公共文化服务平台

李艳芸: 作品数：23 被引量：44H指数：4; 供职机构：天津医科大学更多>>; 发文基金：天津市高等学校科技发展基金计划项目天津市自然科学基金国家自然科学基金更多>>; 相关领域：医药卫生生物学更多>>

合作作者

联合多种高通量表达谱数据分析筛选胃癌相关基因的研究: 目的:挖掘胃癌与正常组织间差异表达基因,寻找潜在的诊断与治疗价值的基因标志。方法:分别应用CAGP中 EST和SAGE数据库筛查胃癌和正常组织差异表达基因,用虚拟电子杂交方法对候选基因进行进一步筛选,并同SMD中胃组织基...; 邢军赵林胜李艳芸李燕妮张维铭; 关键词：胃肿瘤表达序列标签基因表达系列分析微阵列; 文献传递

宫颈癌易感基因HLA-DQA1编码区SNPs的筛选和分析被引量：1: 2006年; 背景与目的:人类白细胞抗原(humanleukocyteantigen,HLA)基因多态性的差异在宫颈癌发病过程中发挥重要作用,本研究用生物信息学的方法筛选宫颈癌易感基因HLA-DQA1编码区的单核苷酸多态性(singlenucleotidepolymorphisms,SNPs),并对其多态性的变异所引发的氨基酸变化是否会导致基因的功能异常进行筛选和分析。方法:使用SNPper软件从公共数据库dbSNP获得HLA-DQA1编码区的SNPs数据,在dbSNP数据库获取相应的FASTA序列,使用PARSESNP软件进行筛选和分析。结果:在HLA-DQA1基因的编码区发现2个SNPs(rs9272693和rs9272703),其单核苷酸的变化会引发错义突变,PSSMDifference大于10,预测该突变为有害突变。结论:建立的生物信息学方法可以对基因编码区的SNPs进行分析,在众多的SNPs中搜寻出序列保守区的变异,并给出评价标准,但是所得结果需要在宫颈癌患者与对照人群中进行实验验证。; 李艳芸邢军赵林胜李燕妮王玉川张维铭; 关键词：宫颈肿瘤人类白细胞抗原

利用生物信息学方法筛选一组胃癌相关EST特征序列被引量：2: 2004年; 目的 :以生物信息学为研究方法 ,利用互联网基因组资源 ,对一组胃癌相关差异显示逆转录聚合酶链式反应方法获得的差异表达片段进行序列分析。方法 :使用BLAST软件 ,将所得到的6条序列与EST数据库和基因组数据库进行比对分析 ,以期获得序列的特征信息 ,并筛选出有意义的EST序列。结果 :显示有3条序列与非编码区长散布核元件LINE区域匹配 ;1条序列与CD9的外显子同源 ;1条为新的EST序列 ,已提交EST数据库并获得序列登陆号 ;1条序列尚须通过基因识别的方法进一步证实其特性。结论 :通过生物信息学方法快速筛选获得胃癌相关已知EST序列1条 ,获得1条新EST序列。; 邢军徐垚刘文天郑洁李艳芸; 关键词：EST 生物信息学

含有MS4A7基因启动子的荧光素酶报告基因质粒的构建及意义被引量：1: 2011年; 目的构建含有人4次跨膜监视蛋白A(MS4A)基因启动子的萤火虫荧光素酶报告基因质粒。方法用PCR方法扩增获得含有人MS4A7基因启动子的DNA片段,将其连接至TA克隆质粒后转移至虫荧光素酶质粒pGL3-basic中,得到pGL3-MS4A7-Promoter重组质粒;经限制性内切酶酶切、PCR及测序鉴定得到确认;将该质粒转染进入HL-60细胞,并检测细胞中虫荧光素酶的活性。结果 pGL3-MS4A7-Promoter重组质粒插入片段和相邻序列正确,克隆的MS4A7基因片段有启动子活性。结论成功构建了pGL3-MS4A7-Promoter报告基因质粒,为进一步研究MS4A7基因的表达调控奠定了基础。; 王瑜李艳芸李海东张维铭; 关键词：启动子虫荧光素酶

上皮钙粘蛋白基因甲基化在胃癌中的研究被引量：2: 2006年; 目的:研究胃癌组织中上皮钙粘蛋白(E-CD)基因启动子区5'CpG岛甲基化状况,揭示胃癌发生、发展过程中的分子水平变化和可能作用机制。方法:应用甲基化特异性PCR检测41例胃癌手术标本及同一病例正常胃黏膜组织中E-CD基因启动子区5'CpG岛甲基化水平。结果:E-CD基因启动子区甲基化阳性率在胃癌中显著高于正常胃黏膜,与胃癌的分型、细胞分化程度、胃壁浸润深度、淋巴结转移、TNM分期明显相关。结论:E-CD基因启动子区甲基化水平可作为较早期预测胃癌浸润、转移程度,评价预后的有效指标。; 王栋耿鑫李艳芸焦焕利朱国平张维铭; 关键词：胃癌上皮钙粘蛋白甲基化特异性PCR

子宫颈癌HLA—DRB1基因型的初步研究被引量：4: 2009年; 宫颈癌是严重危害妇女健康的一种疾病，世界上每年大约有50万例新增病例。现已明确，宫颈癌是一种与人乳头状瘤病毒（HPV）感染明确相关的肿瘤，90％以上的宫颈癌组织HPV呈阳性。近年来，众多宫颈癌易感基因的研究表明，除环境与生活方式等外界因素外，宿主的免疫学和遗传背景与宫颈癌的发生密切相关。多种证据表明，; 杨桂芳李艳芸贾艳菊邢军李燕妮王玉川张维铭; 关键词：DRB1 基因型人乳头状瘤病毒宫颈癌组织妇女健康易感基因

胃癌相关基因EST片段的筛选与gcI基因克隆: 2005年; 目的:结合生物信息学手段和实验途径研究mRNA差异显示方法得到的胃癌相关差异表达基因片段的特性。方法:mRNA差异显示技术筛选出的9条胃癌相关基因EST片段,通过国际互联网基因组数据库资源,分别使用BLAST软件将所得到的序列与EST数据库和基因组数据库进行比对分析,获得胃癌表达基因片段的特征信息。应用5'RACE方法延伸序列I,BioEdit软件对延伸的序列进行ORF分析,Northern印迹检测其在各种胃组织中的表达。结果:3条序列与已知基因序列同源,1条序列与CD98A的外显子同源,1条与SPTAN1同源,1条与RPS24同源;显示有3条序列与非编码区长散布核元件LINE区域匹配;3条为新的EST序列,其中1条获得cDNA全长序列,具有完整的读码框,编码120个氨基酸,命名为gcI,定位于染色体10q21-22。Northern验证gcI在胃癌组织中表达上调。结论:利用生物信息学方法对胃癌差异显示序列进行筛选,筛选出3条序列与已知基因同源;3条序列为新EST。对其中1条克隆全长序列,它可能参与了胃癌的发病过程。; 邢军赵林胜徐垚刘文天李艳芸张维铭; 关键词：胃癌 EST 生物信息学基因克隆

新生大鼠缺氧缺血性脑损伤COX-2mRNA表达变化: 2003年; 研究新生大鼠缺氧缺血性脑损伤(HIBD)时环氧合酶-2(COX-2)mRNA的表达变化,应用、制备新生大鼠左脑HIBD的模型。用逆转录多聚酶链反应(RT-PRC)检测HIBD后6 h、24h、48h、5d不同时点脑皮层COX-2 mRNA的表达情况。经凝胶成像及分析系统扫描RT-PCR产物,用内参半定量分析COX-2 mRNA的动态变化。结果显示:七日龄Wistar大鼠对照组即有COX-2 mRNA的低表达,HIBD 6h表达开始升高,HIBD 24～48h为表达高峰(与对照组相比有显著性差异,P<0.01),HIBD 5d表达下降。结论:新生大鼠HIBD可诱导COX-2基因表达,其可能参与HIBD后的神经毒性损伤。; 李艳芸初桂兰程佶; 关键词：新生大鼠新生儿缺氧缺血性脑损伤 COX-2 逆转录多聚酶链反应

HLA-DQB1* 03基因与宫颈上皮内瘤样病变及宫颈癌的相关性研究被引量：4: 2008年; 采用酚—氯仿—异戊醇法从宫颈上皮内瘤样病变(CIN)、宫颈癌患者及正常对照者的外周静脉血提取DNA,采取序列特异性引物的聚合酶链式反应法分离人白细扁抗原(HLA)-DQB1*03基因各亚型。发现DQB1*0301、0302、0303亚型的频率在CIN、宫颈癌组较正常组明显增高;在CIN组和宫颈癌组内,DQB1*0301、0303亚型的频率较高。认为HLA-DQB1*03基因亚型与CIN及宫颈癌的发生有关。; 吴海霞李艳芸耿鑫王玉川李悦国张维铭; 关键词：宫颈上皮内瘤样病变子宫肿瘤

运用生物信息学策略对宫颈癌易感基因HLA-DRB1编码区SNPs的筛选和验证: 2010年; 目的:用生物信息学的方法筛选宫颈癌易感基因HLA-DRB1编码区的单核苷酸多态性(coding single nucleo-tide polymorphisms,cSNPs)位点,并对其多态性的变异是否会导致基因的功能异常进行分析和验证。方法:以dbSNP数据库的SNPs为来源,使用专业软件对HLA-DRB1基因编码区的SNPs进行评价和分析,然后对候选SNPs位点在病例对照组中验证。结果:在HLA-DRB1基因的编码区发现3个SNPs(rs1059582、rs1059576、rs1059586)的变化会引发错义突变,PSSM Differ-ence值(接近或大于10)较高,预测该SNPs为有害突变。其中rs1059586在宫颈癌组中的基因型分布与对照组不同,差异有统计学意义(P=0.029)。结论:生物信息学与病例对照研究相结合研究复杂疾病相关SNPs位点简便、经济、高效,对研究遗传标记与复杂性疾病的关系有重要意义。; 李艳芸杨桂芳贾艳菊邢军李燕妮王玉川张维铭; 关键词：生物信息学宫颈癌人类白细胞相关抗原

李艳芸

合作作者

文献类型

领域

主题

机构

作者

传媒

年份

用户反馈

李艳芸

合作作者

文献类型

领域

主题

机构

作者

传媒

年份

用户登录

用户反馈