吴宽
- 作品数：9 被引量：42H指数：5
- 供职机构：西北农林科技大学植物保护学院更多>>
- 发文基金：高等学校学科创新引智计划国家大学生创新性实验计划项目国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- 猕猴桃病毒A和B在陕西省的分布、分子变异与基因组研究被引量：3
- 2020年
- 系统调查了中国陕西省猕猴桃主产区周至、眉县、杨凌和汉中‘徐香’、‘海沃德’、‘华优’和‘秦美’猕猴桃上猕猴桃病毒A(Ac VA)和猕猴桃病毒B(Ac VB)的带毒率和分布情况。结果表明,Ac VA和Ac VB在4个产区均有广泛地分布和较高的带毒率。其中,Ac VA和Ac VB分别在杨凌(36.7%)和眉县(36.9%)有最高的带毒率。按照品种划分,Ac VA(32.3%)和Ac VB(32.9%)均在‘徐香’品种上有最高的带毒率。通过高通量测序与分析获得了Ac VA和Ac VB的基因组序列,其分别由7654和7454个核苷酸组成,与之前报道的TP7-93A和TP7-93B分离物对应的同源率分别为82.7%和78.5%。Ac VA和Ac VB外壳蛋白基因系统发育树显示,2种病毒分成2个组,存在较大的分子变异。
- 赵磊张元乐黄倩茹侯彩婷吴宽曹孟籍王乔春吴云锋
- 关键词：猕猴桃基因组分子变异病毒检测
- 猕猴桃褪绿环斑相关病毒在陕西省的分布、分子变异及其2个分离物的基因组序列被引量：3
- 2020年
- 为明确我国陕西省猕猴桃主产区的徐香、海沃德、华优和秦美4个猕猴桃品种上的猕猴桃褪绿环斑相关病毒(Actinidia chlorotic ringspot-associated virus,AcCRaV)的分布情况,对采集自该省4个地区的493份样品进行AcCRaV检测,基于cp基因序列对获得的AcCRaV分离物进行分子变异分析,并采用高通量测序技术对其中2份样品进行转录组测序。结果显示:AcCRaV在陕西省猕猴桃上分布广泛,且检出率较高,其中周至县秦美猕猴桃上AcCRaV的检出率最高,为45.0%,在杨凌区秦美猕猴桃上AcCRaV的检出率最低,为10.0%。测定的23个AcCRaV分离物cp基因序列全长均为945 nt。系统发育树显示AcCRaV分离物共分成2个组,存在较大的分子变异。AcCRaV的cp基因分子变异与猕猴桃品种有一定关系,而与地理位置相关性不明显。获得了2个AcCRaV分离物ZZ1和ZZ2的基因组序列,RNA1长度分别为7049 nt和7274 nt,RNA2长度均为2266 nt,RNA3长度分别为1691 nt和1696 nt,RNA4长度分别为1736 nt和1683 nt,RNA5长度分别为1460 nt和1497 nt。分离物ZZ1和ZZ2的基因组序列与GenBank中唯一报道的我国湖北省AcCRaV分离物HN-6基因组序列比对中,分离物ZZ2与HN-6的RNA4同源率最高,为96.0%,分离物ZZ2与HN-6的RNA1同源率最低,为87.8%。表明AcCRaV在我国陕西省猕猴桃主产区分布较广泛,且其分子变异与猕猴桃品种有一定关系。
- 赵磊吴宽顾沛雯顾沛雯王乔春吴云锋
- 关键词：猕猴桃基因组分子变异
- 小麦蓝矮病植原体核糖体蛋白rpl22和rps3的生物信息学分析被引量：3
- 2010年
- 【目的】将生物信息学方法应用于小麦蓝矮病植原体(WBD)的分类研究,确定了小麦蓝矮病植原体的分类地位。【方法】应用植原体核糖体蛋白(rp)基因通用引物对rpF1/rpR1,对WBD进行PCR扩增并得到特异片段,对特异片段进行测定及同源性分析。【结果】序列测定结果表明,WBDrp基因片段长1 240 bp,包含部分rps19基因和全部的rpl22和rps3基因,且后2个基因为重叠基因,分别编码129和252个氨基酸,rpl22和rps3蛋白的等电点分别为12.605和11.755。【结论】WBD与16SrⅠ-C亚组中三叶草绿变病(Clover phyllody)的KVE、KVG、CPh株系亲缘关系最近,核苷酸同源性依次为99.7%,99.6%和99.0%,WBD与KVE株系的rpl22和rps3基因编码的氨基酸同源性分别为100%和98%,因此将小麦蓝矮病植原体划归到16SrⅠ-C亚组。
- 吴宽颜永杰李蓓武科科
- 关键词：小麦蓝矮病植原体生物信息学核糖体蛋白
- 陕西烟田主要病害种类调查与病毒分子检测被引量：8
- 2016年
- 为明确陕西烟田病害种类,于2013-2015年对陕西烟田病害开展系统调查,鉴定出9种病害,分别是赤星病、白粉病、黑胫病、灰霉病、青枯病、角斑病、野火病、根结线虫病和病毒病,其中,赤星病、白粉病、灰霉病、黑胫病和病毒病发病普遍,危害严重;野火病、青枯病、角斑病和线虫病仅在个别烟田发生。烟草感染病毒的种类包括烟草花叶病毒(TMV)、黄瓜花叶病毒(CMV)、马铃薯Y病毒(PVY)、烟草蚀纹病毒(TEV)和烟草脉带花叶病毒(TVBMV),其中,CMV、TMV、TEV和PVY检出率分别为23.6%、34.7%、21.3%和18.4%,TMV+CMV、CMV+TEV和CMV+PVY检出率分别为27.4%、24.9%和20.9%,烟田病毒复合感染普遍,造成损失较大。
- 吴宽陈伟成巨龙康振生
- 关键词：赤星病黑胫病花叶病毒病
- 陕西马铃薯卷叶病病原的分子生物学鉴定被引量：8
- 2010年
- 【目的】对陕西榆林疑似感染马铃薯卷叶病毒(Potato leafroll virus,PLRV)的病株毒源进行分子生物学鉴定,为陕西省马铃薯卷叶病的防治提供参考。【方法】根据GenBank数据库已报道的马铃薯卷叶病毒外壳蛋白(Coat protein,CP)基因序列设计了1对引物,利用RT-PCR技术成功扩增了陕西PLRV.CP基因,然后进行克隆、测序,并与GenBank中已报道的27个PLRV分离物的CP基因进行同源性分析。【结果】获得的陕西PLRV.CP基因大小为627 bp,含有1个ORF,编码208个氨基酸的多肽,其与已报道的27个国内外PLRV.CP高度同源。【结论】陕西榆林的疑似病株确定为感染PLRV的马铃薯病株。
- 颜永杰吴宽谢海峰高云芳
- 关键词：马铃薯卷叶病毒RT-PCR分子生物学鉴定
- 马铃薯卷叶病毒陕西分离物外壳蛋白(CP)的生物信息学分析被引量：4
- 2010年
- 目的分析预测马铃薯卷叶病毒(PLRV)外壳蛋白的理化性质及结构。方法应用DNA-MAN软件、ExPASy中的ProtParam工具,SignalP,LipoP程序,TMHMM,PSIPRED和3D-PSSM等方法,分析PLRV.CP的核苷酸基本特征、蛋白质理化性质、亲疏水性、可溶性、信号肽、跨膜结构域、二级结构、保守区域、三级结构等。结果陕西PLRV.CP,与已报道的PLRV.CP高度同源。蛋白序列分析显示无跨膜螺旋结构,不属分泌蛋白,是可溶的亲水性蛋白。二级结构主要为折叠和无规则卷曲,不含转角。三级结构保守区预测表明,该蛋白属于黄化病毒属外壳蛋白成员。结论对马铃薯卷叶病毒外壳蛋白的生物信息学分析为进一步研究其功能、探索抗病途径奠定了基础。
- 颜永杰吴宽张珏高云芳谢海峰
- 关键词：马铃薯卷叶病毒外壳蛋白生物信息学
- 苹果锈果类病毒陕西秦冠分离物的鉴定与序列分析被引量：5
- 2016年
- 陕西省是我国苹果种植大省,苹果锈果病的发生严重影响其苹果产业,该病是由苹果锈果类病毒（Apple scar skin viroid,ASSVd）引起的,陈炜和田波（1985）首次在国内发现了ASSVd的RNA,Hashimoto＆Koganezawa（1987）首次报道了ASSVd的全基因组序列。
- 吴宽赵磊孙丽英郝兴安康振生吴云锋
- 关键词：分离物秦冠全基因组序列果类
- 泡桐丛枝植原体Sec分泌蛋白转运系统3个亚基基因的克隆及蛋白特性分析被引量：7
- 2009年
- 采用PCR方法扩增Sec分泌蛋白转运系统3个亚基基因,并进行了生物信息学分析。通过SWISS-MODEL同源建模与3D-PSSM折叠子识别法构建蛋白质的三维结构,并通过PROCHECK程序验证构建的三维结构的可靠性。首次从泡桐丛枝(PaWB)植原体基因组中分离出Sec分泌蛋白转运系统3个亚基基因,各基因全长依次为2 508、1 242 bp和411 bp,分别编码835、204个及136个氨基酸的蛋白。SecA、SecY和SecE均为脂溶性稳定蛋白,SecA无明显跨膜区,SecY和SecE分别含有10个和3个明显的疏水跨膜区。二级结构主要为螺旋,其次为折叠和无规则卷曲,没有转角。构建的三维结构符合立体化学原则。泡桐丛枝(PaWB)植原体中存在的Sec分泌蛋白转运系统作为最主要的运输途径,可能直接转运菌体蛋白如毒素等直接到寄主细胞质中或介体昆虫细胞中,引起寄主病症。研究植原体的Sec蛋白转运系统对于了解植原体的致病机理及预防这类病害的发生提供了理论依据。
- 岳红妮吴宽吴云锋张珏孙润红
- 关键词：SECA生物信息学
- 西北旱区枣疯病植原体核糖体蛋白基因的生物信息学分析被引量：6
- 2010年
- 枣疯病是枣树上的一种具有毁灭性的植原体病害,几乎分布于国内所有的枣树栽培区,造成了巨大的经济损失。对我国陕西、宁夏、甘肃3省枣疯病样品植原体核糖体蛋白基因进行克隆和测序,获得枣疯病植原体的核糖体基因片段为1 196bp,包含部分rps19,rpl22和rps3三个基因,其中rpl22和rps3大小分别354bp和753bp,分别编码118和251个氨基酸,且这两个基因为非重叠基因。序列同源性比较结果表明:我国陕西、宁夏、甘肃的枣疯病植原体的核糖体蛋白rp基因大小一致,归属于植原体16SrⅤ-B组;该植原体核糖体蛋白基因特性与樱桃致死黄化(CLY5)和桃树黄化印度分离株系(PY-In)植原体相似。首次报道了我国枣疯病核糖体蛋白基因rp基因的序列,把枣疯病植原体归到16SrⅤ-B组,为枣疯病植原体提供了新的分类依据。
- 吴宽颜永杰王海妮张珏
- 关键词：核糖体蛋白基因生物信息学
