王烨
- 作品数：4 被引量：3H指数：2
- 供职机构：山西农业大学动物科技学院更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 鸡形目黑素皮质素受体1基因多态性研究被引量：2
- 2014年
- 为了对已知的鸡形目禽类黑素皮质素受体1 （MC1R）基因进行生物信息学和分子进化分析,根据已发表的12种鸡形目物种MC1R基因序列（包括棕色来航鸡、红色原鸡、土佐本地鸡、日系乌骨鸡、白色来航鸡、日本鹌鹑、火鸡、蓝胸鹑、珠鸡、朝鲜鹌鹑、河北柴鸡和略阳乌鸡）,利用多种生物学软件进行遗传多态性研究.结果显示：12种鸡形目物种MC1R基因编码区碱基序列同源性和氨基酸序列同源性均较高（分别为98.84％,98.91％）,蛋白质二级结构相似度极高,以α构螺旋为主（57.32％ ～67.83％）,无规则卷曲次之（25.80％ ～ 29.62％）,β-折叠最少（6.05％～15.61％）.红色原鸡、土佐本地鸡和棕色来航鸡的二级结构组成相同,其中红色原鸡和土佐本地鸡的碱基CDS序列完全相同.分子进化分析发现,12个鸡形目物种可以明显地分为A、B、C3个类群,火鸡、珠鸡、鹌鹑、蓝胸鹑、棕色来航鸡、红色原鸡和土佐本地鸡聚为A群;河北柴鸡、朝鲜鹌鹑和日系乌骨鸡聚为B群;白色来航鸡和略阳乌鸡聚为C群.火鸡较其他鸡形目起源较早,棕色来航鸡,白色来航鸡和略阳乌鸡起源较迟.但聚类结果中白色来航鸡和棕色来航鸡却属于不同类群,这可能是由于MC1R基因参与家禽羽色的调控,而白色来航鸡和棕色来航鸡羽毛色素存在明显差异,从而造成了二者在鸡形目MC1R基因分子进化树中的遗传距离较远.
- 崔丽君张桂贤王雪娇王烨刘宇刘伟
- 关键词：MC1R基因系统树分子进化鸡形目
- 禽类MC1R基因的生物信息学分析被引量：2
- 2015年
- 控制动物黑色素合成的黑素皮质素1型受体(melanocortin 1receptor,MC1R)基因被认为是影响禽类羽色的主要候选基因之一。以NCBI数据库上发表的家鸡、日本鹌鹑等17个动物种类(15种禽类)MC1R的mRNA序列及氨基酸序列为基础进行生物信息学分析,包括蛋白质基本理化性质分析、信号肽预测、磷酸化位点预测、跨膜区结构预测、高级结构预测、序列比对及系统树构建。结果表明:17个物种,尤其是15种禽类,MC1R蛋白质理化性质及结构非常相似,它们都属于跨膜蛋白,无信号肽和N端糖基化位点。但它们之间仍存在差别,如等电点、吸光系数、脂溶指数和总平均疏水系数等。三级结构的明显差异,主要表现在跨膜区连接处。由构建的系统树可知,17个物种中15种禽类分属一类,小鼠与斑马鱼明显与之不同。在15种禽类中,9种雁形目动物为一类,5种鸡形目动物为一类,朱鹮单独成为一类。此结果为进一步研究MC1R基因的生物学功能奠定了基础。
- 王雪娇张桂贤崔丽君王烨刘宇刘伟
- 关键词：MC1R基因分子进化鸡形目雁形目鹳形目
- 家鸽及边鸡的MC1R基因片段的克隆及分析被引量：2
- 2015年
- 为了研究黑素皮质素受体1(MC1R)基因与家鸡、家鸽羽色的相关关系,根据Gen Bank上原鸡MC1R基因序列,利用在线引物设计软件Primer3(V.0.4.0)在编码区设计1对引物PE,试验以家鸽和边鸡DNA为模板,PCR扩增,测序,分别获得长度为303 bp和335 bp的基因片段。结果表明:家鸽与原鸡MC1R基因核苷酸序列存在10处变异,边鸡与原鸡存在3处变异,其序列相似性分别为95.71%、99.10%。二级结构分析结果表明,家鸽和边鸡α螺旋、β折叠、无规则卷曲所占比例分别为47.92%、31.25%、20.83%,64.80%、21.90%、13.30%,均有2个跨膜区。针对2个物种氨基酸序列同源与变异预测其三级结构,结果表明,MC1R基因可能是表达禽类羽色的主效基因。
- 刘宇张桂贤王雪娇崔丽君王烨陈天直刘伟
- 关键词：家鸽边鸡PCR
- 孔雀与鹌鹑MC1R基因片段的鉴定及序列分析
- 2014年
- 探讨了孔雀、鹌鹑黑素皮质素受体1(melanocortin 1-receptor,MC1R)基因序列与禽类羽色的相关性。根据GenBank上原鸡的MC1R基因序列,利用在线引物设计软件Primer3在编码区设计引物PE。以孔雀和鹌鹑DNA为模板进行PCR扩增及测序,分别获得长度约为350 bp的基因片段。经比对发现,孔雀与原鸡的相似性为95.47%,有16处突变,3处缺失;鹌鹑与原鸡的相似性为97.70%,有8处突变,1处缺失。对其氨基酸序列进行蛋白质二级结构预测,结果显示,孔雀与鹌鹑α螺旋、β折叠、无规则卷曲所占比例分别为59.48%,2.59%,37.93%和58.62%,1.82%,39.66%。表明MC1R基因可能是表达禽类羽色的主效基因。
- 刘伟张桂贤王雪娇崔丽君王烨刘宇
- 关键词：孔雀鹌鹑
