刘宇
- 作品数：6 被引量：7H指数：2
- 供职机构：东北农业大学动物科学技术学院更多>>
- 发文基金：国家现代农业产业技术体系建设项目博士后研究人员落户黑龙江科研启动基金公益性行业(农业)科研专项更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 家鸽及边鸡的MC1R基因片段的克隆及分析被引量：2
- 2015年
- 为了研究黑素皮质素受体1(MC1R)基因与家鸡、家鸽羽色的相关关系,根据Gen Bank上原鸡MC1R基因序列,利用在线引物设计软件Primer3(V.0.4.0)在编码区设计1对引物PE,试验以家鸽和边鸡DNA为模板,PCR扩增,测序,分别获得长度为303 bp和335 bp的基因片段。结果表明:家鸽与原鸡MC1R基因核苷酸序列存在10处变异,边鸡与原鸡存在3处变异,其序列相似性分别为95.71%、99.10%。二级结构分析结果表明,家鸽和边鸡α螺旋、β折叠、无规则卷曲所占比例分别为47.92%、31.25%、20.83%,64.80%、21.90%、13.30%,均有2个跨膜区。针对2个物种氨基酸序列同源与变异预测其三级结构,结果表明,MC1R基因可能是表达禽类羽色的主效基因。
- 刘宇张桂贤王雪娇崔丽君王烨陈天直刘伟
- 关键词：家鸽边鸡PCR
- 禽类MC1R基因的生物信息学分析被引量：2
- 2015年
- 控制动物黑色素合成的黑素皮质素1型受体(melanocortin 1receptor,MC1R)基因被认为是影响禽类羽色的主要候选基因之一。以NCBI数据库上发表的家鸡、日本鹌鹑等17个动物种类(15种禽类)MC1R的mRNA序列及氨基酸序列为基础进行生物信息学分析,包括蛋白质基本理化性质分析、信号肽预测、磷酸化位点预测、跨膜区结构预测、高级结构预测、序列比对及系统树构建。结果表明:17个物种,尤其是15种禽类,MC1R蛋白质理化性质及结构非常相似,它们都属于跨膜蛋白,无信号肽和N端糖基化位点。但它们之间仍存在差别,如等电点、吸光系数、脂溶指数和总平均疏水系数等。三级结构的明显差异,主要表现在跨膜区连接处。由构建的系统树可知,17个物种中15种禽类分属一类,小鼠与斑马鱼明显与之不同。在15种禽类中,9种雁形目动物为一类,5种鸡形目动物为一类,朱鹮单独成为一类。此结果为进一步研究MC1R基因的生物学功能奠定了基础。
- 王雪娇张桂贤崔丽君王烨刘宇刘伟
- 关键词：MC1R基因分子进化鸡形目雁形目鹳形目
- 鸡形目黑素皮质素受体1基因多态性研究被引量：2
- 2014年
- 为了对已知的鸡形目禽类黑素皮质素受体1 （MC1R）基因进行生物信息学和分子进化分析,根据已发表的12种鸡形目物种MC1R基因序列（包括棕色来航鸡、红色原鸡、土佐本地鸡、日系乌骨鸡、白色来航鸡、日本鹌鹑、火鸡、蓝胸鹑、珠鸡、朝鲜鹌鹑、河北柴鸡和略阳乌鸡）,利用多种生物学软件进行遗传多态性研究.结果显示：12种鸡形目物种MC1R基因编码区碱基序列同源性和氨基酸序列同源性均较高（分别为98.84％,98.91％）,蛋白质二级结构相似度极高,以α构螺旋为主（57.32％ ～67.83％）,无规则卷曲次之（25.80％ ～ 29.62％）,β-折叠最少（6.05％～15.61％）.红色原鸡、土佐本地鸡和棕色来航鸡的二级结构组成相同,其中红色原鸡和土佐本地鸡的碱基CDS序列完全相同.分子进化分析发现,12个鸡形目物种可以明显地分为A、B、C3个类群,火鸡、珠鸡、鹌鹑、蓝胸鹑、棕色来航鸡、红色原鸡和土佐本地鸡聚为A群;河北柴鸡、朝鲜鹌鹑和日系乌骨鸡聚为B群;白色来航鸡和略阳乌鸡聚为C群.火鸡较其他鸡形目起源较早,棕色来航鸡,白色来航鸡和略阳乌鸡起源较迟.但聚类结果中白色来航鸡和棕色来航鸡却属于不同类群,这可能是由于MC1R基因参与家禽羽色的调控,而白色来航鸡和棕色来航鸡羽毛色素存在明显差异,从而造成了二者在鸡形目MC1R基因分子进化树中的遗传距离较远.
- 崔丽君张桂贤王雪娇王烨刘宇刘伟
- 关键词：MC1R基因系统树分子进化鸡形目
- 肾上腺素对猪季节性基因表达的影响被引量：3
- 2017年
- 选用部分具有季节性表达的基因,探讨肾上腺素对这些基因mRNA表达量的影响。(1)将猪肾细胞(PK15)分别置于含有100,250,500,750,1 000 nmol/L肾上腺素的培养基中培养6 h,实时荧光定量PCR(qRT-PCR)检测ADRβ2、ARNTL、CLOCK、IL-6R、NR3C1、VDR的mRNA表达量的变化。结果表明:1 000 nmol/L肾上腺素处理PK15细胞时,与对照组相比ADRβ2、IL-6R的mRNA表达量明显升高,差异极显著(P<0.01);VDR的mRNA表达量降低,差异极显著(P<0.01);CLOCK、NR3C1、ARNTL的mRNA表达量无明显变化。(2)选择1 000 nmol/L的肾上腺素分别处理PK15细胞6,12,24,36,48 h。qRT-PCR检测ADRβ2的mRNA表达量变化。结果表明:与对照组相比,培养12 h时ADRβ2的mRNA表达量达到1.6倍,差异极显著(P<0.01),随着培养时间延长,ADRβ2的mRNA表达量逐渐降低,36 h时降到最低,为对照组的0.4倍,差异显著(P<0.05)。这说明肾上腺素对部分季节周期性变化的基因具有调节作用,季节变化产生应激时可以通过肾上腺素影响ADRβ2、IL-6R、VDR的表达,从而影响机体功能。
- 刘宇马红汪亮刘娣
- 关键词：肾上腺素实时荧光定量冷应激
- GPR143在绵羊皮肤组织中的表达及定位分析被引量：1
- 2016年
- G蛋白偶联受体143(G-protein coupled receptor143,GPR143)在黑素体的生物合成中起重要作用,本文旨在研究GPR143基因在不同毛色绵羊皮肤组织中的差异表达及定位,探索GPR143基因与毛色形成的相关性。通过q RT-PCR方法和免疫印迹方法分别检测不同毛色绵羊皮肤组织中GPR143基因m RNA水平和蛋白水平的表达差异;运用免疫荧光法对不同毛色绵羊皮肤组织中的GPR143基因进行定位并对结果进行光密度值分析。q RT-PCR结果显示,GPR143基因在黑色绵羊皮肤组织中m RNA相对表达量为白色绵羊的7.84倍,二者差异极显著(P<0.01);免疫印迹结果显示,黑色绵羊皮肤组织中GPR143蛋白表达量是白色绵羊的1.3倍,二者差异显著(P<0.05)。免疫荧光结果显示,GPR143蛋白的主要表达部位为绵羊皮肤组织毛囊外根鞘和表皮层,经光密度值分析后发现,GPR143在黑色绵羊皮肤毛囊外根鞘和表皮层的表达量显著高于白色绵羊。本研究结果表明不同毛色绵羊皮肤组织均能表达GPR143基因,但黑色绵羊皮肤组织中该基因的m RNA和蛋白水平都显著高于白色绵羊,说明GPR143的m RNA和蛋白在黑色绵羊皮肤组织中表达上调,在白色绵羊皮肤组织中表达下调。GPR143基因可能通过调控MITF水平和黑素体的数量、大小、运动和成熟进而参与绵羊毛色的形成过程。
- 陈天直赵兵令刘宇赵园园王海东范瑞文王鹏超董常生
- 关键词：绵羊毛色QRT-PCR免疫印迹免疫荧光
- 孔雀与鹌鹑MC1R基因片段的鉴定及序列分析
- 2014年
- 探讨了孔雀、鹌鹑黑素皮质素受体1(melanocortin 1-receptor,MC1R)基因序列与禽类羽色的相关性。根据GenBank上原鸡的MC1R基因序列,利用在线引物设计软件Primer3在编码区设计引物PE。以孔雀和鹌鹑DNA为模板进行PCR扩增及测序,分别获得长度约为350 bp的基因片段。经比对发现,孔雀与原鸡的相似性为95.47%,有16处突变,3处缺失;鹌鹑与原鸡的相似性为97.70%,有8处突变,1处缺失。对其氨基酸序列进行蛋白质二级结构预测,结果显示,孔雀与鹌鹑α螺旋、β折叠、无规则卷曲所占比例分别为59.48%,2.59%,37.93%和58.62%,1.82%,39.66%。表明MC1R基因可能是表达禽类羽色的主效基因。
- 刘伟张桂贤王雪娇崔丽君王烨刘宇
- 关键词：孔雀鹌鹑
