邢军 作品数:21 被引量:41 H指数:4 供职机构: 天津医科大学 更多>> 发文基金: 天津市自然科学基金 天津市高等学校科技发展基金计划项目 更多>> 相关领域: 医药卫生 生物学 机械工程 文化科学 更多>>
胃癌相关基因gcI的克隆及其功能预测 被引量:4 2005年 目的:应用生物信息学平台对胃癌相关基因表达片段进行cDNA全长克隆及序列分析和蛋白功能预测。方法:选用人胃癌、癌前病变及正常胃粘膜组织经mRNA差异显示技术筛选获得的差异表达片段,对所获得的1条功能未知基因表达片段“I”,利用5'cDNA末端快速扩增方法扩增全长cDNA,结合Northern杂交印迹方法进行验证分析;利用NCBI、EMBL数据库资源分析其编码氨基酸的生物学特征以及预测其编码蛋白的功能。结果:扩增得到序列I的全长cDNA,命名为gcI。分析显示gcI含有2个跨膜区,定位于胞膜;含有3个蛋白激酶C磷酸化位点和3个N端豆蔻酰化作用位点。结论:克隆的胃癌相关基因表达全长序列gcI、编码与信号转导有关的跨膜蛋白,可能是参与胃癌发生过程中的相关基因。 邢军 徐垚 刘文天 赵林胜 张维铭关键词:胃癌基因 数据库搜索 基因克隆 子宫颈癌HLA—DRB1基因型的初步研究 被引量:4 2009年 宫颈癌是严重危害妇女健康的一种疾病,世界上每年大约有50万例新增病例。现已明确,宫颈癌是一种与人乳头状瘤病毒(HPV)感染明确相关的肿瘤,90%以上的宫颈癌组织HPV呈阳性。近年来,众多宫颈癌易感基因的研究表明,除环境与生活方式等外界因素外,宿主的免疫学和遗传背景与宫颈癌的发生密切相关。多种证据表明, 杨桂芳 李艳芸 贾艳菊 邢军 李燕妮 王玉川 张维铭关键词:DRB1 基因型 人乳头状瘤病毒 宫颈癌组织 妇女健康 易感基因 胃癌相关基因EST序列的生物信息学分析 目的:应用生物信息学平台对胃癌相关基因表达片段进行筛选、克隆及序列的生物特征分析和蛋白预测.以期寻找和发现新的胃癌发生过程中的相关基因,为探讨胃癌发生的分子机制及其基因水平的诊断和治疗提供标志和依据.方法:选用人胃癌、癌... 邢军关键词:胃癌基因 EST 数据库搜索 文献传递 宫颈癌易感基因HLA-DQA1编码区SNPs的筛选和分析 被引量:1 2006年 背景与目的:人类白细胞抗原(humanleukocyteantigen,HLA)基因多态性的差异在宫颈癌发病过程中发挥重要作用,本研究用生物信息学的方法筛选宫颈癌易感基因HLA-DQA1编码区的单核苷酸多态性(singlenucleotidepolymorphisms,SNPs),并对其多态性的变异所引发的氨基酸变化是否会导致基因的功能异常进行筛选和分析。方法:使用SNPper软件从公共数据库dbSNP获得HLA-DQA1编码区的SNPs数据,在dbSNP数据库获取相应的FASTA序列,使用PARSESNP软件进行筛选和分析。结果:在HLA-DQA1基因的编码区发现2个SNPs(rs9272693和rs9272703),其单核苷酸的变化会引发错义突变,PSSMDifference大于10,预测该突变为有害突变。结论:建立的生物信息学方法可以对基因编码区的SNPs进行分析,在众多的SNPs中搜寻出序列保守区的变异,并给出评价标准,但是所得结果需要在宫颈癌患者与对照人群中进行实验验证。 李艳芸 邢军 赵林胜 李燕妮 王玉川 张维铭关键词:宫颈肿瘤 人类白细胞抗原 利用生物信息学方法筛选一组胃癌相关EST特征序列 被引量:2 2004年 目的 :以生物信息学为研究方法 ,利用互联网基因组资源 ,对一组胃癌相关差异显示逆转录聚合酶链式反应方法获得的差异表达片段进行序列分析。方法 :使用BLAST软件 ,将所得到的6条序列与EST数据库和基因组数据库进行比对分析 ,以期获得序列的特征信息 ,并筛选出有意义的EST序列。结果 :显示有3条序列与非编码区长散布核元件LINE区域匹配 ;1条序列与CD9的外显子同源 ;1条为新的EST序列 ,已提交EST数据库并获得序列登陆号 ;1条序列尚须通过基因识别的方法进一步证实其特性。结论 :通过生物信息学方法快速筛选获得胃癌相关已知EST序列1条 ,获得1条新EST序列 。 邢军 徐垚 刘文天 郑洁 李艳芸关键词:EST 生物信息学 运用生物信息学策略对宫颈癌易感基因HLA-DRB1编码区SNPs的筛选和验证 2010年 目的:用生物信息学的方法筛选宫颈癌易感基因HLA-DRB1编码区的单核苷酸多态性(coding single nucleo-tide polymorphisms,cSNPs)位点,并对其多态性的变异是否会导致基因的功能异常进行分析和验证。方法:以dbSNP数据库的SNPs为来源,使用专业软件对HLA-DRB1基因编码区的SNPs进行评价和分析,然后对候选SNPs位点在病例对照组中验证。结果:在HLA-DRB1基因的编码区发现3个SNPs(rs1059582、rs1059576、rs1059586)的变化会引发错义突变,PSSM Differ-ence值(接近或大于10)较高,预测该SNPs为有害突变。其中rs1059586在宫颈癌组中的基因型分布与对照组不同,差异有统计学意义(P=0.029)。结论:生物信息学与病例对照研究相结合研究复杂疾病相关SNPs位点简便、经济、高效,对研究遗传标记与复杂性疾病的关系有重要意义。 李艳芸 杨桂芳 贾艳菊 邢军 李燕妮 王玉川 张维铭关键词:生物信息学 宫颈癌 人类白细胞相关抗原 胃癌微卫星不稳定性和hMSH2基因表达的研究 被引量:8 2002年 目的 通过研究胃癌及其癌前病变中微卫星不稳定性与错配修复基因hMSH2蛋白表达 ,来揭示微卫星不稳定性在胃癌演化过程中可能作用机制 ,并探讨导致胃癌中微卫星不稳定性的基因机制。方法 用PCR方法检测 5个微卫星位点MSI表现 ;并通过免疫组化SP法检测hMLH1、hMSH2错配修复蛋白的表达。结果 胃癌组、慢性胃炎组中MSI的阳性率分别为 5 8 82 %(30 5 1) ,2 1 0 5 %(12 5 7)。肠型胃癌与弥漫型胃癌的MSI阳性率间差别有显著性意义 (P <0 0 5 )。在所有标本中仅检测到 1例hMSH2表达缺失 ,异常表达的病例为胃乳头状腺癌。结论 MSI在散发性胃癌的发生及发展过程中均起到了一定作用 ,hMLH1启动子区异常甲基化是导致胃癌MSI的重要因素。 徐垚 杨秀颖 邢军 耿鑫 张维铭关键词:胃癌 微卫星不稳定性 癌前病变 错配修复基因 联合多种高通量表达谱数据分析筛选胃癌相关基因的研究 目的:挖掘胃癌与正常组织间差异表达基因,寻找潜在的诊断与治疗价值的基因标志。方法:分别应用CAGP中 EST和SAGE数据库筛查胃癌和正常组织差异表达基因,用虚拟电子杂交方法对候选基因进行进一步筛选,并同SMD中胃组织基... 邢军 赵林胜 李艳芸 李燕妮 张维铭关键词:胃肿瘤 表达序列标签 基因表达系列分析 微阵列 文献传递 SAHA对人宫颈癌细胞化放疗增敏作用的研究 目的:观察组蛋白去乙酰化酶抑制剂SAHA(suberoylanilide hydrox amic acid)联合顺铂或X射线照射后人宫颈癌SiHa细胞生长抑制、细胞凋亡、细胞集落形成率等情况,探讨SAHA对宫颈癌细胞化疗... 邢军关键词:SIHA细胞 宫颈癌 低剂量氦氖激光对LTEP-A_2细胞生长的影响 1995年 激光应用在医学领域已有多年,现已证实氦氖激光对人纤维母细胞、鼠肾上皮细胞的生长有刺激和抑制作用。本研究是用激光对体外培养的人肺腺癌细胞系LTEP-A_2细胞进行照射实验,测定细胞活性指标,观察不同剂量的激光对细胞代谢、增殖水平的影响。 邢军 梅玫 张维铭 高全生关键词:肺腺癌细胞系 氦氖激光 激光疗法