毒特异性基因片段;组织培养法(Hep-2细胞)分离病毒;电子显微镜观察病毒形态;型特异血清及型特异引物鉴定分离毒株型别;中和实验检测患者急性期和恢复期血清抗体效价。结果:疫情报告病例871例,波及10个乡镇,主要为在校中小学及幼儿园学生(占94.37%),具有班级聚集性。病例对照研究显示危险因素为与病人的接触、与鸡接触及家庭内共用毛巾等。35份咽拭子标本分离出15株病毒,分离阳性率42.9%。分离病毒经鉴定为腺病毒3型。PCR法检测腺病毒DNA,112份咽拭子标本中68份阳性,阳性率60.7%。18例双份血清中13例中和效价呈4倍以上增长或转阳,阳性率72.2%。对病毒进行全基因序列测定,确定为腺病毒3型。结论:本起急性呼吸道感染症暴发疫情由腺病毒3型引起,传播途径以呼吸道传播和密切接触为主。
- 汪华倪大兴姜仁杰史智扬陈胤忠阮凌庭李显鲍倡俊蔡加平沈进进刘东林朱凤才胡晓舒
- 关键词:腺病毒急性呼吸道感染