林涛
- 作品数:6 被引量:32H指数:4
- 供职机构:广州市儿童医院更多>>
- 相关领域:医药卫生更多>>
- 诺如病毒广州株全基因组序列测定及分析被引量:8
- 2007年
- 目的 探讨广州地区儿童感染的诺如病毒基因组分子结构特点和基因组类型。方法 参考GenBank上的诺如病毒MD145-12基因组设计分段扩增引物,进行RT-PCR分段扩增诺如病毒基因组,克隆于T载体上,测定序列,用Clustal W/X、DNAStar、RAT(recombination analysis tool)等软件分析基因组序列。结果 诺如病毒NVgz01全基因组为7558bp,提交到C,enBank上的序列号为DQ369797,3’端非编码区末端长45bp,病毒基因组有3个开放阅读框(ORF),ORF1长5100bp(5~5104nt),ORF2基因长1623bp,位于基因组中5085~6707nt之间,ORF3基因长807bp(6707~7513nt),其中ORF1、ORF2两基因有19个核苷酸的重叠区;NVgz01全基因组核苷酸序列与GenBank上诺如GI组Norwalk68、Southampto、BS5、Chiba、WUG1的同源相似性在43%~44%之间,与GⅡ组MD145、Farmington Hills、B4S5、Hawaii、Lordsdale、SaitamaU1、Mc37同源相似性在76%~90%之间。NVgz01的ORF1与Mc37核苷酸序列同源性为94%,但ORF2与Mc37的同源性只有65%;NVgz01的ORF2与Fannillgton Hills(AY502023)同源性为最高(94%),ORF1的同源性为88%。结论广州地区儿童腹泻感染的诺如病毒NVgz01株全基因组序列为7558bp,GenBank序列号为DQ369797,NVgz01与诺如病毒的GⅡ组同源性较高,确认NVgz01株属于诺如病毒GⅡ组;根据ORF1、ORF2的同源性差异和RAT程序分析初步认为NVgz01可能是重组病毒。
- 曾其毅钟家禹李潇苏嫌莉朱冰陈翊林涛肖密丝盛慧英周荣龚四堂
- 关键词:诺如病毒基因组同源重组
- 271例儿童染色体异常核型分析及其与疾病关系被引量:4
- 2005年
- 对临床诊断有精神运动发育迟缓、脑瘫、先天畸形、特殊面容、智力低下、身材矮小、外生殖器异常等1125例患儿进行了外周血淋巴细胞染色体G显带检查,检出染色体异常核型271例。检出率为24·1%。其中常染色体数目异常197例,常染色体结构异常42例,性染色体数目异常17例,性染色体结构异常15例。检出异常核型尤以21三体为主。提示染色体异常与儿童智力低下及发育异常有密切关系,21三体综合征(Down′ssyndrome)仍是最常见染色体病,有效控制及预防染色体病的发生对提高人口素质十分必要。
- 蔡燕娜邓华林涛夏健清
- 关键词:染色体异常智力低下发育异常
- 广州市23019名儿童血铅水平调查被引量:12
- 2006年
- 目的 了解广州市儿童的血铅水平。方法 用原子吸收光谱法检测体检儿童血铅值。结果 23019名体检儿童的血铅平均水平为52μg/L,铅中毒率5.43%,男童铅中毒率5.44%,女童铅中毒率4.22%。3岁以下儿童血铅水平与3岁以上年龄组有差异,3岁以上年龄组之间无差异;血铅值随年龄增长而升高,8岁以上儿童血铅值有所下降。结论 广州市地区儿童铅中毒率较低,男女血铅值有差异,7~8岁儿童的血铅值最高。
- 林涛李颖能邝间玲谭志荣
- 关键词:儿童血铅铅中毒
- 广州检出星状病毒4型的全基因组序列测定及分析被引量:4
- 2006年
- 目的探讨广州地区儿童感染的星状病毒基因组分子结构特点和基因型。方法参考GenBank上的星状病毒基因组设计分段扩增引物,进行RT-PCR分段扩增星状病毒基因组,克隆于T载体上,序列测定,用Clustal W和DNAStar软件分析基因组序列。结果星状病毒HASTVgz01全基因组为6721bp,提交到GenBank上的序列号为DQ344027,其中5′端非编码区(5′UTR)长82bp,3′端非编码区末端长81bp,病毒基因组编码区全长6558个核苷酸,分别编码ORF1a、ORF1b、ORF2,ORF1a基因长2763bp(83~2845nt),ORF1b基因长1557bp(2785~4332nt),其中ORF1a、ORF1b两基因有71个核苷酸的重叠区;ORF2全长2316nt,位于基因组中4325~6640nt。ASTVgz01与GenBank中8种基因型星状病毒的ORF2基因氨基酸序列同源性比较发现,HASTVgz01与4型的同源性为93%,其他的同源性在61%~70%之间。结论广州地区儿童腹泻感染的星状病毒HASTVgz01全基因组为6721 bp,GenBank序列号为DQ344027,HASTVgz01与4型星状病毒的ORb2基因氨基酸序列比较同源性为最高,确认HASTVgz01是4型星状病毒。
- 朱冰钟家禹李潇陈翊林涛吴灶和周荣龚四堂
- 关键词:星状病毒基因组
- 广州地区2007年4238例急性呼吸道感染婴幼儿中人副流感病毒1~3型的研究被引量:5
- 2009年
- 人副流感病毒(HPIV)1-3型在婴幼儿中主要引起下呼吸道感染,是引起气管炎和肺炎的重要病原体。实时荧光PCR检测是公认的核酸分子定性和定量检测的标准方法,本研究建立了实时荧光PCR检测HPIV 1~3型的方法,并对2007年广州地区的4238例急性呼吸道感染患儿的临床标本进行检测。
- 陈翊钟家禹林涛朱冰连广琬陈焕辉周荣
- 关键词:副流感病毒呼吸道感染婴幼儿
- 儿童乙肝血清标志物模式与病毒含量的关系
- 2006年
- 目的探讨儿童乙肝DNA与抗原抗体模式及ALT,AST的关系。方法检测血清DNA,抗原抗体,ALT,AST。结果共检出11种的血清标志物模式,HBsAg和HBeAg阳性的HBVDNA阳性率为94.6%,平均含量为106.88±1.14/ml,明显高于其他模式。HBVDNA水平与ALT,AST高低无相关性。结论儿童乙肝患者HBsAg和HBeAg均为阳性模式HBV载量显著高于HBeAg阴性模式。HBeAg阴性模式少数人HBV载量较高。乙肝病毒量的多少并不影响肝功能受损的程度。
- 陈焕辉陈翊朱冰林涛刘云峰
- 关键词:乙肝病毒血清标志物模式聚合酶链反应