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基于人类信号网络和表达谱数据挖掘动脉粥样硬化相关模块被引量：1: 2015年; 目的:动脉粥样硬化是一种高致死率的慢性炎症疾病,其发生和发展的机制尚不明确。本文基于人类信号网络和基因表达谱数据对动脉粥样硬化相关模块进行挖掘,以探究其在疾病发生发展中的作用机制。方法:结合人类信号网络和基因表达谱数据,设计显著差异模块筛选策略,通过功能分析,挖掘动脉粥样硬化相关模块,对动脉粥样硬化的致病机制进行研究。结果:基于网络模块的平均表达值改变量,采用两种随机方法,进行显著差异模块筛选,最终获得8个动脉粥样硬化相关的显著差异模块。结论:应用本文提出的整合筛选策略,能识别与动脉粥样硬化相关的模块,获得潜在的致病基因,并从外周血的基因表达改变来探究动脉粥样硬化致病机制,这对动脉粥样硬化的诊断、治疗以及发生发展机制的研究具有重要意义。; 黄昊杜悠雯谢瑞强侯敏冯陈晨李琬陈丽娜; 关键词：动脉粥样硬化基因表达谱

基于整合网络和联合策略预测心肌梗死的新致病基因被引量：1: 2013年; 目的:基于整合网络和联合策略预测心肌梗死的新致病基因。方法:从系统生物学的角度,提出基于蛋白质亚细胞定位信息,构建区域化的蛋白质互作的整合网络;通过疾病风险基因与已知致病基因的功能一致性程度和互作相关性的强度联合筛选的新策略,预测心肌梗死的新致病基因。结果:预测出10个心肌梗死的新致病基因(CCL19、CCL25、COMP、CCL11、CCL7、F2、KLKB1、HTR6、ADRB1、BDKRB2),其中8个基因(CCL19、CCL25、CCL11、CCL7、F2、KLKB1、ADRB1、BDKRB2)经文献证实与心肌梗死的发生发展有着密切的联系;另外2个基因(COMP、HTR6)尚需实验验证。结论:基于整合网络和联合策略预测出10个心肌梗死的新致病基因,此方法为探索复疾病的致病基因提供了新的思路,有助于阐明复杂疾病的致病机理。; 吕亚娜陈丽娜徐晋李琬苗正强曲晓莉张思雅李为国贾婿冯陈晨何月涵黄昊侯敏; 关键词：心肌梗死蛋白质互作网络

基于人类信号网络和表达谱数据研究静脉血栓复发机制: 2015年; 目的:静脉血栓是一种高复发风险和高致死率的疾病,其形成和复发的分子机制尚不明确。基于人类信号网络和基因表达谱数据可针对静脉血栓经华法令抗凝治疗后的复发机制进行研究。方法:结合表达谱数据和人类信号网络,设计差异模块筛选策略,通过功能分析、差异表达分析和已知血栓相关基因及药物靶基因的互作关联研究,获得与静脉血栓复发相关的显著差异模块。结果:最终获得8个与静脉血栓复发密切相关的显著差异模块,评估了华法令治疗静脉血栓的效能,提出了联合用药的3种可能途径。结论:应用本文提出的整合筛选策略,能识别与静脉血栓复发相关的模块,探究静脉血栓复发的分子机制和评估华法令的治疗效能。还提供了潜在的联合用药途径,这对治愈血栓、防治血栓复发及复发机制的研究具有重要意义。; 张思雅周艳艳谢瑞强曲晓莉史宇晨吕亚娜贾婿冯陈晨李琬何月涵黄昊侯敏陈丽娜; 关键词：静脉血栓华法令

基于人类信号转导网络与Toll样受体信号通路挖掘心血管疾病风险基因被引量：1: 2014年; 目的挖掘潜在的心血管疾病风险基因，为疾病的预防、诊断和治疗提供一定的参考。方法根据人类信号转导网络、心血管疾病相关的Toll样受体信号通路以及相关的表达谱信息，以网络motif及其包含的基因为研究对象，采用基因芯片显著性分析、网络motif筛选以及基因功能富集分析等方法对候选基因进行分析。结果经分析得到21个潜在的心血管疾病风险基因，有12个为已知心血管疾病风险基因。结论对所发现的潜在心血管疾病风险基因进行研究，以阐明心血管疾病发病机制有重要的生物学意义。; 侯敏徐松杜悠雯黄昊李琬陈丽娜; 关键词：心血管疾病 TOLL样受体信号转导网络

雷帕霉素对人视网膜色素上皮细胞增殖和凋亡的影响: 目的：研究雷帕霉素(rapamycin，RAPA)对体外培养的人视网膜色素上皮细胞(human retinal pigment epithelium cells，HRPECs)增殖和凋亡的影响。　　方法：HRPECs...; 侯敏; 关键词：人视网膜色素上皮细胞雷帕霉素细胞凋亡

基于人类信号网络和表达谱数据挖掘动脉粥样硬化相关模块: 目的：动脉粥样硬化是一种高致死率的慢性炎症疾病，其发生和发展的机制尚不明确。基于人类信号网络和基因表达谱数据对动脉粥样硬化相关模块进行挖掘，以探究其在疾病发生发展中的作用机制。方法：结合人类信号网络和基因表达谱数据，设计...; 黄昊杜悠雯谢瑞强侯敏冯陈晨李琬陈丽娜

基于SNP互作识别类风湿性关节炎的潜在致病基因被引量：5: 2015年; 目的探讨单核苷酸多态性(SNP)间的上位作用对类风湿性关节炎产生的影响。方法依据人类基因,复杂疾病相关信号通路,以及人类蛋白质互作网络识别3个不同层面互作的SNP对。采用Logistic回归模型来检测互作SNP与疾病的显著相关性。结果分析疾病相关SNP对,获得34个潜在的类风湿性关节炎疾病风险基因,其中5个为类风湿性关节炎已知疾病基因,16个已有文献证实为疾病风险基因。结论通过对SNP间上位效应的研究可获得类风湿性关节炎新的潜在疾病基因。; 李怡然周艳艳黄昊侯敏朱莉娜李琬陈丽娜; 关键词：类风湿性关节炎单核苷酸多态性全基因组关联研究

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侯敏