许可 作品数:102 被引量:1,002 H指数:16 供职机构: 江苏省疾病预防控制中心 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 江苏省自然科学基金 江苏省高校自然科学研究项目 更多>> 相关领域: 医药卫生 农业科学 生物学 环境科学与工程 更多>>
江苏省首例人感染H9N2禽流感病毒分子溯源研究 被引量:5 2021年 目的近年来,H9N2亚型禽流感对人类健康的危害越来越受到关注。文中旨在对1例人感染H9N2禽流感病毒进行分子溯源研究。方法选取2019年3月18日江苏省疾病预防控制中心1份禽流感病毒感染患者的咽拭子标本及从患者住处附近的农贸市场采集禽类和外环境样本共40份。标本的流感病毒分型检测采用荧光定量PCR法,病毒分离采用SPF鸡胚,用特异性引物对病毒分离物进行全基因组测序,利用Blasts、ClustalX和Mega 6.1等软件进行序列比对和系统进化分析。结果标本中的病毒为A型H9N2亚型流感病毒。分子进化分析表明,4株病毒的HA和NA都属于H9N2禽流感Y280-like基因型。HA和NA进化树显示,人分离株和3株农贸市场分离病毒同处于一个进化分支上,遗传关系较近。HA蛋白的受体结合位点有4个氨基酸位点(包括I155T、H183N、A190T/V和Q226L)发生突变,增强了病毒对人类SAα2-6Gal受体的结合力。NA蛋白274(H→Y)位点没有发生突变。结论江苏省首例人感染H9N2禽流感病毒属于Y280-like基因型,对人类SAα2-6Gal受体的亲和力增加,跨种传播感染人的能力增强,病毒的进化值得关注。 邓斐 祁贤 余慧燕 王慎骄 许可 黄昊頔 鲍倡俊关键词:禽流感病毒 H9N2亚型 江苏省金坛市2006-2009年病毒性肝炎监测结果分析 目的 分析金坛市2006-2009年病毒性肝炎监测结果,为制定防治策略提供依据。方法 收集2006-2009年金坛市肝炎发病情况资料,并采用酶联免疫吸附试验对部分抽取病例进行病毒性肝炎分型复检,了解疫情报告诊断的准确性。... 田华 许可 朱凤才 汤奋扬 祖荣强 李亮 张雪峰 许云霞文献传递 网络资源链接 1例人感染H7N4禽流感病毒分子溯源研究 被引量:6 2018年 目的 对1例人感染H7 N4禽流感病毒进行分子诊断和溯源.方法 通过荧光定量PCR法对标本进行流感病毒分型检测.在下一代测序平台上对原始标本和病毒分离物进行全基因组测序,利用BLASTs、ClustalX和MEGA 6.1等软件进行序列比对和系统进化分析.结果 2018年1月检测到1例人感染H7 N4亚型禽流感病毒病例.从患者家养的鸡鸭中分离到7株高度同源的病毒.病毒是一种新的基因重配H7 N4亚型禽流感病毒,其8基因节段来源于欧亚大陆的野生水禽.病毒HA蛋白的裂解位点含有1个碱性氨基酸精氨酸(R),属于低致病性禽流感病毒.HA蛋白的受体结合位点226-228位氨基酸是谷氨酰胺-丝氨酸-甘氨酸(Q-S-G氨基酸排序按照H3亚型HA序列),保留了对禽类受体 α2-3半乳糖苷唾液酸(SAα2-3Gal)的结合活性.与禽分离病毒PB2蛋白627E不同,人病毒的PB2蛋白627位氨基酸为赖氨酸(K),增强了该病毒对人的适应力.结论 报道了一起人感染H7 N4禽流感病毒病例,揭示中国南方庭院式养殖模式为禽流感病毒的跨种传播提供了便利. 邓斐 彭杰夫 崔仑标 祁贤 王慎骄 余慧燕 许可 霍翔 鲍倡俊关键词:禽流感病毒 5岁以下婴幼儿病毒性腹泻的危险因素配对病例对照研究 被引量:6 2011年 目的:探讨5岁以下婴幼儿病毒性腹泻的危险因素。方法:采用性别、年龄匹配的1∶2配对病例对照研究,对江苏省徐州、镇江市县级医疗机构2007年10月至2008年10月收治的5岁以下腹泻儿童500例和对照儿童1 000例进行问卷调查,腹泻的病原体采用酶联免疫吸附剂测定(enzyme linked immunosorbent assay,ELISA)或反转录PCR(reverse transcription-PCR,RT-PCR)进行检测确认。数据采用Cox比例风险模型拟合Logistic回归。结果:单因素分析显示病毒性腹泻患儿的城乡差异、父母受教育程度、职业、家庭饮食卫生(包括厨房水池有无、菜刀板使用习惯、做饭人洗手习惯)、宠物饲养、接触动物、服用抗生素这些变量与病毒性腹泻的发生有统计学关联。未发现既往病史、轮状疫苗接种史等因素与病毒性腹泻的相关性。拟合多变量Logistic回归模型,厨房水池有无、菜刀板使用习惯、服用抗生素,其OR(95%CI)分别为0.340~0.852、0.295~0.705、2.153~6.227。结论:较差饮食卫生习惯、抗生素使用可能增加病毒性腹泻发生的危险性。 许可 霍翔 祖荣强 李亮 汤奋扬 朱凤才 羊海涛 汪华关键词:病毒性腹泻 病例对照 甲型H1N1流感重症病例的危险因素 被引量:5 2010年 目的:分析甲型H1N1流感患者发生重症临床表现的危险因素。方法:调查江苏省2009年6~12月间甲型H1N1流感确诊病例,利用统一设计的调查表收集信息,应用SAS9.1.3软件进行单因素和多因素非条件Logistic回归分析重症危险因素和风险比值比(OR值)。结果:单因素Logistic回归分析显示,年龄、发病与首次就诊时间间隔、体重指数(BMI)、妊娠和慢性基础性疾病史为导致重症的影响因素(P<0.01)。多因素Logistic回归分析显示,年龄、发病与首次就诊时间间隔、BMI和慢性基础性疾病史进入了最终模型(P<0.05),其中慢性基础性疾病史对模型贡献最大(标准化回归系数β=0.72),其他依次为年龄(β=0.43)、BMI(β=0.35)和发病与首次就诊时间间隔(β=0.25)。因素合并分析显示,发病风险随着危险因素数量的增加而增加,存在剂量效应关系(P<0.01)。结论:有慢性基础性疾病史、5岁以下儿童和年龄较大者、超重或肥胖者为甲型H1N1流感重症高危人群,感染甲型H1N1流感应尽量早期就诊,减少重症情况的发生。 汤奋扬 霍翔 李亮 祖荣强 许可 祁贤 吴斌 嵇红 朱凤才 羊海涛关键词:甲型H1N1流感 重症病例 IL-10基因多态性与江苏地区高危人群丙型肝炎病毒感染转归的关联研究 被引量:2 2012年 目的探讨江苏地区高危人群IL-10基因多态性与丙型肝炎病毒(Hcv)感染转归的关系。方法运用Taqman—MGB技术检测264例HCV自限感染者、371例HCV持续感染者和920例对照者的IL-10—819T/C、-592A/C、-1082A/G位点基因多态性。结果调整性别、年龄和高危人群种类混杂因素后,logistic回归分析显示3个位点的基因多态性分别与HCV感染转归无显著关联(P值均〉0.05)。进-步分层分析显示,-819T/C位点中,TC基因型使中年人、女性和有偿献血人群HCV自限感染的机会增加[调整OR值及其95%C1分别为2.160(1.163.4.011)、1.693(1.066~2.688)和4.084(1.743—9.570)],在有偿献血人群中使个体进展为持续感染的风险降低(调整OR=0-312,95%CI:0.130~0.747);CC基因型使血液透析人群HCV自限感染的机会增加(调整OR=2.120,95%CI:1.071~4.197),同时在有偿献血人群中使个体进展为持续感染的风险降低(调整OR=0.156,95%CI:0.043~0.566)。-592A/C位点中,AC基因型使中年人、女性和有偿献血人群HCV自限感染的机会显著增加[调整OR值及其95%C1分别为2.176(1.173,4.037)、1.659(1.055~2.607)和3.704(1.625-8.443)],在女性中增加了HCV持续感染的风险(调整OR=1.525,95%CI:1.017~2.286),在吸毒人群中使个体进展为持续感染的风险增加(调整OR=1.845和95%CI:1.122—3.034),而在有偿献血人群中使个体进展为持续感染的风险降低(调整OR=0.361,95%CI:0.155。0.841)。CC基因型增加了有偿献血人群HCV自限感染的机会,同时也使个体进展为持续感染的风险降低[调整OR值及其95%C1分别为3.125(1.016—9.605)和0.218(0.063~0.748)]。-1082A/G位点中,突变基因型AG/GG能增加有偿献血人群HCV自限感染的机会(调整OR=3.780,95%CI:1.620—8. 唐玲燕 王洁 喻荣彬 苏静 许可 彭志行 邓小昭 丁伟良 葛志军 张云关键词:丙型肝炎 白细胞介素-10 基因多态性 华东地区高致病性H5N6禽流感病毒血凝素蛋白分子特征分析 被引量:5 2021年 目的分析2017年以来中国华东地区高致病性H5N6禽流感病毒的HA基因分子特征。方法 H5N6核酸阳性标本采用9~11日龄鸡胚进行病毒分离,病毒基因测序采用下一代测序技术,相关的参考序列下载自GISAID或NCBI网站,序列比对和进化树构建采用ClustalX、Blasts及Mega 6.1等生物信息学软件。结果 2017年以来,在江苏省活禽市场和禽流感患者的标本中,成功分离出43株H5N6禽流感病毒,对33株病毒进行了基因组测序。选择其中的27株H5N6病毒的HA基因进行分子进化分析,clade 2.3.4.4h有20株,clade 2.3.4.4e有3株,另外4株归类于clade 2.3.4.4b;多个碱性氨基酸出现在病毒HA蛋白的裂解位点,是高致病性禽流感病毒的典型分子特征;HA蛋白受体结合位点的222和224位氨基酸分别是Q和G,具有结合禽类受体α2-3半乳糖苷唾液酸(SAα2-3Gal)的特性,158位点糖基化位点丢失,但新的糖基化位点出现在124位点上。结论 2017年HA基因clade 2.3.4.4h是我国华东地区H5N6病毒优势基因型,病毒处于持续动态进化中,需要继续对病毒进化进行监测。 程晓庆 祁贤 余慧燕 王慎骄 黄昊頔 许可 鲍倡俊关键词:高致病性禽流感病毒 血凝素 分子特征 新型冠状病毒Omicron变异株引起的续发率及影响因素研究 被引量:1 2023年 目的分析新型冠状病毒Omicron变异株引起的续发率(SAR)及影响因素。方法选取2022年2—4月江苏省本土社会面发现的新型冠状病毒Omicron变异株感染病例和密切接触者,纳入328例社会面原发病例和40 146名密切接触者,并将密切接触者中7 d集中隔离医学观察期间核酸检测结果转为阳性者定义为续发病例。收集人口学和临床特征等相关信息,采用多因素logistic回归模型分析SAR的影响因素。结果 328名原发病例共报告续发病例1 285例,SAR为3.2%(95%CI:3.0%~3.4%)。328例原发病例中,男性占61.9%(203例),年龄M(Q1,Q3)为38.5(27,51)岁;1 285例续发病例中,男性占59.1%(759例),年龄M(Q1,Q3)为34(17,52)岁。多因素logistic回归模型分析结果显示,原发病例为男性(OR=1.632,95%CI:1.418~1.877)、年龄20岁以下(OR=1.766,95%CI:1.506~2.072)和60岁及以上(OR=1.869,95%CI:1.476~2.365)、感染BA.2毒株分支(OR=2.906,95%CI:2.388~3.537)、病例分型是确诊普通型(OR=2.572,95%CI:2.036~3.249)和确诊轻型(OR=1.717,95%CI:1.486~1.985)的SAR风险更高;密切接触者年龄在20岁以下(OR=2.604,95%CI:2.250~3.015)和60岁及以上(OR=1.287,95%CI:1.052~1.573)、接触方式为同住接触(OR=27.854,95%CI:23.470~33.057)的SAR风险更高。结论 Omicron变异株原发病例性别、年龄、感染毒株分支、病例分型,以及密切接触者的年龄和接触方式是SAR的影响因素。 尚庆香 许可 戴启刚 黄昊頔 胡建利 邹鑫 陈立凌 魏叶 李海朋 甄茜 蔡伟 王寅 鲍倡俊关键词:新型冠状病毒 丙型肝炎病毒5′utr分型和C区基因分型结果的比较 被引量:1 2006年 目的比较丙型肝炎病毒(hepatitis C vims,HCV)不同基因分型方法的一致性。方法采用5′非编码区(NCR)型特异性引物分型法和核心区型特异性引物分型法分别对95例和其中的31例HCV RNA阳性患者的血清样本进行基因分型,分析不同分型方法的灵敏度和稳定性异同。结果两种分型方法的一致性达到93.5%,对于混合感染的发现能力C区分型较强,稳定性无差异。结论C区分型方法更加精确。 丁伟良 许可 邓小昭 喻荣彬 杨志贤 邵建伟 谈永飞 张云关键词:丙型肝炎病毒 核心区 基因分型 儿童手足口病影响因素病例对照研究 被引量:94 2011年 目的探讨儿童手足口病(hand-foot-mouth disease,HFMD)发生的影响因素。方法收集江苏省手足口病哨点监测医院手足口病临床病例396例,肠道病毒71型(enterovirus 71,EV71)感染的手足口病病例195例,分别进行1:1配对病例对照研究,应用SPSS 13.0软件进行单因素和多因素条件logistic回归分析。结果多因素条件Logis-tic回归分析表明,城乡(OR=1.999,95%CI=1.433~2.789)、家庭收入(OR=0.806,95%CI=0.692~0.938)、饭前便后洗手情况(OR=0.719,95%CI=0.590~0.877)、最近1周外出就餐情况(OR=1.914,95%CI=1.019~3.596)、最近1周接触患者史(OR=3.771,95%CI=2.137~6.654)为手足口病临床病例的影响因素;城乡(OR=2.417,95%CI=1.522~3.839)、饭前便后洗手情况(OR=0.693,95%CI=0.517~0.929)、近1周接触患者史(OR=3.942,95%CI=1.808~8.594)为EV71感染的手足口病影响因素。结论居住地为农村,最近1周患者接触史是手足口病发病的主要影响因素;饭前便后洗手是降低感染机会的保护因素。 李亮 许可 祁贤 史智扬 朱凤才 吴斌 霍翔 祖荣强 汤奋扬 汪华关键词:手足口病 肠道病毒71型 病例对照 影响因素