李琬
- 作品数:23 被引量:33H指数:4
- 供职机构:哈尔滨医科大学更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金黑龙江省自然科学基金黑龙江省高等教育教学改革工程项目更多>>
- 相关领域:医药卫生生物学文化科学自动化与计算机技术更多>>
- 基于人类信号转导网络与Toll样受体信号通路挖掘心血管疾病风险基因被引量:1
- 2014年
- 目的挖掘潜在的心血管疾病风险基因,为疾病的预防、诊断和治疗提供一定的参考。方法根据人类信号转导网络、心血管疾病相关的Toll样受体信号通路以及相关的表达谱信息,以网络motif及其包含的基因为研究对象,采用基因芯片显著性分析、网络motif筛选以及基因功能富集分析等方法对候选基因进行分析。结果经分析得到21个潜在的心血管疾病风险基因,有12个为已知心血管疾病风险基因。结论对所发现的潜在心血管疾病风险基因进行研究,以阐明心血管疾病发病机制有重要的生物学意义。
- 侯敏徐松杜悠雯黄昊李琬陈丽娜
- 关键词:心血管疾病TOLL样受体信号转导网络
- 人类信号网络中癌相关中心性motif的识别及功能研究
- 研究表明,信号转导或生物学通路的缺陷或错误可以引起癌症的发生。这些细胞信号通路彼此之间通过多种方式相互作用,形成了信号网络。网络motif是一种具有功能特性的显著常出现的网络构件,在信号网络中能够反映出信号转导的模式。揭...
- 李琬
- 关键词:中心性CROSS-TALK癌症
- 基于整合网络和联合策略预测心肌梗死的新致病基因被引量:1
- 2013年
- 目的:基于整合网络和联合策略预测心肌梗死的新致病基因。方法:从系统生物学的角度,提出基于蛋白质亚细胞定位信息,构建区域化的蛋白质互作的整合网络;通过疾病风险基因与已知致病基因的功能一致性程度和互作相关性的强度联合筛选的新策略,预测心肌梗死的新致病基因。结果:预测出10个心肌梗死的新致病基因(CCL19、CCL25、COMP、CCL11、CCL7、F2、KLKB1、HTR6、ADRB1、BDKRB2),其中8个基因(CCL19、CCL25、CCL11、CCL7、F2、KLKB1、ADRB1、BDKRB2)经文献证实与心肌梗死的发生发展有着密切的联系;另外2个基因(COMP、HTR6)尚需实验验证。结论:基于整合网络和联合策略预测出10个心肌梗死的新致病基因,此方法为探索复疾病的致病基因提供了新的思路,有助于阐明复杂疾病的致病机理。
- 吕亚娜陈丽娜徐晋李琬苗正强曲晓莉张思雅李为国贾婿冯陈晨何月涵黄昊侯敏
- 关键词:心肌梗死蛋白质互作网络
- 整合冠心病风险SNPs功能及分子网络特征筛选疾病易感基因
- 2016年
- 目的:冠心病(Coronary Heart Disease,CHD)是一种由多因素(遗传因素、环境因素以及它们之间的相互作用)引起的复杂疾病。本文从遗传因素和分子互作模式识别新的冠心病易感基因。方法:结合冠心病群体遗传SNPs数据和PPI数据,通过群体遗传数据的风险评估、功能SNPs的判定和PPI网络基因的分类,以功能SNPs属性、网络拓扑属性和基因功能属性为特征,利用两步分类的方法筛选新的冠心病易感基因。结果:获得了69个新的冠心病易感基因,其中43个被文献证实与冠心病的发生发展密切相关,且识别的新的易感基因注释的KEGG通路中有很多是已知的易感基因所没有注释到的,如MAPK signaling pathway,Calcium signaling pathway,Focal adhesion和Chemokine signaling pathway等,其中Chemokine signaling pathway被证实是CHD发展的关键通路。结论:应用本文提出的整合筛选策略,能识别与冠心病相关的新的易感基因,可为冠心病的预防、诊断和治疗提供新的研究方向。
- 周艳艳朱莉娜谢瑞强姜晶陈彬彬史宇晨李琬何月涵黄昊李怡然陈丽娜
- 关键词:PPI网络易感基因
- 基于共表达网络研究巨噬细胞在动脉硬化中的作用
- 2015年
- 目的探讨巨噬细胞在动脉粥样硬化形成和发展中的作用机理。方法从GEO数据库中下载一组人类冠状动脉粥样硬化(AS)的单核细胞转录组基因表达谱数据。通过Bicor相关方法分别构建基于正常和疾病样本差异基因共表达网络,用ClusterOne挖掘疾病候选功能模块后进行富集分析,对模块之间重叠度及功能富集情况进行分析。结果在疾病和正常网络中分别得到3个功能相关模块,共富集到11个功能类,从正常到疾病状态中模块间基因存在差异,富集到的功能类也存在差异。结论不同模块中基因的突变、凋亡、磷酸化和去磷酸化等在巨噬细胞致AS过程中起着重要作用。
- 赵宏群张一骅李琬何月涵吕俊杰黄昊陈丽娜
- 关键词:动脉粥样硬化巨噬细胞
- 基于人类信号网络和表达谱数据挖掘动脉粥样硬化相关模块被引量:1
- 2015年
- 目的:动脉粥样硬化是一种高致死率的慢性炎症疾病,其发生和发展的机制尚不明确。本文基于人类信号网络和基因表达谱数据对动脉粥样硬化相关模块进行挖掘,以探究其在疾病发生发展中的作用机制。方法:结合人类信号网络和基因表达谱数据,设计显著差异模块筛选策略,通过功能分析,挖掘动脉粥样硬化相关模块,对动脉粥样硬化的致病机制进行研究。结果:基于网络模块的平均表达值改变量,采用两种随机方法,进行显著差异模块筛选,最终获得8个动脉粥样硬化相关的显著差异模块。结论:应用本文提出的整合筛选策略,能识别与动脉粥样硬化相关的模块,获得潜在的致病基因,并从外周血的基因表达改变来探究动脉粥样硬化致病机制,这对动脉粥样硬化的诊断、治疗以及发生发展机制的研究具有重要意义。
- 黄昊杜悠雯谢瑞强侯敏冯陈晨李琬陈丽娜
- 关键词:动脉粥样硬化基因表达谱
- 基于创新型人才培养的Python语言程序设计教学方法探讨--以生物医学工程专业为例被引量:1
- 2023年
- 生物医学工程是一门理工医相结合的交叉学科,在多领域发挥着重要作用。如何培养适应数字化时代的创新型生物医学工程专业人才,已引起人们普遍关注。Python语言程序设计是生物医学工程专业的必修课程,改进该课程的教学方法,采用参与式、TRIZ理论、案例教学方法,重视实验应用,可以提升课程教学质量,培养生物医学工程专业学生进行生物医学大数据分析所需的科学素养,激发学生的创新思维,增强学生的创新能力和解决实际问题的能力。
- 李琬陈丽娜何月涵吕俊杰
- 关键词:生物医学工程参与式TRIZ理论
- PBL教学模式在结构生物信息学教学中的应用
- 2019年
- 结构生物信息学是一门新兴的交叉学科,涉及数学、生物化学、生物物理学等多个领域,综合了诸多学科的知识于一体,主要是应用生物信息学方法,配合生物化学和分子生物学方法,进行生物大分子结构数据获取和分析,研究生物大分子结构与功能。
- 李琬
- 关键词:PBL教学模式科学世界观发散性思维
- 基于创新型人才培养的“医用高等数学”教学方法探讨被引量:3
- 2021年
- “医用高等数学”是医学高等院校设置的公共基础课,对培养医学生的创新思维和创新能力具有基础性和先导性地位,有着其他学科无法替代的作用。文章基于“医用高等数学”的学科特点及教学现状,探讨在“医用高等数学”教学中运用启发式教学法、PBL教学模式、TRIZ理论等方式方法,提升教学效果,从而实现创新型医学人才培养的目标。
- 李琬陈丽娜何月涵
- 关键词:创新型人才启发式教学法PBL教学模式TRIZ理论
- 医学生创新思维培养新探被引量:5
- 2012年
- 医学生创新思维培养日益引起人们的关注,各种高论见仁见智。应充分认识创新思维的内涵及医学生创新思维的特点,着重从确立科学世界观,掌握科学方法论;树立解放思想,勇于探索观念;善学善思,在继承中不断"否定"和超越等方面培养医学生创新思维。
- 李琬
- 关键词:创新思维